More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1966 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1966  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 		 340 aa  702    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1555  ketol-acid reductoisomerase  96.76 
 
 		 340 aa  661    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1242  ketol-acid reductoisomerase  82.65 
 
 		 340 aa  593  1e-168  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4447  ketol-acid reductoisomerase  74.4 
 
 		 337 aa  523  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  63.64 
 
 		 333 aa  454  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  64.35 
 
 		 335 aa  448  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3106  ketol-acid reductoisomerase  66.67 
 
 		 345 aa  449  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  65.58 
 
 		 344 aa  441  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  63.53 
 
 		 331 aa  438  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  64.24 
 
 		 331 aa  434  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  63.96 
 
 		 336 aa  432  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  64.26 
 
 		 336 aa  432  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  63.13 
 
 		 341 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 		 331 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  62.88 
 
 		 327 aa  431  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  61.4 
 
 		 330 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  61.33 
 
 		 331 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  62.05 
 
 		 341 aa  424  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  61.09 
 
 		 331 aa  421  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2484  ketol-acid reductoisomerase  63.8 
 
 		 333 aa  422  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000401864  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1879  ketol-acid reductoisomerase  64.02 
 
 		 342 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  59.94 
 
 		 338 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 		 331 aa  418  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  62.61 
 
 		 331 aa  417  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 		 331 aa  419  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  59.45 
 
 		 330 aa  419  1e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  59.34 
 
 		 338 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 		 331 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  64.74 
 
 		 330 aa  415  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  61.93 
 
 		 331 aa  417  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 		 331 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 		 331 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0831  ketol-acid reductoisomerase  60.54 
 
 		 332 aa  411  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.357029  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1693  ketol-acid reductoisomerase  61.63 
 
 		 335 aa  411  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1987  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 		 341 aa  411  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  60.43 
 
 		 330 aa  411  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1976  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 		 341 aa  411  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1853  ketol-acid reductoisomerase  61.63 
 
 		 335 aa  412  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2144  ketol-acid reductoisomerase  61.68 
 
 		 337 aa  414  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128688  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1902  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 		 341 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1193  ketol-acid reductoisomerase  62.84 
 
 		 334 aa  413  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  59.21 
 
 		 338 aa  413  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1519  ketol-acid reductoisomerase  60.73 
 
 		 336 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1716  ketol-acid reductoisomerase  61.33 
 
 		 335 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1283  ketol-acid reductoisomerase  60.73 
 
 		 336 aa  407  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1284  ketol-acid reductoisomerase  60.73 
 
 		 336 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1890  ketol-acid reductoisomerase  61.33 
 
 		 335 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1852  ketol-acid reductoisomerase  61.33 
 
 		 335 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2142  ketol-acid reductoisomerase  60.61 
 
 		 340 aa  410  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0716485  normal  0.0660754 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1968  ketol-acid reductoisomerase  61.33 
 
 		 335 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1558  ketol-acid reductoisomerase  60.73 
 
 		 336 aa  408  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0948  ketol-acid reductoisomerase  57.23 
 
 		 340 aa  410  1e-113  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.525725  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1709  ketol-acid reductoisomerase  61.59 
 
 		 337 aa  410  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  59.63 
 
 		 329 aa  409  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1490  ketol-acid reductoisomerase  60.73 
 
 		 336 aa  408  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6019  ketol-acid reductoisomerase  60.24 
 
 		 337 aa  408  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390752  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3489  ketol-acid reductoisomerase  61.03 
 
 		 335 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  58.66 
 
 		 329 aa  408  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4071  ketol-acid reductoisomerase  60.37 
 
 		 342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0750  ketol-acid reductoisomerase  59.64 
 
 		 332 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1936  ketol-acid reductoisomerase  61.03 
 
 		 335 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  57.1 
 
 		 340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1310  ketol-acid reductoisomerase  60.42 
 
 		 336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_735  ketol-acid reductoisomerase  59.64 
 
 		 332 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.122769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3892  ketol-acid reductoisomerase  60.42 
 
 		 336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  59.2 
 
 		 330 aa  404  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  57.83 
 
 		 338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  59.34 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1419  ketol-acid reductoisomerase  60.42 
 
 		 336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  59.34 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  58.36 
 
 		 329 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1875  ketol-acid reductoisomerase  60.74 
 
 		 331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000873272 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  58.36 
 
 		 329 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1343  ketol-acid reductoisomerase  61.63 
 
 		 331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1321  ketol-acid reductoisomerase  60.12 
 
 		 336 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1496  ketol-acid reductoisomerase  58.43 
 
 		 339 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0558834  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  57.83 
 
 		 338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1452  ketol-acid reductoisomerase  60.42 
 
 		 336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0851  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 		 330 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  56.19 
 
 		 340 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  58.73 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  59.51 
 
 		 330 aa  401  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  58.13 
 
 		 338 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1668  ketol-acid reductoisomerase  61.03 
 
 		 335 aa  404  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3552  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 		 330 aa  403  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.665615  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  60.12 
 
 		 330 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1907  ketol-acid reductoisomerase  59.09 
 
 		 339 aa  402  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.022886  hitchhiker  0.0000179587 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0374  ketol-acid reductoisomerase  56.8 
 
 		 340 aa  404  1e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3638  ketol-acid reductoisomerase  63.41 
 
 		 329 aa  404  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0991  ketol-acid reductoisomerase  63.14 
 
 		 331 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1245  ketol-acid reductoisomerase  58.59 
 
 		 331 aa  402  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0867  ketol-acid reductoisomerase  56.02 
 
 		 340 aa  403  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1122  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 		 336 aa  403  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0870487  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1367  ketol-acid reductoisomerase  56.5 
 
 		 340 aa  402  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.845865  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2984  ketol-acid reductoisomerase  61.45 
 
 		 333 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0372563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3026  ketol-acid reductoisomerase  61.45 
 
 		 333 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1020  ketol-acid reductoisomerase  63.14 
 
 		 331 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.488917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1092  ketol-acid reductoisomerase  62.5 
 
 		 331 aa  398  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2518  ketol-acid reductoisomerase  60.54 
 
 		 338 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1545  ketol-acid reductoisomerase  59.45 
 
 		 340 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.159876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>