More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3020 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3020  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 		 336 aa  697    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000242382  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  67.47 
 
 		 333 aa  484  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  65.56 
 
 		 331 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3435  ketol-acid reductoisomerase  70.69 
 
 		 331 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00388132  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  63.66 
 
 		 338 aa  461  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  64.24 
 
 		 331 aa  458  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  66.97 
 
 		 331 aa  455  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  67.67 
 
 		 331 aa  455  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  61.56 
 
 		 338 aa  456  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  64.53 
 
 		 327 aa  451  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  62.42 
 
 		 330 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  62.65 
 
 		 340 aa  448  1e-125  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1367  ketol-acid reductoisomerase  62.95 
 
 		 340 aa  449  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.845865  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  62.05 
 
 		 340 aa  449  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3381  ketol-acid reductoisomerase  62.28 
 
 		 339 aa  444  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0948  ketol-acid reductoisomerase  61.45 
 
 		 340 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.525725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  61.56 
 
 		 338 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  60.96 
 
 		 338 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  66.36 
 
 		 331 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  60.96 
 
 		 338 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3248  ketol-acid reductoisomerase  62.87 
 
 		 339 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167766  normal  0.961188 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2319  ketol-acid reductoisomerase  60.36 
 
 		 338 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  60.96 
 
 		 338 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  63.17 
 
 		 339 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  60.36 
 
 		 338 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  61.86 
 
 		 338 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1061  ketol-acid reductoisomerase  60.66 
 
 		 338 aa  443  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0285  ketol-acid reductoisomerase  61.38 
 
 		 339 aa  442  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.772607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  61.68 
 
 		 339 aa  441  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0329  ketol-acid reductoisomerase  61.38 
 
 		 339 aa  442  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1127  ketol-acid reductoisomerase  60.84 
 
 		 340 aa  442  1e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2518  ketol-acid reductoisomerase  70.69 
 
 		 331 aa  441  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000352718  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  60.66 
 
 		 338 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0361  ketol-acid reductoisomerase  61.08 
 
 		 339 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  60.06 
 
 		 338 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  59.46 
 
 		 336 aa  438  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2720  ketol-acid reductoisomerase  61.08 
 
 		 339 aa  437  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194376  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  61.08 
 
 		 338 aa  440  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1690  ketol-acid reductoisomerase  67.17 
 
 		 331 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300621  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  63.83 
 
 		 330 aa  434  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  59.46 
 
 		 338 aa  437  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  64.26 
 
 		 336 aa  434  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  60.48 
 
 		 339 aa  434  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1490  ketol-acid reductoisomerase  61.08 
 
 		 339 aa  435  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  60.36 
 
 		 338 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  64.86 
 
 		 341 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  60.54 
 
 		 338 aa  437  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3341  ketol-acid reductoisomerase  60.78 
 
 		 339 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.764687  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2102  ketol-acid reductoisomerase  60.78 
 
 		 339 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0812  ketol-acid reductoisomerase  59.76 
 
 		 338 aa  436  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2142  ketol-acid reductoisomerase  60.91 
 
 		 340 aa  431  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0716485  normal  0.0660754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3416  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 		 339 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1581  ketol-acid reductoisomerase  59.34 
 
 		 340 aa  433  1e-120  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2341  ketol-acid reductoisomerase  60.48 
 
 		 339 aa  432  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6082  ketol-acid reductoisomerase  60.78 
 
 		 339 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 		 331 aa  432  1e-120  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  61.4 
 
 		 331 aa  432  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2020  ketol-acid reductoisomerase  61.26 
 
 		 338 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  60.36 
 
 		 338 aa  433  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1907  ketol-acid reductoisomerase  60.91 
 
 		 339 aa  432  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.022886  hitchhiker  0.0000179587 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  62.84 
 
 		 331 aa  434  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  60.67 
 
 		 329 aa  433  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  63.96 
 
 		 336 aa  432  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3110  ketol-acid reductoisomerase  58.26 
 
 		 338 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090046  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1905  ketol-acid reductoisomerase  65.45 
 
 		 333 aa  427  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0374  ketol-acid reductoisomerase  58.73 
 
 		 340 aa  429  1e-119  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2466  ketol-acid reductoisomerase  60.48 
 
 		 339 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498417  normal  0.4902 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  60.48 
 
 		 339 aa  430  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3229  ketol-acid reductoisomerase  60.06 
 
 		 338 aa  428  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 		 339 aa  428  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2418  ketol-acid reductoisomerase  60.48 
 
 		 339 aa  429  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 		 331 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2103  ketol-acid reductoisomerase  60.06 
 
 		 338 aa  429  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.124469 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2286  ketol-acid reductoisomerase  59.94 
 
 		 338 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.465318 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0116  ketol-acid reductoisomerase  58.73 
 
 		 359 aa  424  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1846  ketol-acid reductoisomerase  59.76 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11584  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2775  ketol-acid reductoisomerase  57.66 
 
 		 338 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.987552  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1421  ketol-acid reductoisomerase  59.76 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5590  ketol-acid reductoisomerase  59.94 
 
 		 338 aa  424  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1283  ketol-acid reductoisomerase  59.76 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1047  ketol-acid reductoisomerase  59.46 
 
 		 338 aa  425  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00873867  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 		 331 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3324  ketol-acid reductoisomerase  60.96 
 
 		 338 aa  427  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2121  ketol-acid reductoisomerase  58.86 
 
 		 338 aa  425  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1951  ketol-acid reductoisomerase  57.06 
 
 		 338 aa  424  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1652  ketol-acid reductoisomerase  59.94 
 
 		 338 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1276  ketol-acid reductoisomerase  59.76 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1771  ketol-acid reductoisomerase  57.06 
 
 		 338 aa  424  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.09387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 		 330 aa  426  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1115  ketol-acid reductoisomerase  59.76 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1330  ketol-acid reductoisomerase  59.76 
 
 		 338 aa  425  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2263  ketol-acid reductoisomerase  59.94 
 
 		 338 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  62.95 
 
 		 341 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 		 331 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0398  ketol-acid reductoisomerase  59.76 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.422239  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0751  ketol-acid reductoisomerase  59.76 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2484  ketol-acid reductoisomerase  64.24 
 
 		 333 aa  426  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000401864  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2518  ketol-acid reductoisomerase  61.75 
 
 		 338 aa  423  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  63.94 
 
 		 330 aa  423  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1976  ketol-acid reductoisomerase  63.55 
 
 		 341 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>