More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4071 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4071  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 		 342 aa  691    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1468  ketol-acid reductoisomerase  81.29 
 
 		 342 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000508699  normal  0.0138391 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1337  ketol-acid reductoisomerase  77.71 
 
 		 342 aa  518  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2819  ketol-acid reductoisomerase  75.76 
 
 		 333 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6019  ketol-acid reductoisomerase  74.47 
 
 		 337 aa  513  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390752  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08550  ketol-acid reductoisomerase  76.97 
 
 		 343 aa  507  9.999999999999999e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0566957  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3552  ketol-acid reductoisomerase  74.09 
 
 		 330 aa  497  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.665615  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0613  ketol-acid reductoisomerase  71.73 
 
 		 331 aa  499  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398516  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2140  ketol-acid reductoisomerase  75.37 
 
 		 342 aa  500  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3390  ketol-acid reductoisomerase  75.07 
 
 		 342 aa  500  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606091  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7780  ketol-acid reductoisomerase  74.62 
 
 		 331 aa  493  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.543395 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08890  ketol-acid reductoisomerase  76.29 
 
 		 337 aa  483  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1410  ketol-acid reductoisomerase  73.31 
 
 		 342 aa  482  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10700  ketol-acid reductoisomerase  72.73 
 
 		 342 aa  480  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.72382 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1125  ketol-acid reductoisomerase  73.56 
 
 		 337 aa  475  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891733 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1165  ketol-acid reductoisomerase  72.43 
 
 		 342 aa  474  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal  0.0402172 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1708  ketol-acid reductoisomerase  71.18 
 
 		 345 aa  474  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.301189 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0708  ketol-acid reductoisomerase  69.09 
 
 		 355 aa  474  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8057  Ketol-acid reductoisomerase  72.17 
 
 		 329 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1235  ketol-acid reductoisomerase  72.04 
 
 		 337 aa  465  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.362141 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0173  ketol-acid reductoisomerase  69.79 
 
 		 331 aa  468  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2384  ketol-acid reductoisomerase  70.29 
 
 		 341 aa  462  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18790  ketol-acid reductoisomerase  69.3 
 
 		 343 aa  459  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3638  ketol-acid reductoisomerase  69.42 
 
 		 329 aa  457  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2537  ketol-acid reductoisomerase  69.32 
 
 		 341 aa  456  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00800327  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3228  ketol-acid reductoisomerase  65.96 
 
 		 337 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1092  ketol-acid reductoisomerase  69.72 
 
 		 331 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2277  ketol-acid reductoisomerase  69.03 
 
 		 341 aa  451  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2862  ketol-acid reductoisomerase  68.31 
 
 		 333 aa  442  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13016  ketol-acid reductoisomerase  66.15 
 
 		 333 aa  442  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00176679  normal  0.164078 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  62.12 
 
 		 331 aa  441  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1879  ketol-acid reductoisomerase  63.56 
 
 		 342 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  62.08 
 
 		 331 aa  434  1e-120  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  61.47 
 
 		 331 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4354  ketol-acid reductoisomerase  67.48 
 
 		 336 aa  434  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00327651  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1888  ketol-acid reductoisomerase  65.65 
 
 		 337 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.0861807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1908  ketol-acid reductoisomerase  65.65 
 
 		 337 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20924  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1902  ketol-acid reductoisomerase  64.53 
 
 		 341 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1954  ketol-acid reductoisomerase  65.65 
 
 		 337 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.85036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2124  ketol-acid reductoisomerase  65.35 
 
 		 337 aa  432  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  59.02 
 
 		 329 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4237  ketol-acid reductoisomerase  65.05 
 
 		 337 aa  430  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.317024  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  61.16 
 
 		 331 aa  429  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1987  ketol-acid reductoisomerase  62.65 
 
 		 341 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1976  ketol-acid reductoisomerase  62.65 
 
 		 341 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  59.02 
 
 		 329 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 		 331 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1581  ketol-acid reductoisomerase  60.12 
 
 		 340 aa  425  1e-118  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 		 331 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  59.02 
 
 		 329 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  61.09 
 
 		 338 aa  424  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  65.24 
 
 		 331 aa  422  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  60.37 
 
 		 333 aa  422  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1875  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 		 331 aa  423  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000873272 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  59.33 
 
 		 329 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 		 338 aa  422  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1127  ketol-acid reductoisomerase  59.7 
 
 		 340 aa  421  1e-117  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0374  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 		 340 aa  419  1e-116  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  63.53 
 
 		 331 aa  418  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  61.16 
 
 		 329 aa  420  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  65.43 
 
 		 337 aa  417  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  59.51 
 
 		 335 aa  418  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0867  ketol-acid reductoisomerase  60.12 
 
 		 340 aa  418  1e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 		 338 aa  415  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 		 331 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  62.27 
 
 		 327 aa  413  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  58.66 
 
 		 330 aa  413  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0504  ketol-acid reductoisomerase  58.05 
 
 		 338 aa  413  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000262639  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  58.97 
 
 		 336 aa  412  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1242  ketol-acid reductoisomerase  60.42 
 
 		 340 aa  413  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  59.15 
 
 		 338 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  59.15 
 
 		 338 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  58.1 
 
 		 330 aa  408  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4447  ketol-acid reductoisomerase  60.12 
 
 		 337 aa  405  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  57.4 
 
 		 340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0541  ketol-acid reductoisomerase  57.23 
 
 		 340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42500  ketol-acid reductoisomerase  58.36 
 
 		 338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1367  ketol-acid reductoisomerase  57.4 
 
 		 340 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.845865  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  59.76 
 
 		 331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0524  ketol-acid reductoisomerase  57.75 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.181387  normal  0.0101595 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3480  ketol-acid reductoisomerase  57.36 
 
 		 341 aa  405  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.161207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  56.5 
 
 		 340 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  58.36 
 
 		 338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0948  ketol-acid reductoisomerase  58.01 
 
 		 340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.525725  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2767  ketol-acid reductoisomerase  58.54 
 
 		 352 aa  404  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  58.02 
 
 		 330 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0529  ketol-acid reductoisomerase  57.75 
 
 		 338 aa  404  1e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1326  ketol-acid reductoisomerase  58.05 
 
 		 350 aa  401  1e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3020  ketol-acid reductoisomerase  60.55 
 
 		 336 aa  401  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000242382  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2142  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 		 340 aa  401  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0716485  normal  0.0660754 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08830  ketol-acid reductoisomerase  59.27 
 
 		 331 aa  402  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.334822  normal  0.238181 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1780  ketol-acid reductoisomerase  58.36 
 
 		 338 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  61.4 
 
 		 338 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0983  ketol-acid reductoisomerase  58.36 
 
 		 338 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.900438  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0848  ketol-acid reductoisomerase  58.66 
 
 		 338 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.385412  hitchhiker  0.00438995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0285  ketol-acid reductoisomerase  57.49 
 
 		 339 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.772607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1989  ketol-acid reductoisomerase  58.05 
 
 		 338 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2518  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 		 338 aa  398  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  63.11 
 
 		 330 aa  400  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  61.77 
 
 		 330 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>