More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2518 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2518  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 		 331 aa  682    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000352718  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3435  ketol-acid reductoisomerase  78.55 
 
 		 331 aa  528  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00388132  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  73.33 
 
 		 333 aa  495  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2218  ketol-acid reductoisomerase  72.81 
 
 		 331 aa  491  9.999999999999999e-139  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  71 
 
 		 331 aa  471  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3020  ketol-acid reductoisomerase  70.69 
 
 		 336 aa  463  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000242382  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  64.65 
 
 		 331 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  64.35 
 
 		 331 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  65.75 
 
 		 338 aa  449  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  67.98 
 
 		 336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  66.16 
 
 		 327 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  67.67 
 
 		 336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  65.26 
 
 		 331 aa  441  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  64.42 
 
 		 340 aa  437  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  64.95 
 
 		 331 aa  439  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  63.64 
 
 		 331 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  63.33 
 
 		 331 aa  438  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  62.73 
 
 		 335 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  64.11 
 
 		 340 aa  438  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  62.92 
 
 		 338 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1367  ketol-acid reductoisomerase  64.42 
 
 		 340 aa  440  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.845865  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  62.24 
 
 		 330 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  63.33 
 
 		 331 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  61.82 
 
 		 329 aa  434  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  61.52 
 
 		 329 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  61.52 
 
 		 329 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  63 
 
 		 338 aa  431  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  62.73 
 
 		 331 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  62.2 
 
 		 338 aa  431  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  62.73 
 
 		 331 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  62.12 
 
 		 331 aa  431  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1690  ketol-acid reductoisomerase  67.78 
 
 		 331 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300621  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0329  ketol-acid reductoisomerase  61.21 
 
 		 339 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0613  ketol-acid reductoisomerase  62.12 
 
 		 331 aa  428  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398516  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42500  ketol-acid reductoisomerase  62.08 
 
 		 338 aa  430  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  61.59 
 
 		 338 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  62.5 
 
 		 339 aa  428  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  65.56 
 
 		 330 aa  428  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0374  ketol-acid reductoisomerase  63.3 
 
 		 340 aa  429  1e-119  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  60.55 
 
 		 338 aa  428  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1127  ketol-acid reductoisomerase  61.28 
 
 		 340 aa  429  1e-119  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  61.09 
 
 		 338 aa  430  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0285  ketol-acid reductoisomerase  61.21 
 
 		 339 aa  429  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.772607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  61.21 
 
 		 329 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 		 338 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1989  ketol-acid reductoisomerase  60.55 
 
 		 338 aa  427  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0361  ketol-acid reductoisomerase  60.91 
 
 		 339 aa  424  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1343  ketol-acid reductoisomerase  64.35 
 
 		 331 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1905  ketol-acid reductoisomerase  65.96 
 
 		 333 aa  425  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  61.09 
 
 		 338 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 		 338 aa  424  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  60.55 
 
 		 338 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  61.4 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  62.5 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0983  ketol-acid reductoisomerase  60.86 
 
 		 338 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.900438  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0611  ketol-acid reductoisomerase  60.55 
 
 		 338 aa  421  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0529  ketol-acid reductoisomerase  59.33 
 
 		 338 aa  422  1e-117  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  61.21 
 
 		 339 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4786  ketol-acid reductoisomerase  60.55 
 
 		 338 aa  421  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  hitchhiker  0.00823723 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2166  ketol-acid reductoisomerase  65.65 
 
 		 329 aa  422  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  62.2 
 
 		 339 aa  422  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 		 330 aa  423  1e-117  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3248  ketol-acid reductoisomerase  61.21 
 
 		 339 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167766  normal  0.961188 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 		 329 aa  421  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1780  ketol-acid reductoisomerase  60.37 
 
 		 338 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0524  ketol-acid reductoisomerase  59.33 
 
 		 338 aa  422  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.181387  normal  0.0101595 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  65.76 
 
 		 341 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4865  ketol-acid reductoisomerase  60.24 
 
 		 338 aa  424  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  62.84 
 
 		 331 aa  423  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2144  ketol-acid reductoisomerase  62.5 
 
 		 337 aa  422  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128688  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 		 338 aa  418  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1122  ketol-acid reductoisomerase  63.33 
 
 		 336 aa  419  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0870487  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2501  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 		 338 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000349706  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0848  ketol-acid reductoisomerase  60.24 
 
 		 338 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.385412  hitchhiker  0.00438995 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2484  ketol-acid reductoisomerase  65.26 
 
 		 333 aa  420  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000401864  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1009  ketol-acid reductoisomerase  60.24 
 
 		 338 aa  419  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0031773  hitchhiker  0.000000327544 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2418  ketol-acid reductoisomerase  61.89 
 
 		 339 aa  419  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  64.05 
 
 		 341 aa  418  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 		 338 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  65.15 
 
 		 344 aa  418  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  60.3 
 
 		 339 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1490  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 		 339 aa  418  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1608  ketol-acid reductoisomerase  62.42 
 
 		 335 aa  418  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000345501  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3110  ketol-acid reductoisomerase  59.64 
 
 		 338 aa  417  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090046  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  61.16 
 
 		 336 aa  420  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  65.05 
 
 		 330 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  59.57 
 
 		 338 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  60.55 
 
 		 338 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1283  ketol-acid reductoisomerase  63.94 
 
 		 336 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1284  ketol-acid reductoisomerase  63.94 
 
 		 336 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4447  ketol-acid reductoisomerase  64.24 
 
 		 337 aa  414  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3416  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 		 339 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0116  ketol-acid reductoisomerase  60.86 
 
 		 359 aa  415  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3341  ketol-acid reductoisomerase  59.7 
 
 		 339 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.764687  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0410  ketol-acid reductoisomerase  63.53 
 
 		 329 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1581  ketol-acid reductoisomerase  60.74 
 
 		 340 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2539  ketol-acid reductoisomerase  60.37 
 
 		 338 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0383173  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2319  ketol-acid reductoisomerase  59.57 
 
 		 338 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6082  ketol-acid reductoisomerase  60.61 
 
 		 339 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1558  ketol-acid reductoisomerase  63.64 
 
 		 336 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>