More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3026 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2984  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 		 333 aa  681    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0372563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3026  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 		 333 aa  681    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  67.58 
 
 		 329 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  62.73 
 
 		 333 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  60.06 
 
 		 338 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  62.69 
 
 		 331 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  60.66 
 
 		 338 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  59.76 
 
 		 338 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  62.39 
 
 		 330 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  59.46 
 
 		 338 aa  438  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  64.83 
 
 		 330 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  59.16 
 
 		 338 aa  433  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0410  ketol-acid reductoisomerase  63.61 
 
 		 329 aa  428  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 		 339 aa  428  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  65.54 
 
 		 330 aa  429  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1690  ketol-acid reductoisomerase  65.44 
 
 		 331 aa  430  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300621  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  59.16 
 
 		 338 aa  425  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1905  ketol-acid reductoisomerase  64.53 
 
 		 333 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  58.36 
 
 		 330 aa  424  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  61.85 
 
 		 335 aa  426  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2144  ketol-acid reductoisomerase  60.9 
 
 		 337 aa  426  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128688  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  60.06 
 
 		 339 aa  423  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1490  ketol-acid reductoisomerase  59.58 
 
 		 339 aa  424  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2166  ketol-acid reductoisomerase  64.53 
 
 		 329 aa  423  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1936  ketol-acid reductoisomerase  62.84 
 
 		 335 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2484  ketol-acid reductoisomerase  64.72 
 
 		 333 aa  419  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000401864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1693  ketol-acid reductoisomerase  62.84 
 
 		 335 aa  417  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1193  ketol-acid reductoisomerase  62.2 
 
 		 334 aa  419  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  62.15 
 
 		 336 aa  418  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1242  ketol-acid reductoisomerase  61.04 
 
 		 340 aa  419  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1853  ketol-acid reductoisomerase  63.14 
 
 		 335 aa  421  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1709  ketol-acid reductoisomerase  63.61 
 
 		 337 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  61.04 
 
 		 331 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1968  ketol-acid reductoisomerase  63.14 
 
 		 335 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  57.96 
 
 		 338 aa  420  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  58.08 
 
 		 339 aa  419  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3416  ketol-acid reductoisomerase  59.15 
 
 		 339 aa  418  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2142  ketol-acid reductoisomerase  60.3 
 
 		 340 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0716485  normal  0.0660754 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  61.66 
 
 		 331 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1716  ketol-acid reductoisomerase  62.84 
 
 		 335 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2466  ketol-acid reductoisomerase  58.08 
 
 		 339 aa  416  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498417  normal  0.4902 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  59.16 
 
 		 338 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  62.15 
 
 		 336 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1852  ketol-acid reductoisomerase  62.84 
 
 		 335 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0361  ketol-acid reductoisomerase  58.54 
 
 		 339 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0329  ketol-acid reductoisomerase  58.54 
 
 		 339 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1890  ketol-acid reductoisomerase  62.84 
 
 		 335 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  59.16 
 
 		 338 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3489  ketol-acid reductoisomerase  63.14 
 
 		 335 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0285  ketol-acid reductoisomerase  58.54 
 
 		 339 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.772607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  63.11 
 
 		 344 aa  415  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2418  ketol-acid reductoisomerase  58.08 
 
 		 339 aa  416  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1668  ketol-acid reductoisomerase  62.54 
 
 		 335 aa  413  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  59.2 
 
 		 331 aa  411  1e-114  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  59.2 
 
 		 331 aa  411  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  60.73 
 
 		 341 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  57.06 
 
 		 338 aa  413  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1907  ketol-acid reductoisomerase  59.09 
 
 		 339 aa  411  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.022886  hitchhiker  0.0000179587 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  60.55 
 
 		 330 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  58.23 
 
 		 339 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  57.06 
 
 		 336 aa  413  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6082  ketol-acid reductoisomerase  57.62 
 
 		 339 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2341  ketol-acid reductoisomerase  56.59 
 
 		 339 aa  410  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3341  ketol-acid reductoisomerase  57.93 
 
 		 339 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.764687  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  61.04 
 
 		 341 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2102  ketol-acid reductoisomerase  57.62 
 
 		 339 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1966  ketol-acid reductoisomerase  61.45 
 
 		 340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  58.26 
 
 		 338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  56.89 
 
 		 339 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10850  ketol-acid reductoisomerase  58.54 
 
 		 330 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1989  ketol-acid reductoisomerase  56.16 
 
 		 338 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2857  ketol-acid reductoisomerase  58.84 
 
 		 339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.658942  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  60.24 
 
 		 330 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0541  ketol-acid reductoisomerase  54.95 
 
 		 340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  58.28 
 
 		 331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3248  ketol-acid reductoisomerase  57.01 
 
 		 339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167766  normal  0.961188 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2720  ketol-acid reductoisomerase  56.71 
 
 		 339 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194376  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3381  ketol-acid reductoisomerase  56.59 
 
 		 339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0867  ketol-acid reductoisomerase  54.95 
 
 		 340 aa  404  1.0000000000000001e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1519  ketol-acid reductoisomerase  60.74 
 
 		 336 aa  401  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  60.74 
 
 		 331 aa  404  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1283  ketol-acid reductoisomerase  61.04 
 
 		 336 aa  404  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0613  ketol-acid reductoisomerase  59.2 
 
 		 331 aa  402  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398516  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  59.69 
 
 		 327 aa  403  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4447  ketol-acid reductoisomerase  62.08 
 
 		 337 aa  402  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0948  ketol-acid reductoisomerase  54.95 
 
 		 340 aa  404  1e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.525725  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0065  ketol-acid reductoisomerase  61.35 
 
 		 333 aa  401  1e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000348279  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1472  ketol-acid reductoisomerase  56.01 
 
 		 346 aa  404  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1496  ketol-acid reductoisomerase  55.39 
 
 		 339 aa  403  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0558834  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2492  ketol-acid reductoisomerase  54.49 
 
 		 339 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal  0.156046 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  54.95 
 
 		 338 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  54.95 
 
 		 338 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1581  ketol-acid reductoisomerase  54.95 
 
 		 340 aa  403  1e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  57.62 
 
 		 331 aa  401  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1452  ketol-acid reductoisomerase  60.74 
 
 		 336 aa  401  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_735  ketol-acid reductoisomerase  58.66 
 
 		 332 aa  401  1e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.122769  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1558  ketol-acid reductoisomerase  61.04 
 
 		 336 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2559  ketol-acid reductoisomerase  59.15 
 
 		 339 aa  402  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2518  ketol-acid reductoisomerase  56.76 
 
 		 338 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1555  ketol-acid reductoisomerase  61.14 
 
 		 340 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>