More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0116 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0116  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
359 aa  733    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  62.5 
 
 
338 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  62.15 
 
 
338 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  60.42 
 
 
338 aa  443  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1061  ketol-acid reductoisomerase  61.31 
 
 
338 aa  444  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  59.94 
 
 
338 aa  438  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  60.42 
 
 
338 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0812  ketol-acid reductoisomerase  60.42 
 
 
338 aa  436  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  59.23 
 
 
338 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  58.93 
 
 
338 aa  431  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  58.63 
 
 
338 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  59.23 
 
 
338 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  59.23 
 
 
338 aa  432  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1875  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 
331 aa  430  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000873272 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  59.52 
 
 
338 aa  429  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5590  ketol-acid reductoisomerase  59.64 
 
 
338 aa  425  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2179  ketol-acid reductoisomerase  59.64 
 
 
338 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956116  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1652  ketol-acid reductoisomerase  59.64 
 
 
338 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  59.52 
 
 
338 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2301  ketol-acid reductoisomerase  59.64 
 
 
338 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0932177  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2263  ketol-acid reductoisomerase  59.64 
 
 
338 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2286  ketol-acid reductoisomerase  59.64 
 
 
338 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.465318 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  60.31 
 
 
331 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1902  ketol-acid reductoisomerase  58.97 
 
 
330 aa  421  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1015  ketol-acid reductoisomerase  59.35 
 
 
338 aa  424  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801365  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  59.52 
 
 
338 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  58.43 
 
 
338 aa  424  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2020  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 
338 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1846  ketol-acid reductoisomerase  58.93 
 
 
338 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11584  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1421  ketol-acid reductoisomerase  58.93 
 
 
338 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  59.27 
 
 
330 aa  418  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1330  ketol-acid reductoisomerase  59.23 
 
 
338 aa  420  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1047  ketol-acid reductoisomerase  58.93 
 
 
338 aa  421  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00873867  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1283  ketol-acid reductoisomerase  58.93 
 
 
338 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2319  ketol-acid reductoisomerase  58.33 
 
 
338 aa  418  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3229  ketol-acid reductoisomerase  58.93 
 
 
338 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299676  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1951  ketol-acid reductoisomerase  56.85 
 
 
338 aa  419  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1771  ketol-acid reductoisomerase  56.85 
 
 
338 aa  419  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.09387  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1115  ketol-acid reductoisomerase  58.93 
 
 
338 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1276  ketol-acid reductoisomerase  58.93 
 
 
338 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0851  ketol-acid reductoisomerase  58.66 
 
 
330 aa  419  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0751  ketol-acid reductoisomerase  58.93 
 
 
338 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0398  ketol-acid reductoisomerase  58.93 
 
 
338 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.422239  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  59.27 
 
 
330 aa  417  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0529  ketol-acid reductoisomerase  57.06 
 
 
338 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0541  ketol-acid reductoisomerase  55.79 
 
 
340 aa  417  9.999999999999999e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  58.05 
 
 
330 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0504  ketol-acid reductoisomerase  56.25 
 
 
338 aa  417  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000262639  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0524  ketol-acid reductoisomerase  57.06 
 
 
338 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.181387  normal  0.0101595 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1747  ketol-acid reductoisomerase  55.65 
 
 
347 aa  417  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.322981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3110  ketol-acid reductoisomerase  56.25 
 
 
338 aa  411  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090046  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0948  ketol-acid reductoisomerase  55.26 
 
 
340 aa  414  1e-114  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.525725  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  57.06 
 
 
340 aa  413  1e-114  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0611  ketol-acid reductoisomerase  59.2 
 
 
338 aa  413  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2775  ketol-acid reductoisomerase  55.36 
 
 
338 aa  412  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.987552  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  59.08 
 
 
327 aa  414  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2172  ketol-acid reductoisomerase  58.05 
 
 
330 aa  414  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0374  ketol-acid reductoisomerase  57.36 
 
 
340 aa  412  1e-114  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  57.85 
 
 
336 aa  412  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  56.46 
 
 
340 aa  412  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2103  ketol-acid reductoisomerase  58.33 
 
 
338 aa  412  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.124469 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  58.04 
 
 
338 aa  409  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  57.23 
 
 
330 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3073  ketol-acid reductoisomerase  56.55 
 
 
338 aa  408  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0071293 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2518  ketol-acid reductoisomerase  57.86 
 
 
338 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  58.75 
 
 
339 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2891  ketol-acid reductoisomerase  58.33 
 
 
338 aa  408  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0051674 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  60.43 
 
 
339 aa  410  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2121  ketol-acid reductoisomerase  55.95 
 
 
338 aa  409  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42500  ketol-acid reductoisomerase  56.85 
 
 
338 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2218  ketol-acid reductoisomerase  61.96 
 
 
331 aa  409  1e-113  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4865  ketol-acid reductoisomerase  55.65 
 
 
338 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  57.74 
 
 
338 aa  408  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  55.65 
 
 
338 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2501  ketol-acid reductoisomerase  56.08 
 
 
338 aa  408  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000349706  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  57.14 
 
 
338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  57.14 
 
 
338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  56.84 
 
 
330 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  57.32 
 
 
331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1367  ketol-acid reductoisomerase  56.16 
 
 
340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.845865  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  55.65 
 
 
338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1581  ketol-acid reductoisomerase  55.49 
 
 
340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3020  ketol-acid reductoisomerase  58.73 
 
 
336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000242382  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  56.31 
 
 
338 aa  404  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0983  ketol-acid reductoisomerase  58.46 
 
 
338 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.900438  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  60.92 
 
 
331 aa  401  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0848  ketol-acid reductoisomerase  58.15 
 
 
338 aa  401  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.385412  hitchhiker  0.00438995 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1989  ketol-acid reductoisomerase  55.65 
 
 
338 aa  401  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  60.62 
 
 
331 aa  403  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3228  ketol-acid reductoisomerase  58.41 
 
 
337 aa  404  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  56.97 
 
 
339 aa  404  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1009  ketol-acid reductoisomerase  57.14 
 
 
338 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0031773  hitchhiker  0.000000327544 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08830  ketol-acid reductoisomerase  58.05 
 
 
331 aa  404  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.334822  normal  0.238181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4676  ketol-acid reductoisomerase  56.25 
 
 
338 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139972  hitchhiker  0.00000000488486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6082  ketol-acid reductoisomerase  56.97 
 
 
339 aa  398  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  59.38 
 
 
331 aa  400  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3324  ketol-acid reductoisomerase  58.04 
 
 
338 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2539  ketol-acid reductoisomerase  57.44 
 
 
338 aa  401  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0383173  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4542  ketol-acid reductoisomerase  56.25 
 
 
338 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0178067  hitchhiker  0.000281434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0756  ketol-acid reductoisomerase  56.25 
 
 
338 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192415  hitchhiker  0.00000148788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>