More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2142 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1907  ketol-acid reductoisomerase  94.07 
 
 
339 aa  665    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.022886  hitchhiker  0.0000179587 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2142  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
340 aa  702    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0716485  normal  0.0660754 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  67.88 
 
 
338 aa  474  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  66.67 
 
 
338 aa  466  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  67.99 
 
 
338 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  66.67 
 
 
338 aa  462  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  66.06 
 
 
336 aa  462  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  67.99 
 
 
338 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  67.99 
 
 
338 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  66.97 
 
 
338 aa  456  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  66.16 
 
 
338 aa  455  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  66.87 
 
 
338 aa  457  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  66.77 
 
 
338 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  65.35 
 
 
338 aa  453  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  67.27 
 
 
338 aa  451  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1490  ketol-acid reductoisomerase  64.76 
 
 
339 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  64.16 
 
 
339 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  64.63 
 
 
331 aa  441  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  63.03 
 
 
338 aa  443  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  63.72 
 
 
338 aa  441  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2518  ketol-acid reductoisomerase  66.07 
 
 
338 aa  443  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0329  ketol-acid reductoisomerase  63.55 
 
 
339 aa  442  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0285  ketol-acid reductoisomerase  63.55 
 
 
339 aa  442  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.772607  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1061  ketol-acid reductoisomerase  64.02 
 
 
338 aa  442  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2319  ketol-acid reductoisomerase  64.02 
 
 
338 aa  441  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  65.05 
 
 
339 aa  444  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  65.35 
 
 
339 aa  443  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  64.02 
 
 
338 aa  442  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3416  ketol-acid reductoisomerase  62.65 
 
 
339 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0812  ketol-acid reductoisomerase  64.02 
 
 
338 aa  439  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  64.33 
 
 
333 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0361  ketol-acid reductoisomerase  63.25 
 
 
339 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3341  ketol-acid reductoisomerase  63.33 
 
 
339 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.764687  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  63.33 
 
 
339 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2102  ketol-acid reductoisomerase  63.03 
 
 
339 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3110  ketol-acid reductoisomerase  63.41 
 
 
338 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090046  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2775  ketol-acid reductoisomerase  62.84 
 
 
338 aa  441  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.987552  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  63.41 
 
 
338 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2466  ketol-acid reductoisomerase  62.84 
 
 
339 aa  436  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498417  normal  0.4902 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2501  ketol-acid reductoisomerase  62.2 
 
 
338 aa  435  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000349706  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6082  ketol-acid reductoisomerase  62.42 
 
 
339 aa  435  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  64.53 
 
 
327 aa  434  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2121  ketol-acid reductoisomerase  62.5 
 
 
338 aa  435  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  63.72 
 
 
338 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2303  ketol-acid reductoisomerase  61.93 
 
 
340 aa  435  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  63.11 
 
 
338 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  62.24 
 
 
338 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2559  ketol-acid reductoisomerase  66.36 
 
 
339 aa  434  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  62.24 
 
 
338 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  63.41 
 
 
338 aa  433  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2418  ketol-acid reductoisomerase  63.53 
 
 
339 aa  431  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1989  ketol-acid reductoisomerase  62.24 
 
 
338 aa  432  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2341  ketol-acid reductoisomerase  61.52 
 
 
339 aa  432  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  65.85 
 
 
331 aa  431  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  63.75 
 
 
339 aa  432  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3248  ketol-acid reductoisomerase  62.12 
 
 
339 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167766  normal  0.961188 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2720  ketol-acid reductoisomerase  61.82 
 
 
339 aa  434  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194376  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42500  ketol-acid reductoisomerase  61.63 
 
 
338 aa  431  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  62.61 
 
 
330 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1951  ketol-acid reductoisomerase  62.2 
 
 
338 aa  431  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1780  ketol-acid reductoisomerase  61.52 
 
 
338 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  63.64 
 
 
331 aa  429  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1771  ketol-acid reductoisomerase  62.2 
 
 
338 aa  431  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.09387  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2103  ketol-acid reductoisomerase  63.94 
 
 
338 aa  429  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.124469 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1276  ketol-acid reductoisomerase  64.94 
 
 
338 aa  424  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1846  ketol-acid reductoisomerase  64.94 
 
 
338 aa  424  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11584  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3073  ketol-acid reductoisomerase  61.4 
 
 
338 aa  426  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0071293 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0398  ketol-acid reductoisomerase  64.94 
 
 
338 aa  424  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.422239  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1421  ketol-acid reductoisomerase  64.94 
 
 
338 aa  424  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  64.33 
 
 
331 aa  425  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1283  ketol-acid reductoisomerase  64.94 
 
 
338 aa  424  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0504  ketol-acid reductoisomerase  59.52 
 
 
338 aa  424  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000262639  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0751  ketol-acid reductoisomerase  64.94 
 
 
338 aa  424  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2857  ketol-acid reductoisomerase  62.95 
 
 
339 aa  425  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.658942  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  63.83 
 
 
331 aa  424  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1747  ketol-acid reductoisomerase  61.28 
 
 
347 aa  426  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.322981 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1115  ketol-acid reductoisomerase  64.94 
 
 
338 aa  424  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2891  ketol-acid reductoisomerase  63.33 
 
 
338 aa  425  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0051674 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1581  ketol-acid reductoisomerase  61.21 
 
 
340 aa  426  1e-118  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1781  ketol-acid reductoisomerase  63.22 
 
 
339 aa  425  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  62.24 
 
 
331 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  64.65 
 
 
330 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3381  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 
339 aa  422  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0636  ketol-acid reductoisomerase  60.61 
 
 
338 aa  423  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1047  ketol-acid reductoisomerase  64.63 
 
 
338 aa  423  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00873867  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1472  ketol-acid reductoisomerase  61.61 
 
 
346 aa  422  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1760  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 
340 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.146114  normal  0.299859 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  63.1 
 
 
337 aa  424  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0514  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 
340 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.329203  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0983  ketol-acid reductoisomerase  61.93 
 
 
338 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.900438  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0651  ketol-acid reductoisomerase  61.09 
 
 
340 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.261788 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1009  ketol-acid reductoisomerase  61.63 
 
 
338 aa  419  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0031773  hitchhiker  0.000000327544 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  64.24 
 
 
344 aa  418  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2396  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 
340 aa  419  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0541  ketol-acid reductoisomerase  60.37 
 
 
340 aa  418  1e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4865  ketol-acid reductoisomerase  61.89 
 
 
338 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1238  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 
340 aa  418  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.937598  normal  0.708924 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3324  ketol-acid reductoisomerase  62.61 
 
 
338 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2539  ketol-acid reductoisomerase  62.24 
 
 
338 aa  419  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0383173  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2020  ketol-acid reductoisomerase  63.72 
 
 
338 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>