More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08830 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_08830  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
331 aa  687    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.334822  normal  0.238181 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1875  ketol-acid reductoisomerase  72.21 
 
 
331 aa  504  9.999999999999999e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000873272 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  60.24 
 
 
330 aa  412  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1902  ketol-acid reductoisomerase  59.33 
 
 
330 aa  413  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  61.3 
 
 
330 aa  412  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1468  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 
342 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000508699  normal  0.0138391 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18790  ketol-acid reductoisomerase  61.42 
 
 
343 aa  408  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0613  ketol-acid reductoisomerase  58.18 
 
 
331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398516  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  58.36 
 
 
330 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6019  ketol-acid reductoisomerase  59.52 
 
 
337 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390752  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  58.46 
 
 
330 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0116  ketol-acid reductoisomerase  58.05 
 
 
359 aa  404  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4071  ketol-acid reductoisomerase  59.27 
 
 
342 aa  402  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  58.41 
 
 
331 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  58.54 
 
 
338 aa  399  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0851  ketol-acid reductoisomerase  57.8 
 
 
330 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13016  ketol-acid reductoisomerase  57.49 
 
 
333 aa  396  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00176679  normal  0.164078 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2819  ketol-acid reductoisomerase  58.28 
 
 
333 aa  395  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  58.15 
 
 
327 aa  395  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  57.06 
 
 
331 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2172  ketol-acid reductoisomerase  57.49 
 
 
330 aa  395  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  60.12 
 
 
338 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0867  ketol-acid reductoisomerase  57.14 
 
 
340 aa  397  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0374  ketol-acid reductoisomerase  56.5 
 
 
340 aa  393  1e-108  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  56.13 
 
 
331 aa  392  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  56.44 
 
 
329 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0504  ketol-acid reductoisomerase  56 
 
 
338 aa  391  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000262639  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3390  ketol-acid reductoisomerase  58.9 
 
 
342 aa  392  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606091  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2384  ketol-acid reductoisomerase  58.72 
 
 
341 aa  390  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0529  ketol-acid reductoisomerase  55.96 
 
 
338 aa  389  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  59.63 
 
 
331 aa  388  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  57.49 
 
 
338 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  55.83 
 
 
329 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0611  ketol-acid reductoisomerase  57.19 
 
 
338 aa  390  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  55.83 
 
 
329 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1127  ketol-acid reductoisomerase  55.29 
 
 
340 aa  389  1e-107  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3228  ketol-acid reductoisomerase  55.89 
 
 
337 aa  388  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1780  ketol-acid reductoisomerase  57.32 
 
 
338 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  55.52 
 
 
331 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  58.46 
 
 
331 aa  385  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  55.52 
 
 
329 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  55.21 
 
 
331 aa  387  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3552  ketol-acid reductoisomerase  58.59 
 
 
330 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.665615  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0541  ketol-acid reductoisomerase  55.93 
 
 
340 aa  387  1e-106  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  55.62 
 
 
338 aa  386  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  55.62 
 
 
331 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1410  ketol-acid reductoisomerase  57.67 
 
 
342 aa  387  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  58.41 
 
 
338 aa  387  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0524  ketol-acid reductoisomerase  55.66 
 
 
338 aa  387  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.181387  normal  0.0101595 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  58.41 
 
 
338 aa  387  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  55.83 
 
 
331 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1326  ketol-acid reductoisomerase  58.18 
 
 
350 aa  385  1e-106  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  55.52 
 
 
331 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2140  ketol-acid reductoisomerase  58.28 
 
 
342 aa  386  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1092  ketol-acid reductoisomerase  58.97 
 
 
331 aa  384  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3073  ketol-acid reductoisomerase  54.71 
 
 
338 aa  383  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0071293 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  55.02 
 
 
330 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1708  ketol-acid reductoisomerase  57.8 
 
 
345 aa  383  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.301189 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  57.36 
 
 
333 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  55.62 
 
 
338 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  56 
 
 
338 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  56 
 
 
338 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2537  ketol-acid reductoisomerase  58.02 
 
 
341 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00800327  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0173  ketol-acid reductoisomerase  56.67 
 
 
331 aa  381  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1879  ketol-acid reductoisomerase  57.58 
 
 
342 aa  381  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  59.5 
 
 
337 aa  381  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  53.5 
 
 
338 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1668  ketol-acid reductoisomerase  58.28 
 
 
334 aa  378  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1242  ketol-acid reductoisomerase  57.67 
 
 
340 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  54.1 
 
 
338 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2130  ketol-acid reductoisomerase  58.1 
 
 
334 aa  378  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2277  ketol-acid reductoisomerase  57.41 
 
 
341 aa  379  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  58.72 
 
 
331 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1061  ketol-acid reductoisomerase  54.71 
 
 
338 aa  380  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  54.1 
 
 
338 aa  378  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1976  ketol-acid reductoisomerase  58.1 
 
 
341 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3638  ketol-acid reductoisomerase  58.1 
 
 
329 aa  379  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  55.79 
 
 
339 aa  379  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2093  ketol-acid reductoisomerase  58.1 
 
 
334 aa  378  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0600  ketol-acid reductoisomerase  56.8 
 
 
336 aa  381  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1987  ketol-acid reductoisomerase  58.1 
 
 
341 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  56 
 
 
338 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1902  ketol-acid reductoisomerase  58.1 
 
 
341 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  55.35 
 
 
338 aa  374  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10700  ketol-acid reductoisomerase  56.13 
 
 
342 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.72382 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  53.8 
 
 
338 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  54.71 
 
 
340 aa  377  1e-103  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0983  ketol-acid reductoisomerase  55.05 
 
 
338 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.900438  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1581  ketol-acid reductoisomerase  53.5 
 
 
340 aa  377  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0848  ketol-acid reductoisomerase  55.05 
 
 
338 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.385412  hitchhiker  0.00438995 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  54.71 
 
 
338 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42500  ketol-acid reductoisomerase  55.35 
 
 
338 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2518  ketol-acid reductoisomerase  58.36 
 
 
338 aa  375  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1367  ketol-acid reductoisomerase  54.71 
 
 
340 aa  375  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.845865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8057  Ketol-acid reductoisomerase  57.36 
 
 
329 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2319  ketol-acid reductoisomerase  54.1 
 
 
338 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08890  ketol-acid reductoisomerase  59.21 
 
 
337 aa  376  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2775  ketol-acid reductoisomerase  53.96 
 
 
338 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.987552  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  56.88 
 
 
331 aa  375  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0948  ketol-acid reductoisomerase  54.1 
 
 
340 aa  377  1e-103  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.525725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>