More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2166 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2166  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
329 aa  680    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  84.5 
 
 
330 aa  558  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1690  ketol-acid reductoisomerase  84.5 
 
 
331 aa  548  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300621  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1905  ketol-acid reductoisomerase  81.46 
 
 
333 aa  528  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  73.09 
 
 
327 aa  502  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  71.12 
 
 
329 aa  502  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0410  ketol-acid reductoisomerase  73.86 
 
 
329 aa  499  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  69.21 
 
 
331 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  69 
 
 
338 aa  473  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  65.35 
 
 
330 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  64.13 
 
 
338 aa  457  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  67.28 
 
 
338 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  65.35 
 
 
338 aa  458  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  64.63 
 
 
338 aa  460  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  63.22 
 
 
330 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  65.75 
 
 
338 aa  456  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  69.51 
 
 
331 aa  456  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  65.65 
 
 
338 aa  456  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  68.9 
 
 
331 aa  456  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  64.44 
 
 
331 aa  455  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  67.89 
 
 
344 aa  451  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  64.74 
 
 
338 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1343  ketol-acid reductoisomerase  68.6 
 
 
331 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  64.94 
 
 
338 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2484  ketol-acid reductoisomerase  69.51 
 
 
333 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000401864  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  65.14 
 
 
331 aa  448  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  65.55 
 
 
339 aa  450  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1367  ketol-acid reductoisomerase  63.91 
 
 
340 aa  449  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.845865  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  63.91 
 
 
336 aa  447  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  63.61 
 
 
340 aa  447  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  63.61 
 
 
340 aa  445  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  62.69 
 
 
330 aa  444  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  63.53 
 
 
338 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1709  ketol-acid reductoisomerase  66.57 
 
 
337 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1951  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 
338 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2319  ketol-acid reductoisomerase  62.61 
 
 
338 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  63.3 
 
 
333 aa  444  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  63.53 
 
 
338 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  63.33 
 
 
339 aa  444  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1968  ketol-acid reductoisomerase  67.28 
 
 
335 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3110  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 
338 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090046  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1771  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 
338 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.09387  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  67.38 
 
 
341 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0948  ketol-acid reductoisomerase  62.08 
 
 
340 aa  442  1e-123  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.525725  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1853  ketol-acid reductoisomerase  66.67 
 
 
335 aa  443  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  67.89 
 
 
341 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  64.53 
 
 
331 aa  444  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 
330 aa  441  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2121  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 
338 aa  444  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  62.92 
 
 
338 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1472  ketol-acid reductoisomerase  62.61 
 
 
346 aa  443  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  67.07 
 
 
331 aa  444  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 
330 aa  441  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1747  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 
347 aa  443  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.322981 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  65.85 
 
 
331 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1936  ketol-acid reductoisomerase  66.67 
 
 
335 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1716  ketol-acid reductoisomerase  66.36 
 
 
335 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1693  ketol-acid reductoisomerase  66.36 
 
 
335 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0354  ketol-acid reductoisomerase  68.9 
 
 
341 aa  438  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1852  ketol-acid reductoisomerase  66.36 
 
 
335 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 
338 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2775  ketol-acid reductoisomerase  62.2 
 
 
338 aa  438  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.987552  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3381  ketol-acid reductoisomerase  63.03 
 
 
339 aa  439  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1020  ketol-acid reductoisomerase  69.42 
 
 
331 aa  438  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.488917 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3489  ketol-acid reductoisomerase  66.06 
 
 
335 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1890  ketol-acid reductoisomerase  66.36 
 
 
335 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0991  ketol-acid reductoisomerase  69.42 
 
 
331 aa  438  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  63.41 
 
 
338 aa  438  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  63.3 
 
 
331 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  65.85 
 
 
338 aa  437  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 
338 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1519  ketol-acid reductoisomerase  66.06 
 
 
336 aa  435  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1310  ketol-acid reductoisomerase  66.06 
 
 
336 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1284  ketol-acid reductoisomerase  66.36 
 
 
336 aa  437  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1490  ketol-acid reductoisomerase  66.06 
 
 
336 aa  434  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  61.47 
 
 
338 aa  437  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4865  ketol-acid reductoisomerase  59.57 
 
 
338 aa  435  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1419  ketol-acid reductoisomerase  66.06 
 
 
336 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  62.42 
 
 
339 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  64.53 
 
 
336 aa  434  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2103  ketol-acid reductoisomerase  63.11 
 
 
338 aa  437  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.124469 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1780  ketol-acid reductoisomerase  60.67 
 
 
338 aa  434  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1127  ketol-acid reductoisomerase  59.27 
 
 
340 aa  435  1e-121  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  63.91 
 
 
331 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  59.94 
 
 
338 aa  431  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1283  ketol-acid reductoisomerase  65.75 
 
 
336 aa  433  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1321  ketol-acid reductoisomerase  66.06 
 
 
336 aa  434  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1558  ketol-acid reductoisomerase  65.75 
 
 
336 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  63 
 
 
331 aa  431  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1989  ketol-acid reductoisomerase  60.55 
 
 
338 aa  434  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2341  ketol-acid reductoisomerase  62.12 
 
 
339 aa  434  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2518  ketol-acid reductoisomerase  62.92 
 
 
338 aa  432  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3435  ketol-acid reductoisomerase  65.35 
 
 
331 aa  431  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00388132  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  67.28 
 
 
330 aa  431  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  63.91 
 
 
338 aa  432  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  63.41 
 
 
339 aa  433  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  62.39 
 
 
331 aa  431  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1452  ketol-acid reductoisomerase  65.44 
 
 
336 aa  431  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1122  ketol-acid reductoisomerase  65.75 
 
 
336 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0870487  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3026  ketol-acid reductoisomerase  64.53 
 
 
333 aa  432  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.219596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>