More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6019 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6019  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 		 337 aa  685    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390752  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08890  ketol-acid reductoisomerase  86.9 
 
 		 337 aa  566  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1125  ketol-acid reductoisomerase  80.36 
 
 		 337 aa  527  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1235  ketol-acid reductoisomerase  80.06 
 
 		 337 aa  523  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.362141 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4071  ketol-acid reductoisomerase  74.47 
 
 		 342 aa  513  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1468  ketol-acid reductoisomerase  74.77 
 
 		 342 aa  509  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000508699  normal  0.0138391 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1092  ketol-acid reductoisomerase  76.9 
 
 		 331 aa  506  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0613  ketol-acid reductoisomerase  73.86 
 
 		 331 aa  504  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398516  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3638  ketol-acid reductoisomerase  76.76 
 
 		 329 aa  503  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2819  ketol-acid reductoisomerase  71.87 
 
 		 333 aa  496  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3228  ketol-acid reductoisomerase  72.92 
 
 		 337 aa  496  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2862  ketol-acid reductoisomerase  75 
 
 		 333 aa  494  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13016  ketol-acid reductoisomerase  71.39 
 
 		 333 aa  485  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00176679  normal  0.164078 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1888  ketol-acid reductoisomerase  72.62 
 
 		 337 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.0861807 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3552  ketol-acid reductoisomerase  72.78 
 
 		 330 aa  485  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.665615  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1908  ketol-acid reductoisomerase  72.62 
 
 		 337 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20924  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1954  ketol-acid reductoisomerase  72.62 
 
 		 337 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.85036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4354  ketol-acid reductoisomerase  71.43 
 
 		 336 aa  481  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00327651  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2124  ketol-acid reductoisomerase  71.43 
 
 		 337 aa  478  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7780  ketol-acid reductoisomerase  72.09 
 
 		 331 aa  475  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.543395 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8057  Ketol-acid reductoisomerase  72.48 
 
 		 329 aa  477  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4237  ketol-acid reductoisomerase  70.54 
 
 		 337 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.317024  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0708  ketol-acid reductoisomerase  70.12 
 
 		 355 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1337  ketol-acid reductoisomerase  70.66 
 
 		 342 aa  467  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08550  ketol-acid reductoisomerase  72.04 
 
 		 343 aa  464  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0566957  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0173  ketol-acid reductoisomerase  70.82 
 
 		 331 aa  460  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3390  ketol-acid reductoisomerase  70.86 
 
 		 342 aa  458  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606091  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10700  ketol-acid reductoisomerase  68.56 
 
 		 342 aa  455  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.72382 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2140  ketol-acid reductoisomerase  70.55 
 
 		 342 aa  454  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18790  ketol-acid reductoisomerase  68.92 
 
 		 343 aa  451  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2384  ketol-acid reductoisomerase  69.85 
 
 		 341 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1165  ketol-acid reductoisomerase  68.62 
 
 		 342 aa  442  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal  0.0402172 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1410  ketol-acid reductoisomerase  69.33 
 
 		 342 aa  442  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1708  ketol-acid reductoisomerase  67.57 
 
 		 345 aa  442  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.301189 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  64.83 
 
 		 338 aa  443  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3480  ketol-acid reductoisomerase  63.14 
 
 		 341 aa  439  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.161207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1879  ketol-acid reductoisomerase  64.88 
 
 		 342 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  63.19 
 
 		 331 aa  438  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  62.08 
 
 		 329 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  62.08 
 
 		 329 aa  431  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  63.11 
 
 		 338 aa  433  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  61.77 
 
 		 329 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2537  ketol-acid reductoisomerase  67.18 
 
 		 341 aa  432  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00800327  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  64.53 
 
 		 338 aa  430  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1902  ketol-acid reductoisomerase  64.46 
 
 		 341 aa  427  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  62.27 
 
 		 331 aa  430  1e-119  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  60.86 
 
 		 330 aa  429  1e-119  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  62.58 
 
 		 331 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2277  ketol-acid reductoisomerase  67.38 
 
 		 341 aa  431  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1875  ketol-acid reductoisomerase  62.54 
 
 		 331 aa  425  1e-118  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000873272 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1987  ketol-acid reductoisomerase  64.46 
 
 		 341 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  61.96 
 
 		 331 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  61.47 
 
 		 329 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 		 330 aa  426  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1902  ketol-acid reductoisomerase  60.24 
 
 		 330 aa  427  1e-118  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  66.25 
 
 		 337 aa  427  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1976  ketol-acid reductoisomerase  64.46 
 
 		 341 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  63.3 
 
 		 338 aa  427  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  63.3 
 
 		 338 aa  427  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  61.11 
 
 		 330 aa  426  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2172  ketol-acid reductoisomerase  59.94 
 
 		 330 aa  421  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  61.04 
 
 		 331 aa  423  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  60.62 
 
 		 335 aa  422  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  60.43 
 
 		 331 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  60.19 
 
 		 330 aa  419  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 		 338 aa  420  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  60.55 
 
 		 331 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  60.86 
 
 		 336 aa  419  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  60.55 
 
 		 338 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  58.66 
 
 		 330 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1581  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 		 340 aa  414  9.999999999999999e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3563  ketol-acid reductoisomerase  60.74 
 
 		 330 aa  417  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0252536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  58.36 
 
 		 338 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0851  ketol-acid reductoisomerase  58.72 
 
 		 330 aa  415  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  63.91 
 
 		 338 aa  412  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  58.51 
 
 		 339 aa  411  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  59.34 
 
 		 333 aa  413  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  63 
 
 		 331 aa  413  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1242  ketol-acid reductoisomerase  60.24 
 
 		 340 aa  413  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  62.39 
 
 		 331 aa  412  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  59.15 
 
 		 330 aa  414  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3106  ketol-acid reductoisomerase  62.69 
 
 		 345 aa  414  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0285  ketol-acid reductoisomerase  57.61 
 
 		 339 aa  408  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.772607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3416  ketol-acid reductoisomerase  57.91 
 
 		 339 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  59.15 
 
 		 339 aa  410  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  59.94 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  59.57 
 
 		 329 aa  408  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2767  ketol-acid reductoisomerase  58.54 
 
 		 352 aa  410  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1490  ketol-acid reductoisomerase  59.15 
 
 		 339 aa  410  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0329  ketol-acid reductoisomerase  57.61 
 
 		 339 aa  408  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  58.97 
 
 		 331 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1127  ketol-acid reductoisomerase  58.61 
 
 		 340 aa  408  1e-113  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2749  ketol-acid reductoisomerase  59.09 
 
 		 339 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2492  ketol-acid reductoisomerase  58.18 
 
 		 339 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal  0.156046 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  61.59 
 
 		 331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0867  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 		 340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0903  ketol-acid reductoisomerase  57.88 
 
 		 351 aa  405  1.0000000000000001e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  59.15 
 
 		 339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  64.22 
 
 		 330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08830  ketol-acid reductoisomerase  59.52 
 
 		 331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.334822  normal  0.238181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>