More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3106 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3106  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
345 aa  714    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1242  ketol-acid reductoisomerase  65.27 
 
 
340 aa  467  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4447  ketol-acid reductoisomerase  67.66 
 
 
337 aa  462  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1875  ketol-acid reductoisomerase  63.69 
 
 
331 aa  452  1.0000000000000001e-126  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000873272 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  63.03 
 
 
335 aa  448  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1966  ketol-acid reductoisomerase  66.67 
 
 
340 aa  449  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1555  ketol-acid reductoisomerase  65.77 
 
 
340 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  60.83 
 
 
338 aa  438  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  63.41 
 
 
331 aa  434  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6019  ketol-acid reductoisomerase  62.69 
 
 
337 aa  435  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390752  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 
330 aa  434  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  63.11 
 
 
331 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  63.11 
 
 
331 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  60.98 
 
 
331 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  62.02 
 
 
338 aa  432  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  63.41 
 
 
337 aa  428  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  60.42 
 
 
338 aa  427  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0613  ketol-acid reductoisomerase  62.5 
 
 
331 aa  431  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398516  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  62.8 
 
 
331 aa  428  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  63.11 
 
 
331 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  60.24 
 
 
333 aa  430  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1879  ketol-acid reductoisomerase  63.14 
 
 
342 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  64.63 
 
 
336 aa  429  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  59.52 
 
 
340 aa  425  1e-118  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  60.83 
 
 
338 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 
331 aa  425  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  59.23 
 
 
340 aa  424  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  64.33 
 
 
336 aa  427  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  59.35 
 
 
338 aa  424  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  61.89 
 
 
331 aa  424  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  64.13 
 
 
330 aa  424  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  59.05 
 
 
338 aa  421  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  58.16 
 
 
338 aa  422  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  58.46 
 
 
338 aa  420  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 
338 aa  419  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  58.46 
 
 
338 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  60.37 
 
 
329 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  59.35 
 
 
338 aa  421  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0504  ketol-acid reductoisomerase  58.75 
 
 
338 aa  419  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000262639  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  58.16 
 
 
338 aa  418  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1367  ketol-acid reductoisomerase  58.93 
 
 
340 aa  419  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.845865  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  60.06 
 
 
329 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0831  ketol-acid reductoisomerase  62.05 
 
 
332 aa  415  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.357029  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  59.94 
 
 
338 aa  414  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0750  ketol-acid reductoisomerase  61.45 
 
 
332 aa  414  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  58.64 
 
 
330 aa  415  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1902  ketol-acid reductoisomerase  58.59 
 
 
330 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  57.57 
 
 
338 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1545  ketol-acid reductoisomerase  58.28 
 
 
340 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.159876  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0948  ketol-acid reductoisomerase  58.63 
 
 
340 aa  415  9.999999999999999e-116  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.525725  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  60.06 
 
 
329 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  60.74 
 
 
327 aa  415  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2319  ketol-acid reductoisomerase  57.27 
 
 
338 aa  415  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  57.99 
 
 
339 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  59.94 
 
 
338 aa  414  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3435  ketol-acid reductoisomerase  63.22 
 
 
331 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00388132  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  58.16 
 
 
338 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_735  ketol-acid reductoisomerase  61.75 
 
 
332 aa  415  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.122769  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1127  ketol-acid reductoisomerase  58.04 
 
 
340 aa  414  9.999999999999999e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  58.16 
 
 
338 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0867  ketol-acid reductoisomerase  58.33 
 
 
340 aa  412  1e-114  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2172  ketol-acid reductoisomerase  58.59 
 
 
330 aa  411  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  59.28 
 
 
338 aa  413  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4354  ketol-acid reductoisomerase  63.41 
 
 
336 aa  413  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00327651  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  58.59 
 
 
330 aa  412  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08890  ketol-acid reductoisomerase  62.69 
 
 
337 aa  413  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  58.64 
 
 
330 aa  412  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18790  ketol-acid reductoisomerase  61.77 
 
 
343 aa  412  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  59.51 
 
 
330 aa  412  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  59.45 
 
 
329 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3248  ketol-acid reductoisomerase  56.51 
 
 
339 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167766  normal  0.961188 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2466  ketol-acid reductoisomerase  56.8 
 
 
339 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498417  normal  0.4902 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1122  ketol-acid reductoisomerase  62.57 
 
 
336 aa  412  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0870487  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  58.68 
 
 
336 aa  414  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  56.51 
 
 
339 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  61.59 
 
 
331 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  57.86 
 
 
338 aa  414  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0851  ketol-acid reductoisomerase  58.28 
 
 
330 aa  411  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  58.58 
 
 
339 aa  413  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1519  ketol-acid reductoisomerase  61.42 
 
 
336 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2484  ketol-acid reductoisomerase  62.61 
 
 
333 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000401864  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1780  ketol-acid reductoisomerase  59.1 
 
 
338 aa  408  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1283  ketol-acid reductoisomerase  61.82 
 
 
336 aa  408  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1284  ketol-acid reductoisomerase  61.82 
 
 
336 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1846  ketol-acid reductoisomerase  59.05 
 
 
338 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11584  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1092  ketol-acid reductoisomerase  61.59 
 
 
331 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1421  ketol-acid reductoisomerase  59.05 
 
 
338 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2518  ketol-acid reductoisomerase  60.24 
 
 
338 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1283  ketol-acid reductoisomerase  59.05 
 
 
338 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1047  ketol-acid reductoisomerase  59.35 
 
 
338 aa  411  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00873867  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1558  ketol-acid reductoisomerase  61.13 
 
 
336 aa  408  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2891  ketol-acid reductoisomerase  58.75 
 
 
338 aa  411  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0051674 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0398  ketol-acid reductoisomerase  59.05 
 
 
338 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.422239  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2103  ketol-acid reductoisomerase  58.46 
 
 
338 aa  410  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.124469 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2418  ketol-acid reductoisomerase  57.4 
 
 
339 aa  409  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1330  ketol-acid reductoisomerase  58.75 
 
 
338 aa  408  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1115  ketol-acid reductoisomerase  59.05 
 
 
338 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1276  ketol-acid reductoisomerase  59.05 
 
 
338 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0751  ketol-acid reductoisomerase  59.05 
 
 
338 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2121  ketol-acid reductoisomerase  58.16 
 
 
338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>