More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0738 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 		 337 aa  692    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  70 
 
 		 330 aa  488  1e-137  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  70 
 
 		 330 aa  485  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  67.88 
 
 		 330 aa  481  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1902  ketol-acid reductoisomerase  68.18 
 
 		 330 aa  478  1e-134  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2172  ketol-acid reductoisomerase  68.79 
 
 		 330 aa  480  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  67.88 
 
 		 330 aa  479  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0851  ketol-acid reductoisomerase  67.88 
 
 		 330 aa  475  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  64.58 
 
 		 338 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  65.36 
 
 		 338 aa  449  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  65.11 
 
 		 331 aa  448  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  65.67 
 
 		 338 aa  451  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  65.48 
 
 		 338 aa  443  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2418  ketol-acid reductoisomerase  60.53 
 
 		 339 aa  441  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1490  ketol-acid reductoisomerase  61.72 
 
 		 339 aa  441  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  65.11 
 
 		 327 aa  442  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13016  ketol-acid reductoisomerase  65.62 
 
 		 333 aa  441  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00176679  normal  0.164078 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3228  ketol-acid reductoisomerase  65 
 
 		 337 aa  438  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6019  ketol-acid reductoisomerase  66.25 
 
 		 337 aa  438  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390752  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  61.31 
 
 		 339 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1468  ketol-acid reductoisomerase  66.16 
 
 		 342 aa  440  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000508699  normal  0.0138391 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0504  ketol-acid reductoisomerase  61.61 
 
 		 338 aa  439  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000262639  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  63.86 
 
 		 331 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  63.55 
 
 		 331 aa  435  1e-121  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  63.99 
 
 		 338 aa  435  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  63.99 
 
 		 338 aa  435  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  60.71 
 
 		 338 aa  431  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  64.58 
 
 		 335 aa  432  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  65.42 
 
 		 331 aa  431  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  66.04 
 
 		 331 aa  431  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2142  ketol-acid reductoisomerase  63.1 
 
 		 340 aa  432  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0716485  normal  0.0660754 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  62.93 
 
 		 331 aa  432  1e-120  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  61.26 
 
 		 339 aa  432  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  62.05 
 
 		 336 aa  434  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2819  ketol-acid reductoisomerase  65.74 
 
 		 333 aa  434  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 		 339 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1902  ketol-acid reductoisomerase  65.65 
 
 		 341 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1879  ketol-acid reductoisomerase  66.04 
 
 		 342 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0867  ketol-acid reductoisomerase  63.38 
 
 		 340 aa  432  1e-120  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  59.52 
 
 		 339 aa  429  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  62.42 
 
 		 331 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  65.42 
 
 		 331 aa  428  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1343  ketol-acid reductoisomerase  65.33 
 
 		 331 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1976  ketol-acid reductoisomerase  65.35 
 
 		 341 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42500  ketol-acid reductoisomerase  60.71 
 
 		 338 aa  431  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4071  ketol-acid reductoisomerase  65.43 
 
 		 342 aa  429  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3552  ketol-acid reductoisomerase  66.98 
 
 		 330 aa  431  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.665615  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1496  ketol-acid reductoisomerase  59.23 
 
 		 339 aa  428  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0558834  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0285  ketol-acid reductoisomerase  59.35 
 
 		 339 aa  428  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.772607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1092  ketol-acid reductoisomerase  67.81 
 
 		 331 aa  428  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0329  ketol-acid reductoisomerase  59.35 
 
 		 339 aa  428  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  62.73 
 
 		 331 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1987  ketol-acid reductoisomerase  65.35 
 
 		 341 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  59.94 
 
 		 338 aa  428  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6082  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 		 339 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  60.24 
 
 		 339 aa  431  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2466  ketol-acid reductoisomerase  59.52 
 
 		 339 aa  425  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498417  normal  0.4902 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0361  ketol-acid reductoisomerase  59.35 
 
 		 339 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0613  ketol-acid reductoisomerase  65.11 
 
 		 331 aa  427  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398516  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2559  ketol-acid reductoisomerase  61.72 
 
 		 339 aa  426  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  60.6 
 
 		 338 aa  425  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  66.26 
 
 		 330 aa  427  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  63.39 
 
 		 336 aa  425  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3248  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 		 339 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167766  normal  0.961188 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1875  ketol-acid reductoisomerase  63.55 
 
 		 331 aa  425  1e-118  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000873272 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1907  ketol-acid reductoisomerase  62.2 
 
 		 339 aa  426  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.022886  hitchhiker  0.0000179587 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  63.1 
 
 		 336 aa  421  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3416  ketol-acid reductoisomerase  59.35 
 
 		 339 aa  423  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2501  ketol-acid reductoisomerase  60.9 
 
 		 338 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000349706  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2862  ketol-acid reductoisomerase  66.25 
 
 		 333 aa  422  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1581  ketol-acid reductoisomerase  58.93 
 
 		 340 aa  422  1e-117  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1989  ketol-acid reductoisomerase  59.52 
 
 		 338 aa  422  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2341  ketol-acid reductoisomerase  58.66 
 
 		 339 aa  422  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2518  ketol-acid reductoisomerase  62.5 
 
 		 338 aa  424  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  61.83 
 
 		 344 aa  424  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0541  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 		 340 aa  422  1e-117  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3638  ketol-acid reductoisomerase  66.88 
 
 		 329 aa  424  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  60.12 
 
 		 338 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  59.52 
 
 		 338 aa  422  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  60.9 
 
 		 338 aa  424  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2102  ketol-acid reductoisomerase  58.75 
 
 		 339 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2720  ketol-acid reductoisomerase  58.66 
 
 		 339 aa  424  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194376  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  60.99 
 
 		 331 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1472  ketol-acid reductoisomerase  60.9 
 
 		 346 aa  421  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3381  ketol-acid reductoisomerase  58.16 
 
 		 339 aa  422  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1125  ketol-acid reductoisomerase  68.75 
 
 		 337 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891733 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1781  ketol-acid reductoisomerase  60.53 
 
 		 339 aa  422  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  60.67 
 
 		 330 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  59.45 
 
 		 340 aa  419  1e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  61.37 
 
 		 331 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  58.93 
 
 		 338 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  58.33 
 
 		 338 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2492  ketol-acid reductoisomerase  57.69 
 
 		 339 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal  0.156046 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1337  ketol-acid reductoisomerase  65.43 
 
 		 342 aa  420  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3341  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 		 339 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.764687  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  60.98 
 
 		 329 aa  419  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  58.93 
 
 		 338 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  59.15 
 
 		 340 aa  420  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1367  ketol-acid reductoisomerase  59.45 
 
 		 340 aa  418  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.845865  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3563  ketol-acid reductoisomerase  61.88 
 
 		 330 aa  419  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0252536  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>