More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_20051 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  92.75 
 
 		 331 aa  641    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  92.15 
 
 		 331 aa  639    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 		 331 aa  679    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  89.7 
 
 		 331 aa  618  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  87.88 
 
 		 331 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  87.58 
 
 		 331 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  82.98 
 
 		 329 aa  584  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  82.98 
 
 		 329 aa  586  1e-166  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  82.67 
 
 		 329 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  82.98 
 
 		 329 aa  581  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  78.22 
 
 		 327 aa  528  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  73.11 
 
 		 331 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  71.43 
 
 		 331 aa  481  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  71 
 
 		 331 aa  483  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1343  ketol-acid reductoisomerase  72.56 
 
 		 331 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  70.52 
 
 		 331 aa  471  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1020  ketol-acid reductoisomerase  72.95 
 
 		 331 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.488917 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0991  ketol-acid reductoisomerase  72.95 
 
 		 331 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1468  ketol-acid reductoisomerase  64.11 
 
 		 342 aa  455  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000508699  normal  0.0138391 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  64.44 
 
 		 335 aa  449  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  63.22 
 
 		 333 aa  443  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4071  ketol-acid reductoisomerase  62.12 
 
 		 342 aa  441  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1902  ketol-acid reductoisomerase  66.77 
 
 		 341 aa  441  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6019  ketol-acid reductoisomerase  63.19 
 
 		 337 aa  438  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390752  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0613  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 		 331 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398516  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1987  ketol-acid reductoisomerase  66.47 
 
 		 341 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1976  ketol-acid reductoisomerase  66.47 
 
 		 341 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  62.35 
 
 		 330 aa  435  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18790  ketol-acid reductoisomerase  65.75 
 
 		 343 aa  437  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08550  ketol-acid reductoisomerase  65.75 
 
 		 343 aa  436  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0566957  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  63.22 
 
 		 331 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1337  ketol-acid reductoisomerase  64.55 
 
 		 342 aa  434  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3416  ketol-acid reductoisomerase  62.2 
 
 		 339 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2819  ketol-acid reductoisomerase  60.91 
 
 		 333 aa  433  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  62.69 
 
 		 339 aa  427  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  62.69 
 
 		 339 aa  430  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3552  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 		 330 aa  428  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.665615  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 		 330 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  62.92 
 
 		 331 aa  429  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1962  ketol-acid reductoisomerase  62.39 
 
 		 339 aa  424  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.971323  normal  0.40215 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  61.66 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0285  ketol-acid reductoisomerase  61.47 
 
 		 339 aa  425  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.772607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  61.66 
 
 		 336 aa  426  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1879  ketol-acid reductoisomerase  64.24 
 
 		 342 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2501  ketol-acid reductoisomerase  63.5 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000349706  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  64.42 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3341  ketol-acid reductoisomerase  62.2 
 
 		 339 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.764687  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0329  ketol-acid reductoisomerase  61.47 
 
 		 339 aa  425  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  64.42 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2102  ketol-acid reductoisomerase  61.59 
 
 		 339 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  61.66 
 
 		 338 aa  425  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  63.86 
 
 		 337 aa  427  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  61.59 
 
 		 339 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  60.86 
 
 		 338 aa  427  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  61.66 
 
 		 338 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  61.04 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  63 
 
 		 339 aa  422  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  61.04 
 
 		 330 aa  422  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0867  ketol-acid reductoisomerase  61.16 
 
 		 340 aa  422  1e-117  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  61.47 
 
 		 339 aa  423  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3638  ketol-acid reductoisomerase  64.02 
 
 		 329 aa  422  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2492  ketol-acid reductoisomerase  60.86 
 
 		 339 aa  421  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal  0.156046 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1490  ketol-acid reductoisomerase  61.28 
 
 		 339 aa  424  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2749  ketol-acid reductoisomerase  61.16 
 
 		 339 aa  421  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  61.09 
 
 		 338 aa  418  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7780  ketol-acid reductoisomerase  61.09 
 
 		 331 aa  418  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.543395 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0361  ketol-acid reductoisomerase  61.16 
 
 		 339 aa  421  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2341  ketol-acid reductoisomerase  60.61 
 
 		 339 aa  418  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  60.55 
 
 		 329 aa  420  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1875  ketol-acid reductoisomerase  61.35 
 
 		 331 aa  418  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000873272 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2418  ketol-acid reductoisomerase  60.86 
 
 		 339 aa  420  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  60.74 
 
 		 338 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1472  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 		 346 aa  420  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1496  ketol-acid reductoisomerase  61.77 
 
 		 339 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0558834  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 		 338 aa  419  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2559  ketol-acid reductoisomerase  61.59 
 
 		 339 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8057  Ketol-acid reductoisomerase  62.61 
 
 		 329 aa  414  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1092  ketol-acid reductoisomerase  63.41 
 
 		 331 aa  415  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  60.62 
 
 		 340 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6082  ketol-acid reductoisomerase  61.59 
 
 		 339 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  63.03 
 
 		 344 aa  416  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 		 330 aa  414  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  61.77 
 
 		 338 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 		 330 aa  415  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1907  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 		 339 aa  415  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.022886  hitchhiker  0.0000179587 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  61.35 
 
 		 338 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2857  ketol-acid reductoisomerase  62.2 
 
 		 339 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.658942  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  64.42 
 
 		 330 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3248  ketol-acid reductoisomerase  59.76 
 
 		 339 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167766  normal  0.961188 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0504  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 		 338 aa  415  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000262639  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  59.69 
 
 		 340 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10700  ketol-acid reductoisomerase  61.93 
 
 		 342 aa  417  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.72382 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1127  ketol-acid reductoisomerase  60.31 
 
 		 340 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2130  ketol-acid reductoisomerase  62.12 
 
 		 334 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  61.04 
 
 		 338 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1989  ketol-acid reductoisomerase  61.35 
 
 		 338 aa  414  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  65.35 
 
 		 330 aa  414  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1708  ketol-acid reductoisomerase  62.24 
 
 		 345 aa  413  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.301189 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  60.55 
 
 		 338 aa  413  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1125  ketol-acid reductoisomerase  63.8 
 
 		 337 aa  411  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>