More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3435 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3435  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
331 aa  682    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00388132  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2518  ketol-acid reductoisomerase  78.55 
 
 
331 aa  498  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000352718  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  70.61 
 
 
333 aa  481  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2218  ketol-acid reductoisomerase  72.21 
 
 
331 aa  477  1e-134  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  67.07 
 
 
331 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3020  ketol-acid reductoisomerase  70.69 
 
 
336 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000242382  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  68.88 
 
 
331 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  65.55 
 
 
327 aa  452  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  64.65 
 
 
331 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  67.07 
 
 
331 aa  447  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2484  ketol-acid reductoisomerase  69.49 
 
 
333 aa  448  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000401864  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  64.95 
 
 
331 aa  438  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  63.94 
 
 
331 aa  440  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  62.08 
 
 
338 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  61.63 
 
 
330 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 
329 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1690  ketol-acid reductoisomerase  68.09 
 
 
331 aa  435  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300621  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  63.33 
 
 
331 aa  437  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  66.67 
 
 
341 aa  434  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1343  ketol-acid reductoisomerase  64.95 
 
 
331 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  62.61 
 
 
338 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  64.65 
 
 
336 aa  431  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  61.59 
 
 
338 aa  431  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  67.37 
 
 
330 aa  432  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 
338 aa  433  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 
338 aa  432  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  61.77 
 
 
338 aa  429  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  61.21 
 
 
329 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  64.35 
 
 
336 aa  429  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  64.74 
 
 
330 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  61.52 
 
 
331 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  63.03 
 
 
331 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  62.42 
 
 
331 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1490  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 
339 aa  424  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  61.21 
 
 
329 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3248  ketol-acid reductoisomerase  61.52 
 
 
339 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167766  normal  0.961188 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  64.95 
 
 
341 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  60.91 
 
 
329 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  61.82 
 
 
339 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1905  ketol-acid reductoisomerase  65.96 
 
 
333 aa  426  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1853  ketol-acid reductoisomerase  63 
 
 
335 aa  422  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2166  ketol-acid reductoisomerase  65.35 
 
 
329 aa  422  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1709  ketol-acid reductoisomerase  62.61 
 
 
337 aa  422  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  64.55 
 
 
344 aa  421  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  60.91 
 
 
331 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  59.57 
 
 
338 aa  421  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  61.28 
 
 
338 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0831  ketol-acid reductoisomerase  63.75 
 
 
332 aa  420  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.357029  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  64.02 
 
 
338 aa  418  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3489  ketol-acid reductoisomerase  62.39 
 
 
335 aa  419  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1693  ketol-acid reductoisomerase  62.69 
 
 
335 aa  418  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  61.82 
 
 
335 aa  418  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0613  ketol-acid reductoisomerase  61.09 
 
 
331 aa  420  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398516  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 
338 aa  420  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1968  ketol-acid reductoisomerase  62.69 
 
 
335 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0750  ketol-acid reductoisomerase  63.75 
 
 
332 aa  420  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2319  ketol-acid reductoisomerase  59.27 
 
 
338 aa  419  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2102  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 
339 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2720  ketol-acid reductoisomerase  59.39 
 
 
339 aa  419  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194376  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 
338 aa  417  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  59.76 
 
 
338 aa  420  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0354  ketol-acid reductoisomerase  66.46 
 
 
341 aa  420  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  60.61 
 
 
329 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_735  ketol-acid reductoisomerase  63.44 
 
 
332 aa  419  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.122769  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  59.39 
 
 
330 aa  417  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1936  ketol-acid reductoisomerase  62.08 
 
 
335 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1716  ketol-acid reductoisomerase  62.39 
 
 
335 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2341  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 
339 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  60.37 
 
 
339 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0636  ketol-acid reductoisomerase  59.09 
 
 
338 aa  415  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1852  ketol-acid reductoisomerase  62.39 
 
 
335 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  60.67 
 
 
339 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3341  ketol-acid reductoisomerase  59.39 
 
 
339 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.764687  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0504  ketol-acid reductoisomerase  57.88 
 
 
338 aa  415  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000262639  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3106  ketol-acid reductoisomerase  63.22 
 
 
345 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1890  ketol-acid reductoisomerase  62.39 
 
 
335 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  62.84 
 
 
331 aa  417  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2144  ketol-acid reductoisomerase  62.5 
 
 
337 aa  415  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128688  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0410  ketol-acid reductoisomerase  62.61 
 
 
329 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  59.39 
 
 
339 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6082  ketol-acid reductoisomerase  59.09 
 
 
339 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2418  ketol-acid reductoisomerase  60.37 
 
 
339 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1519  ketol-acid reductoisomerase  62.42 
 
 
336 aa  412  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1284  ketol-acid reductoisomerase  62.42 
 
 
336 aa  411  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1668  ketol-acid reductoisomerase  62.08 
 
 
335 aa  412  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  58.97 
 
 
338 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1122  ketol-acid reductoisomerase  61.21 
 
 
336 aa  411  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0870487  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  59.09 
 
 
338 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1020  ketol-acid reductoisomerase  65.45 
 
 
331 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.488917 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10850  ketol-acid reductoisomerase  62.24 
 
 
330 aa  413  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2466  ketol-acid reductoisomerase  60.06 
 
 
339 aa  414  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498417  normal  0.4902 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42500  ketol-acid reductoisomerase  59.09 
 
 
338 aa  411  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0991  ketol-acid reductoisomerase  65.45 
 
 
331 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  59.09 
 
 
339 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  59.09 
 
 
338 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1127  ketol-acid reductoisomerase  58.54 
 
 
340 aa  412  1e-114  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1558  ketol-acid reductoisomerase  62.12 
 
 
336 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0285  ketol-acid reductoisomerase  58.18 
 
 
339 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.772607  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1310  ketol-acid reductoisomerase  62.12 
 
 
336 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1283  ketol-acid reductoisomerase  62.12 
 
 
336 aa  409  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>