More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1668 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1668  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 		 334 aa  685    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2093  ketol-acid reductoisomerase  89.82 
 
 		 334 aa  604  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2130  ketol-acid reductoisomerase  89.82 
 
 		 334 aa  604  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1519  ketol-acid reductoisomerase  68.79 
 
 		 336 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1283  ketol-acid reductoisomerase  68.79 
 
 		 336 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1284  ketol-acid reductoisomerase  68.79 
 
 		 336 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1558  ketol-acid reductoisomerase  68.79 
 
 		 336 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1490  ketol-acid reductoisomerase  68.48 
 
 		 336 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1310  ketol-acid reductoisomerase  68.79 
 
 		 336 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1419  ketol-acid reductoisomerase  68.79 
 
 		 336 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1452  ketol-acid reductoisomerase  68.18 
 
 		 336 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1321  ketol-acid reductoisomerase  67.88 
 
 		 336 aa  464  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3892  ketol-acid reductoisomerase  68.18 
 
 		 336 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1122  ketol-acid reductoisomerase  68.18 
 
 		 336 aa  463  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0870487  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  66.07 
 
 		 341 aa  447  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1848  ketol-acid reductoisomerase  68.94 
 
 		 340 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  64.24 
 
 		 344 aa  442  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  65.17 
 
 		 341 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  60.3 
 
 		 331 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 		 330 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 		 331 aa  427  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 		 331 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 		 331 aa  427  1e-118  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 		 331 aa  424  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1309  ketol-acid reductoisomerase  65.64 
 
 		 340 aa  427  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 		 329 aa  421  1e-117  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1905  ketol-acid reductoisomerase  64.53 
 
 		 333 aa  423  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  60.3 
 
 		 331 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1468  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 		 342 aa  421  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000508699  normal  0.0138391 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1875  ketol-acid reductoisomerase  61.04 
 
 		 331 aa  424  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000873272 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 		 329 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1690  ketol-acid reductoisomerase  63.53 
 
 		 331 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300621  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  60.3 
 
 		 337 aa  419  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  59.7 
 
 		 331 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  60.06 
 
 		 330 aa  419  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 		 329 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  59.52 
 
 		 331 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  59.58 
 
 		 338 aa  418  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  58.18 
 
 		 340 aa  419  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  60.48 
 
 		 338 aa  418  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  59.7 
 
 		 330 aa  419  1e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  58.48 
 
 		 340 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1367  ketol-acid reductoisomerase  58.18 
 
 		 340 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.845865  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  59.27 
 
 		 333 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  60.74 
 
 		 327 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  59.52 
 
 		 338 aa  417  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1581  ketol-acid reductoisomerase  58.41 
 
 		 340 aa  414  9.999999999999999e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 		 329 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  58.91 
 
 		 338 aa  412  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 		 330 aa  414  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 		 331 aa  412  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  58.91 
 
 		 338 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  57.1 
 
 		 336 aa  414  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  58.23 
 
 		 330 aa  412  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0600  ketol-acid reductoisomerase  61.33 
 
 		 336 aa  412  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18790  ketol-acid reductoisomerase  60.55 
 
 		 343 aa  411  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  57.7 
 
 		 335 aa  411  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2172  ketol-acid reductoisomerase  58.84 
 
 		 330 aa  413  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0948  ketol-acid reductoisomerase  56.67 
 
 		 340 aa  413  1e-114  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.525725  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  59.58 
 
 		 336 aa  411  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1716  ketol-acid reductoisomerase  61.16 
 
 		 335 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1693  ketol-acid reductoisomerase  61.16 
 
 		 335 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3489  ketol-acid reductoisomerase  60.55 
 
 		 335 aa  408  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1709  ketol-acid reductoisomerase  60.74 
 
 		 337 aa  409  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1968  ketol-acid reductoisomerase  60.86 
 
 		 335 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 		 331 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1852  ketol-acid reductoisomerase  61.16 
 
 		 335 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  58.73 
 
 		 339 aa  410  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  62.92 
 
 		 330 aa  410  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  59.4 
 
 		 336 aa  410  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1890  ketol-acid reductoisomerase  61.16 
 
 		 335 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  59.1 
 
 		 339 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  58.31 
 
 		 338 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  57.93 
 
 		 330 aa  409  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  57.62 
 
 		 330 aa  407  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  58.41 
 
 		 329 aa  408  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6019  ketol-acid reductoisomerase  59.51 
 
 		 337 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390752  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  57.49 
 
 		 338 aa  408  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1781  ketol-acid reductoisomerase  59.7 
 
 		 339 aa  408  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1936  ketol-acid reductoisomerase  60.24 
 
 		 335 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1668  ketol-acid reductoisomerase  60.86 
 
 		 335 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2418  ketol-acid reductoisomerase  58.51 
 
 		 339 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  56.93 
 
 		 339 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1490  ketol-acid reductoisomerase  56.93 
 
 		 339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1902  ketol-acid reductoisomerase  58.23 
 
 		 330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3248  ketol-acid reductoisomerase  57.53 
 
 		 339 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167766  normal  0.961188 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1853  ketol-acid reductoisomerase  60.24 
 
 		 335 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  60.12 
 
 		 331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2144  ketol-acid reductoisomerase  57.74 
 
 		 337 aa  404  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128688  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  56.63 
 
 		 339 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3416  ketol-acid reductoisomerase  57.23 
 
 		 339 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2277  ketol-acid reductoisomerase  61.16 
 
 		 341 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1127  ketol-acid reductoisomerase  56.62 
 
 		 340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0851  ketol-acid reductoisomerase  57.93 
 
 		 330 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  59.21 
 
 		 338 aa  402  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0613  ketol-acid reductoisomerase  56.84 
 
 		 331 aa  402  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398516  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08550  ketol-acid reductoisomerase  61.59 
 
 		 343 aa  401  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0566957  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  57.58 
 
 		 338 aa  403  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1242  ketol-acid reductoisomerase  56.29 
 
 		 340 aa  404  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2121  ketol-acid reductoisomerase  57.19 
 
 		 338 aa  404  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>