More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1690 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1690  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
331 aa  674    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300621  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  91.21 
 
 
330 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2166  ketol-acid reductoisomerase  84.5 
 
 
329 aa  548  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1905  ketol-acid reductoisomerase  84.5 
 
 
333 aa  548  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  71.12 
 
 
329 aa  503  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0410  ketol-acid reductoisomerase  74.47 
 
 
329 aa  494  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  70.64 
 
 
327 aa  481  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  69.82 
 
 
331 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  67.17 
 
 
330 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  68.5 
 
 
333 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  66.06 
 
 
331 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  67.88 
 
 
338 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  64.63 
 
 
338 aa  463  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1709  ketol-acid reductoisomerase  69.3 
 
 
337 aa  461  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  65.76 
 
 
338 aa  463  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  64.24 
 
 
330 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1853  ketol-acid reductoisomerase  69.42 
 
 
335 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  67.38 
 
 
339 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  70.43 
 
 
331 aa  460  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1968  ketol-acid reductoisomerase  69.11 
 
 
335 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1519  ketol-acid reductoisomerase  68.18 
 
 
336 aa  456  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1367  ketol-acid reductoisomerase  63.64 
 
 
340 aa  455  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.845865  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1310  ketol-acid reductoisomerase  68.18 
 
 
336 aa  455  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1283  ketol-acid reductoisomerase  68.48 
 
 
336 aa  456  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1284  ketol-acid reductoisomerase  68.18 
 
 
336 aa  455  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  69.51 
 
 
331 aa  455  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1419  ketol-acid reductoisomerase  68.18 
 
 
336 aa  455  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  64.55 
 
 
338 aa  456  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  68.09 
 
 
344 aa  454  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3020  ketol-acid reductoisomerase  67.17 
 
 
336 aa  454  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000242382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3489  ketol-acid reductoisomerase  69.11 
 
 
335 aa  457  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  65.56 
 
 
339 aa  456  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1122  ketol-acid reductoisomerase  68.18 
 
 
336 aa  456  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0870487  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  64.55 
 
 
338 aa  457  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1936  ketol-acid reductoisomerase  68.81 
 
 
335 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  63.33 
 
 
340 aa  451  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1716  ketol-acid reductoisomerase  68.5 
 
 
335 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2484  ketol-acid reductoisomerase  69.82 
 
 
333 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000401864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1890  ketol-acid reductoisomerase  68.5 
 
 
335 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1321  ketol-acid reductoisomerase  67.88 
 
 
336 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3892  ketol-acid reductoisomerase  67.88 
 
 
336 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  64.85 
 
 
330 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1852  ketol-acid reductoisomerase  68.5 
 
 
335 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1452  ketol-acid reductoisomerase  67.88 
 
 
336 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1490  ketol-acid reductoisomerase  67.58 
 
 
336 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1558  ketol-acid reductoisomerase  67.88 
 
 
336 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1127  ketol-acid reductoisomerase  62.92 
 
 
340 aa  451  1.0000000000000001e-126  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  63.33 
 
 
340 aa  454  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1693  ketol-acid reductoisomerase  68.2 
 
 
335 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1668  ketol-acid reductoisomerase  68.5 
 
 
335 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  69 
 
 
341 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  65.45 
 
 
338 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3381  ketol-acid reductoisomerase  64.65 
 
 
339 aa  449  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  64.55 
 
 
338 aa  447  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1343  ketol-acid reductoisomerase  67.48 
 
 
331 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  63.64 
 
 
330 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1902  ketol-acid reductoisomerase  63.94 
 
 
330 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  65.75 
 
 
331 aa  444  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3248  ketol-acid reductoisomerase  64.24 
 
 
339 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167766  normal  0.961188 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2319  ketol-acid reductoisomerase  63.33 
 
 
338 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2103  ketol-acid reductoisomerase  64.94 
 
 
338 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.124469 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  63.94 
 
 
339 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  64.63 
 
 
338 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0948  ketol-acid reductoisomerase  61.82 
 
 
340 aa  445  1.0000000000000001e-124  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.525725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  63.83 
 
 
338 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  64.05 
 
 
339 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1496  ketol-acid reductoisomerase  64.65 
 
 
339 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0558834  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  63.94 
 
 
338 aa  444  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  64.55 
 
 
338 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  63.72 
 
 
338 aa  444  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  62.39 
 
 
336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1193  ketol-acid reductoisomerase  66.57 
 
 
334 aa  442  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0285  ketol-acid reductoisomerase  63.14 
 
 
339 aa  442  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.772607  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1907  ketol-acid reductoisomerase  64.05 
 
 
339 aa  441  1e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.022886  hitchhiker  0.0000179587 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1781  ketol-acid reductoisomerase  64.35 
 
 
339 aa  442  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  65.44 
 
 
331 aa  442  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  65.14 
 
 
338 aa  444  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  64.63 
 
 
339 aa  442  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2891  ketol-acid reductoisomerase  64.94 
 
 
338 aa  442  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0051674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0329  ketol-acid reductoisomerase  63.14 
 
 
339 aa  442  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2778  ketol-acid reductoisomerase  63.44 
 
 
339 aa  441  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  63.03 
 
 
330 aa  442  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  68.39 
 
 
331 aa  442  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2121  ketol-acid reductoisomerase  62.42 
 
 
338 aa  444  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  66.57 
 
 
331 aa  441  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  67.48 
 
 
341 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3435  ketol-acid reductoisomerase  68.09 
 
 
331 aa  444  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00388132  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  62.69 
 
 
338 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  66.77 
 
 
338 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  63.33 
 
 
338 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0991  ketol-acid reductoisomerase  70.21 
 
 
331 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  62.5 
 
 
330 aa  438  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0361  ketol-acid reductoisomerase  62.84 
 
 
339 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1962  ketol-acid reductoisomerase  63.75 
 
 
339 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.971323  normal  0.40215 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2144  ketol-acid reductoisomerase  65.57 
 
 
337 aa  437  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128688  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3416  ketol-acid reductoisomerase  62.84 
 
 
339 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2984  ketol-acid reductoisomerase  65.44 
 
 
333 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0372563  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3026  ketol-acid reductoisomerase  65.44 
 
 
333 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1020  ketol-acid reductoisomerase  70.21 
 
 
331 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.488917 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  63.91 
 
 
331 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>