More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3228 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3228  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 		 337 aa  683    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1888  ketol-acid reductoisomerase  90.21 
 
 		 337 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.0861807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1908  ketol-acid reductoisomerase  90.21 
 
 		 337 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20924  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1954  ketol-acid reductoisomerase  90.21 
 
 		 337 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.85036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2124  ketol-acid reductoisomerase  89.02 
 
 		 337 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4237  ketol-acid reductoisomerase  88.72 
 
 		 337 aa  599  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.317024  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2862  ketol-acid reductoisomerase  90.39 
 
 		 333 aa  599  1e-170  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13016  ketol-acid reductoisomerase  82.58 
 
 		 333 aa  571  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00176679  normal  0.164078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6019  ketol-acid reductoisomerase  72.92 
 
 		 337 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390752  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08890  ketol-acid reductoisomerase  74.48 
 
 		 337 aa  483  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1468  ketol-acid reductoisomerase  70.21 
 
 		 342 aa  474  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000508699  normal  0.0138391 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1125  ketol-acid reductoisomerase  70.62 
 
 		 337 aa  462  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1235  ketol-acid reductoisomerase  69.73 
 
 		 337 aa  457  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.362141 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4071  ketol-acid reductoisomerase  65.96 
 
 		 342 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2819  ketol-acid reductoisomerase  66.26 
 
 		 333 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4354  ketol-acid reductoisomerase  67.36 
 
 		 336 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00327651  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3552  ketol-acid reductoisomerase  66.36 
 
 		 330 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.665615  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1337  ketol-acid reductoisomerase  68.1 
 
 		 342 aa  444  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7780  ketol-acid reductoisomerase  66.56 
 
 		 331 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.543395 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3390  ketol-acid reductoisomerase  66.87 
 
 		 342 aa  435  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606091  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0613  ketol-acid reductoisomerase  64.13 
 
 		 331 aa  434  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398516  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8057  Ketol-acid reductoisomerase  65.64 
 
 		 329 aa  428  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2140  ketol-acid reductoisomerase  66.26 
 
 		 342 aa  429  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  65 
 
 		 337 aa  427  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1165  ketol-acid reductoisomerase  64.92 
 
 		 342 aa  421  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal  0.0402172 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2384  ketol-acid reductoisomerase  66.46 
 
 		 341 aa  422  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10700  ketol-acid reductoisomerase  65.03 
 
 		 342 aa  424  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.72382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  59.7 
 
 		 339 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1472  ketol-acid reductoisomerase  60.83 
 
 		 346 aa  421  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  61.28 
 
 		 338 aa  423  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 		 339 aa  423  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1410  ketol-acid reductoisomerase  65.64 
 
 		 342 aa  424  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3381  ketol-acid reductoisomerase  59.09 
 
 		 339 aa  419  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0173  ketol-acid reductoisomerase  64.13 
 
 		 331 aa  418  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  60.61 
 
 		 339 aa  418  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0329  ketol-acid reductoisomerase  59.15 
 
 		 339 aa  418  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  59.76 
 
 		 339 aa  419  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1902  ketol-acid reductoisomerase  57.49 
 
 		 330 aa  419  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  59.76 
 
 		 339 aa  419  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0285  ketol-acid reductoisomerase  59.15 
 
 		 339 aa  418  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.772607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0708  ketol-acid reductoisomerase  63.72 
 
 		 355 aa  420  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08550  ketol-acid reductoisomerase  63.53 
 
 		 343 aa  419  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0566957  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2172  ketol-acid reductoisomerase  57.8 
 
 		 330 aa  414  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  57.41 
 
 		 330 aa  415  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  59.33 
 
 		 338 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3341  ketol-acid reductoisomerase  58.48 
 
 		 339 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.764687  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3248  ketol-acid reductoisomerase  59.09 
 
 		 339 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167766  normal  0.961188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0361  ketol-acid reductoisomerase  59.15 
 
 		 339 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  59.33 
 
 		 338 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  60.24 
 
 		 338 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2749  ketol-acid reductoisomerase  58.48 
 
 		 339 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2492  ketol-acid reductoisomerase  57.88 
 
 		 339 aa  411  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal  0.156046 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2102  ketol-acid reductoisomerase  57.88 
 
 		 339 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1708  ketol-acid reductoisomerase  64.02 
 
 		 345 aa  414  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.301189 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  59.2 
 
 		 331 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18790  ketol-acid reductoisomerase  61.52 
 
 		 343 aa  410  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2559  ketol-acid reductoisomerase  59.09 
 
 		 339 aa  411  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2418  ketol-acid reductoisomerase  58.54 
 
 		 339 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0983  ketol-acid reductoisomerase  59.94 
 
 		 338 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.900438  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0848  ketol-acid reductoisomerase  59.33 
 
 		 338 aa  408  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.385412  hitchhiker  0.00438995 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2341  ketol-acid reductoisomerase  57.27 
 
 		 339 aa  409  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  57.98 
 
 		 331 aa  409  1e-113  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  59.94 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0541  ketol-acid reductoisomerase  58.97 
 
 		 340 aa  408  1e-113  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3416  ketol-acid reductoisomerase  58.54 
 
 		 339 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  56.88 
 
 		 330 aa  408  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1780  ketol-acid reductoisomerase  59.63 
 
 		 338 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0504  ketol-acid reductoisomerase  57.19 
 
 		 338 aa  408  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000262639  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2720  ketol-acid reductoisomerase  56.67 
 
 		 339 aa  408  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194376  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42500  ketol-acid reductoisomerase  58.41 
 
 		 338 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1496  ketol-acid reductoisomerase  57.58 
 
 		 339 aa  408  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0558834  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6082  ketol-acid reductoisomerase  57.58 
 
 		 339 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1127  ketol-acid reductoisomerase  58.61 
 
 		 340 aa  408  1e-113  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1009  ketol-acid reductoisomerase  59.33 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0031773  hitchhiker  0.000000327544 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  57.75 
 
 		 340 aa  404  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1490  ketol-acid reductoisomerase  57.93 
 
 		 339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1367  ketol-acid reductoisomerase  58.05 
 
 		 340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.845865  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  57.45 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  58.59 
 
 		 331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  56.79 
 
 		 330 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4786  ketol-acid reductoisomerase  58.41 
 
 		 338 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  hitchhiker  0.00823723 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  55.62 
 
 		 330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  57.06 
 
 		 331 aa  404  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  57.98 
 
 		 329 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2501  ketol-acid reductoisomerase  57.75 
 
 		 338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000349706  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  57.98 
 
 		 329 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  57.67 
 
 		 329 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  57.45 
 
 		 340 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  58.28 
 
 		 331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2466  ketol-acid reductoisomerase  58.54 
 
 		 339 aa  406  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498417  normal  0.4902 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0867  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 		 340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1781  ketol-acid reductoisomerase  57.58 
 
 		 339 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  57.83 
 
 		 333 aa  402  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1989  ketol-acid reductoisomerase  56.88 
 
 		 338 aa  403  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0116  ketol-acid reductoisomerase  58.41 
 
 		 359 aa  404  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1238  ketol-acid reductoisomerase  58.36 
 
 		 340 aa  404  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.937598  normal  0.708924 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2539  ketol-acid reductoisomerase  59.15 
 
 		 338 aa  402  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0383173  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2778  ketol-acid reductoisomerase  56.67 
 
 		 339 aa  404  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1962  ketol-acid reductoisomerase  56.97 
 
 		 339 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.971323  normal  0.40215 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  56.53 
 
 		 338 aa  404  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>