More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0839 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  96.68 
 
 
331 aa  665    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
331 aa  680    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  92.15 
 
 
331 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  89.36 
 
 
331 aa  617  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  89.36 
 
 
331 aa  617  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  88.45 
 
 
331 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  82.37 
 
 
329 aa  578  1e-164  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  82.37 
 
 
329 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  81.76 
 
 
329 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  82.07 
 
 
329 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  78.83 
 
 
327 aa  533  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  72.21 
 
 
331 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  72.21 
 
 
331 aa  490  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  71.73 
 
 
331 aa  480  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1343  ketol-acid reductoisomerase  70.73 
 
 
331 aa  471  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1020  ketol-acid reductoisomerase  71.82 
 
 
331 aa  465  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.488917 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0991  ketol-acid reductoisomerase  71.82 
 
 
331 aa  464  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  69.91 
 
 
331 aa  467  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1468  ketol-acid reductoisomerase  62.88 
 
 
342 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000508699  normal  0.0138391 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  63.83 
 
 
335 aa  444  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  63.22 
 
 
333 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  62.96 
 
 
330 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  63.8 
 
 
330 aa  435  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0613  ketol-acid reductoisomerase  61.4 
 
 
331 aa  434  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398516  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  62.92 
 
 
331 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  62.69 
 
 
339 aa  431  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08550  ketol-acid reductoisomerase  65.14 
 
 
343 aa  431  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0566957  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1902  ketol-acid reductoisomerase  64.65 
 
 
341 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3416  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 
339 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1987  ketol-acid reductoisomerase  64.35 
 
 
341 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1976  ketol-acid reductoisomerase  64.35 
 
 
341 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2102  ketol-acid reductoisomerase  61.89 
 
 
339 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4071  ketol-acid reductoisomerase  61.16 
 
 
342 aa  429  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  62.2 
 
 
339 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  63.3 
 
 
339 aa  428  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1490  ketol-acid reductoisomerase  61.89 
 
 
339 aa  429  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 
330 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0329  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 
339 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  64.11 
 
 
338 aa  424  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1337  ketol-acid reductoisomerase  63.83 
 
 
342 aa  425  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 
331 aa  426  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3341  ketol-acid reductoisomerase  61.89 
 
 
339 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.764687  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3552  ketol-acid reductoisomerase  61.52 
 
 
330 aa  426  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.665615  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2418  ketol-acid reductoisomerase  62.08 
 
 
339 aa  426  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0285  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 
339 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.772607  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  64.11 
 
 
338 aa  424  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  62.39 
 
 
329 aa  426  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2819  ketol-acid reductoisomerase  59.39 
 
 
333 aa  425  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1879  ketol-acid reductoisomerase  63.64 
 
 
342 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  62.08 
 
 
339 aa  426  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  61.4 
 
 
339 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6019  ketol-acid reductoisomerase  61.04 
 
 
337 aa  423  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390752  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2749  ketol-acid reductoisomerase  62.08 
 
 
339 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2492  ketol-acid reductoisomerase  61.16 
 
 
339 aa  421  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal  0.156046 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6082  ketol-acid reductoisomerase  61.59 
 
 
339 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  60.43 
 
 
330 aa  424  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  63.55 
 
 
337 aa  424  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18790  ketol-acid reductoisomerase  63 
 
 
343 aa  423  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  61.47 
 
 
338 aa  421  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1962  ketol-acid reductoisomerase  62.39 
 
 
339 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.971323  normal  0.40215 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  59.63 
 
 
338 aa  421  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0361  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 
339 aa  422  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0851  ketol-acid reductoisomerase  60.62 
 
 
330 aa  422  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  61.96 
 
 
338 aa  420  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3435  ketol-acid reductoisomerase  63.94 
 
 
331 aa  419  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00388132  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  61.11 
 
 
330 aa  420  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 
340 aa  418  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2341  ketol-acid reductoisomerase  60.3 
 
 
339 aa  419  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1905  ketol-acid reductoisomerase  67.28 
 
 
333 aa  419  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  60.43 
 
 
338 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  60.74 
 
 
338 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3248  ketol-acid reductoisomerase  60.37 
 
 
339 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167766  normal  0.961188 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1875  ketol-acid reductoisomerase  61.66 
 
 
331 aa  418  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000873272 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  60.43 
 
 
338 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3381  ketol-acid reductoisomerase  59.94 
 
 
339 aa  418  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  60.43 
 
 
338 aa  419  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2778  ketol-acid reductoisomerase  61.47 
 
 
339 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  60.92 
 
 
340 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2466  ketol-acid reductoisomerase  60.24 
 
 
339 aa  415  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498417  normal  0.4902 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  62.12 
 
 
336 aa  414  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2484  ketol-acid reductoisomerase  65.05 
 
 
333 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000401864  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1902  ketol-acid reductoisomerase  60.43 
 
 
330 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  61.35 
 
 
338 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2166  ketol-acid reductoisomerase  65.14 
 
 
329 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3638  ketol-acid reductoisomerase  63.72 
 
 
329 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2720  ketol-acid reductoisomerase  59.45 
 
 
339 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194376  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2857  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 
339 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.658942  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0600  ketol-acid reductoisomerase  63.91 
 
 
336 aa  417  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2142  ketol-acid reductoisomerase  61.89 
 
 
340 aa  414  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0716485  normal  0.0660754 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1496  ketol-acid reductoisomerase  61.47 
 
 
339 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0558834  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 
336 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  61.16 
 
 
338 aa  415  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 
338 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  61.82 
 
 
336 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7780  ketol-acid reductoisomerase  60.3 
 
 
331 aa  411  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.543395 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  65.03 
 
 
330 aa  414  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  60.74 
 
 
338 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1781  ketol-acid reductoisomerase  60.55 
 
 
339 aa  413  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  65.05 
 
 
330 aa  412  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1367  ketol-acid reductoisomerase  60.31 
 
 
340 aa  414  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.845865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>