More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13016 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13016  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
333 aa  674    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00176679  normal  0.164078 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1888  ketol-acid reductoisomerase  85.89 
 
 
337 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.0861807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1908  ketol-acid reductoisomerase  85.89 
 
 
337 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20924  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1954  ketol-acid reductoisomerase  85.89 
 
 
337 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.85036  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4237  ketol-acid reductoisomerase  85.89 
 
 
337 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.317024  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2124  ketol-acid reductoisomerase  84.98 
 
 
337 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322343  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3228  ketol-acid reductoisomerase  82.58 
 
 
337 aa  571  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2862  ketol-acid reductoisomerase  84.38 
 
 
333 aa  568  1e-161  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6019  ketol-acid reductoisomerase  71.39 
 
 
337 aa  485  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390752  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1468  ketol-acid reductoisomerase  68.62 
 
 
342 aa  458  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000508699  normal  0.0138391 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08890  ketol-acid reductoisomerase  71.17 
 
 
337 aa  454  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2819  ketol-acid reductoisomerase  67.08 
 
 
333 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4354  ketol-acid reductoisomerase  67.87 
 
 
336 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00327651  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1125  ketol-acid reductoisomerase  69.37 
 
 
337 aa  451  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000891733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1235  ketol-acid reductoisomerase  69.07 
 
 
337 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.362141 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3552  ketol-acid reductoisomerase  65.95 
 
 
330 aa  442  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.665615  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4071  ketol-acid reductoisomerase  66.15 
 
 
342 aa  442  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0613  ketol-acid reductoisomerase  65.14 
 
 
331 aa  435  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398516  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1337  ketol-acid reductoisomerase  67.38 
 
 
342 aa  436  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7780  ketol-acid reductoisomerase  65.85 
 
 
331 aa  434  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.543395 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  65.62 
 
 
337 aa  432  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1902  ketol-acid reductoisomerase  59.38 
 
 
330 aa  425  1e-118  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8057  Ketol-acid reductoisomerase  65.23 
 
 
329 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0708  ketol-acid reductoisomerase  63.91 
 
 
355 aa  421  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57193  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0173  ketol-acid reductoisomerase  64 
 
 
331 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  58.72 
 
 
330 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  58.64 
 
 
330 aa  415  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2140  ketol-acid reductoisomerase  64.31 
 
 
342 aa  414  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  57.85 
 
 
330 aa  411  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2172  ketol-acid reductoisomerase  58.46 
 
 
330 aa  412  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  58.64 
 
 
330 aa  412  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3390  ketol-acid reductoisomerase  64.31 
 
 
342 aa  414  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606091  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1410  ketol-acid reductoisomerase  64 
 
 
342 aa  410  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2384  ketol-acid reductoisomerase  62.96 
 
 
341 aa  404  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18790  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 
343 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  58.77 
 
 
331 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0851  ketol-acid reductoisomerase  56.92 
 
 
330 aa  401  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1875  ketol-acid reductoisomerase  57.19 
 
 
331 aa  400  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000873272 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  57.67 
 
 
339 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10700  ketol-acid reductoisomerase  62.46 
 
 
342 aa  400  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.72382 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  58.59 
 
 
338 aa  399  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1092  ketol-acid reductoisomerase  62.39 
 
 
331 aa  398  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3563  ketol-acid reductoisomerase  58.01 
 
 
330 aa  395  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0252536  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  57.54 
 
 
331 aa  397  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1708  ketol-acid reductoisomerase  61.45 
 
 
345 aa  395  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.301189 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08550  ketol-acid reductoisomerase  61.73 
 
 
343 aa  395  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0566957  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3638  ketol-acid reductoisomerase  62.15 
 
 
329 aa  395  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  59.69 
 
 
338 aa  394  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2559  ketol-acid reductoisomerase  57.01 
 
 
339 aa  394  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1165  ketol-acid reductoisomerase  62.04 
 
 
342 aa  395  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal  0.0402172 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08830  ketol-acid reductoisomerase  57.49 
 
 
331 aa  396  1e-109  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.334822  normal  0.238181 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  56.62 
 
 
331 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  56.92 
 
 
331 aa  393  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2277  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 
341 aa  391  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  56.62 
 
 
331 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  57.32 
 
 
339 aa  392  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  57.54 
 
 
338 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  57.54 
 
 
338 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  55.69 
 
 
329 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  56.57 
 
 
338 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  55.69 
 
 
329 aa  388  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  56.4 
 
 
339 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  55.69 
 
 
329 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2537  ketol-acid reductoisomerase  59.57 
 
 
341 aa  390  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00800327  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2749  ketol-acid reductoisomerase  55.79 
 
 
339 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0983  ketol-acid reductoisomerase  56.31 
 
 
338 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.900438  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3341  ketol-acid reductoisomerase  56.1 
 
 
339 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.764687  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2492  ketol-acid reductoisomerase  55.49 
 
 
339 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal  0.156046 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3248  ketol-acid reductoisomerase  55.79 
 
 
339 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167766  normal  0.961188 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2319  ketol-acid reductoisomerase  56.57 
 
 
338 aa  386  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  55.69 
 
 
329 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1472  ketol-acid reductoisomerase  55.22 
 
 
346 aa  385  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  55.69 
 
 
338 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  55.69 
 
 
338 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1902  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 
341 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  55.66 
 
 
331 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  56.31 
 
 
338 aa  384  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  55.29 
 
 
333 aa  383  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3381  ketol-acid reductoisomerase  55.18 
 
 
339 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0848  ketol-acid reductoisomerase  55.69 
 
 
338 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.385412  hitchhiker  0.00438995 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  55.66 
 
 
338 aa  381  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0867  ketol-acid reductoisomerase  55.69 
 
 
340 aa  382  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4786  ketol-acid reductoisomerase  55.08 
 
 
338 aa  381  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  hitchhiker  0.00823723 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  56.31 
 
 
331 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2466  ketol-acid reductoisomerase  55.52 
 
 
339 aa  382  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498417  normal  0.4902 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1976  ketol-acid reductoisomerase  59.69 
 
 
341 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  55.35 
 
 
339 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  55.21 
 
 
339 aa  383  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1326  ketol-acid reductoisomerase  57.1 
 
 
350 aa  383  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2102  ketol-acid reductoisomerase  55.18 
 
 
339 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0504  ketol-acid reductoisomerase  55.08 
 
 
338 aa  382  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000262639  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1987  ketol-acid reductoisomerase  59.69 
 
 
341 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  56.62 
 
 
336 aa  384  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42500  ketol-acid reductoisomerase  55.69 
 
 
338 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2418  ketol-acid reductoisomerase  55.83 
 
 
339 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1581  ketol-acid reductoisomerase  56 
 
 
340 aa  382  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1962  ketol-acid reductoisomerase  55.18 
 
 
339 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.971323  normal  0.40215 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0361  ketol-acid reductoisomerase  55.21 
 
 
339 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1009  ketol-acid reductoisomerase  55.08 
 
 
338 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0031773  hitchhiker  0.000000327544 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1490  ketol-acid reductoisomerase  56.13 
 
 
339 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>