More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1875 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1875  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
331 aa  688    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000873272 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08830  ketol-acid reductoisomerase  72.21 
 
 
331 aa  504  9.999999999999999e-143  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.334822  normal  0.238181 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  63.61 
 
 
331 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  65.03 
 
 
338 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  62.92 
 
 
330 aa  434  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0374  ketol-acid reductoisomerase  62.24 
 
 
340 aa  431  1e-120  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  62.77 
 
 
338 aa  432  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  61.09 
 
 
340 aa  430  1e-119  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  62.69 
 
 
330 aa  430  1e-119  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3106  ketol-acid reductoisomerase  63.69 
 
 
345 aa  431  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1468  ketol-acid reductoisomerase  62.61 
 
 
342 aa  428  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000508699  normal  0.0138391 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0116  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 
359 aa  430  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 
340 aa  429  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1127  ketol-acid reductoisomerase  61.33 
 
 
340 aa  428  1e-119  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0851  ketol-acid reductoisomerase  62.39 
 
 
330 aa  429  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  62.73 
 
 
338 aa  425  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1367  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 
340 aa  427  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.845865  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6019  ketol-acid reductoisomerase  62.54 
 
 
337 aa  425  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390752  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1902  ketol-acid reductoisomerase  61.47 
 
 
330 aa  426  1e-118  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  63 
 
 
338 aa  424  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 
338 aa  427  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  60.86 
 
 
338 aa  427  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0613  ketol-acid reductoisomerase  61.93 
 
 
331 aa  424  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398516  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  61.96 
 
 
331 aa  421  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  62.27 
 
 
331 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  62.08 
 
 
327 aa  424  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4071  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 
342 aa  423  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  62.04 
 
 
330 aa  422  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  61.77 
 
 
338 aa  421  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  61.04 
 
 
330 aa  421  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0948  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 
340 aa  421  1e-117  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.525725  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  59.57 
 
 
331 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  63.91 
 
 
338 aa  419  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  61.66 
 
 
331 aa  418  1e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  63.41 
 
 
339 aa  421  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  61.66 
 
 
339 aa  418  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  63.91 
 
 
338 aa  419  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  63.55 
 
 
337 aa  418  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  61.35 
 
 
331 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  65.24 
 
 
338 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  60.74 
 
 
329 aa  415  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1581  ketol-acid reductoisomerase  59.27 
 
 
340 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  61.35 
 
 
331 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1092  ketol-acid reductoisomerase  63.22 
 
 
331 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  60.43 
 
 
331 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2172  ketol-acid reductoisomerase  60.86 
 
 
330 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0867  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 
340 aa  415  9.999999999999999e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0504  ketol-acid reductoisomerase  60.31 
 
 
338 aa  415  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000262639  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2819  ketol-acid reductoisomerase  60.74 
 
 
333 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0600  ketol-acid reductoisomerase  62.54 
 
 
336 aa  416  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  61.77 
 
 
331 aa  416  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1780  ketol-acid reductoisomerase  60.06 
 
 
338 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  60.12 
 
 
329 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1343  ketol-acid reductoisomerase  62.39 
 
 
331 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  62.69 
 
 
331 aa  413  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0541  ketol-acid reductoisomerase  58.97 
 
 
340 aa  412  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  60.43 
 
 
329 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3638  ketol-acid reductoisomerase  63 
 
 
329 aa  412  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  62.39 
 
 
331 aa  412  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1496  ketol-acid reductoisomerase  60.98 
 
 
339 aa  413  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0558834  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  61.59 
 
 
338 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1879  ketol-acid reductoisomerase  62.42 
 
 
342 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  59.33 
 
 
336 aa  409  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2501  ketol-acid reductoisomerase  60.55 
 
 
338 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000349706  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0173  ketol-acid reductoisomerase  61.21 
 
 
331 aa  408  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1545  ketol-acid reductoisomerase  58.46 
 
 
340 aa  409  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.159876  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42500  ketol-acid reductoisomerase  60.92 
 
 
338 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1902  ketol-acid reductoisomerase  62.69 
 
 
341 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 
338 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 
330 aa  408  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 
338 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1962  ketol-acid reductoisomerase  60.37 
 
 
339 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.971323  normal  0.40215 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  59.2 
 
 
329 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  60.31 
 
 
338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2518  ketol-acid reductoisomerase  62.08 
 
 
338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  60.74 
 
 
339 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1976  ketol-acid reductoisomerase  62.69 
 
 
341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2142  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 
340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0716485  normal  0.0660754 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3248  ketol-acid reductoisomerase  59.45 
 
 
339 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167766  normal  0.961188 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2093  ketol-acid reductoisomerase  61.77 
 
 
334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1987  ketol-acid reductoisomerase  62.69 
 
 
341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1242  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 
340 aa  404  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2130  ketol-acid reductoisomerase  61.77 
 
 
334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3552  ketol-acid reductoisomerase  61.85 
 
 
330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.665615  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  59.45 
 
 
339 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1907  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 
339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.022886  hitchhiker  0.0000179587 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1668  ketol-acid reductoisomerase  61.04 
 
 
334 aa  402  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  58.9 
 
 
333 aa  404  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18790  ketol-acid reductoisomerase  62.65 
 
 
343 aa  404  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4447  ketol-acid reductoisomerase  63.38 
 
 
337 aa  404  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1905  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 
333 aa  401  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0529  ketol-acid reductoisomerase  58.41 
 
 
338 aa  401  1e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  59.02 
 
 
338 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1989  ketol-acid reductoisomerase  59.63 
 
 
338 aa  404  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3228  ketol-acid reductoisomerase  57.1 
 
 
337 aa  402  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0611  ketol-acid reductoisomerase  59.63 
 
 
338 aa  403  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  57.49 
 
 
338 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2121  ketol-acid reductoisomerase  58.05 
 
 
338 aa  403  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2466  ketol-acid reductoisomerase  60.74 
 
 
339 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498417  normal  0.4902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6082  ketol-acid reductoisomerase  58.79 
 
 
339 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>