More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_14761 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  96.35 
 
 
329 aa  658    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
329 aa  679    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  95.74 
 
 
329 aa  655    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  96.66 
 
 
329 aa  661    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  82.98 
 
 
331 aa  581  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  82.67 
 
 
331 aa  576  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  82.98 
 
 
331 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  82.07 
 
 
331 aa  572  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  82.98 
 
 
331 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  81.46 
 
 
331 aa  568  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  71.78 
 
 
327 aa  496  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  71.12 
 
 
331 aa  491  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  70.52 
 
 
331 aa  468  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  70.21 
 
 
331 aa  463  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  69.3 
 
 
331 aa  462  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1343  ketol-acid reductoisomerase  68.29 
 
 
331 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0991  ketol-acid reductoisomerase  70.21 
 
 
331 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1020  ketol-acid reductoisomerase  70.21 
 
 
331 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.488917 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  63.83 
 
 
333 aa  444  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1468  ketol-acid reductoisomerase  62.08 
 
 
342 aa  441  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000508699  normal  0.0138391 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  62.61 
 
 
331 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0613  ketol-acid reductoisomerase  61.59 
 
 
331 aa  431  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398516  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  64.74 
 
 
331 aa  428  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6019  ketol-acid reductoisomerase  61.47 
 
 
337 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390752  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2819  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 
333 aa  422  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 
330 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 
335 aa  423  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4071  ketol-acid reductoisomerase  59.33 
 
 
342 aa  424  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  61.73 
 
 
330 aa  422  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  61.04 
 
 
338 aa  421  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1337  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 
342 aa  420  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 
340 aa  411  1e-114  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08550  ketol-acid reductoisomerase  62.15 
 
 
343 aa  411  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0566957  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1367  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 
340 aa  413  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.845865  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  60.12 
 
 
338 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  60.43 
 
 
338 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1902  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 
341 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8057  Ketol-acid reductoisomerase  62.92 
 
 
329 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  60.12 
 
 
338 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1976  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 
341 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1987  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 
341 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3552  ketol-acid reductoisomerase  60.98 
 
 
330 aa  413  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.665615  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  59.38 
 
 
340 aa  413  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1581  ketol-acid reductoisomerase  58.72 
 
 
340 aa  409  1e-113  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  60.43 
 
 
330 aa  408  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0173  ketol-acid reductoisomerase  61.28 
 
 
331 aa  409  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  59.02 
 
 
339 aa  409  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  59.2 
 
 
338 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3638  ketol-acid reductoisomerase  61.59 
 
 
329 aa  410  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18790  ketol-acid reductoisomerase  61.47 
 
 
343 aa  409  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1879  ketol-acid reductoisomerase  61.66 
 
 
342 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  58.59 
 
 
338 aa  410  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 
338 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  62.61 
 
 
336 aa  409  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  60.12 
 
 
330 aa  409  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  59.51 
 
 
338 aa  408  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  59.2 
 
 
338 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42500  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 
338 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  59.63 
 
 
338 aa  408  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  59.2 
 
 
338 aa  408  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1061  ketol-acid reductoisomerase  60.43 
 
 
338 aa  410  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0867  ketol-acid reductoisomerase  59.69 
 
 
340 aa  410  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  59.51 
 
 
338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  58.59 
 
 
338 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  58.36 
 
 
330 aa  405  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1165  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 
342 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal  0.0402172 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0812  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 
338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  60.74 
 
 
338 aa  404  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  60.74 
 
 
338 aa  404  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 
336 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  58.23 
 
 
339 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1962  ketol-acid reductoisomerase  59.02 
 
 
339 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.971323  normal  0.40215 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  57.8 
 
 
339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7780  ketol-acid reductoisomerase  59.27 
 
 
331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.543395 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  56.75 
 
 
338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1410  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 
342 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 
330 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  57.06 
 
 
336 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1127  ketol-acid reductoisomerase  60.37 
 
 
340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1875  ketol-acid reductoisomerase  59.2 
 
 
331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000873272 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  61.35 
 
 
330 aa  401  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1780  ketol-acid reductoisomerase  59.51 
 
 
338 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3480  ketol-acid reductoisomerase  59.63 
 
 
341 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.161207  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1989  ketol-acid reductoisomerase  57.98 
 
 
338 aa  401  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2492  ketol-acid reductoisomerase  57.8 
 
 
339 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal  0.156046 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2501  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 
338 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000349706  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3248  ketol-acid reductoisomerase  58.84 
 
 
339 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167766  normal  0.961188 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2121  ketol-acid reductoisomerase  58.59 
 
 
338 aa  401  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3228  ketol-acid reductoisomerase  57.67 
 
 
337 aa  401  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2142  ketol-acid reductoisomerase  59.45 
 
 
340 aa  403  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0716485  normal  0.0660754 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1905  ketol-acid reductoisomerase  62.39 
 
 
333 aa  403  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1496  ketol-acid reductoisomerase  59.02 
 
 
339 aa  403  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0558834  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  58.41 
 
 
338 aa  403  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  60.12 
 
 
337 aa  403  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0851  ketol-acid reductoisomerase  59.38 
 
 
330 aa  403  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3390  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 
342 aa  402  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606091  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4865  ketol-acid reductoisomerase  59.2 
 
 
338 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  58.9 
 
 
338 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2102  ketol-acid reductoisomerase  57.32 
 
 
339 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2140  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 
342 aa  398  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>