More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0133 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
331 aa  679    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  86.67 
 
 
331 aa  607  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  89.09 
 
 
331 aa  600  1.0000000000000001e-171  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  84.55 
 
 
331 aa  563  1.0000000000000001e-159  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  80.43 
 
 
327 aa  558  1e-158  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1343  ketol-acid reductoisomerase  82.42 
 
 
331 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1020  ketol-acid reductoisomerase  86.32 
 
 
331 aa  554  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.488917 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0991  ketol-acid reductoisomerase  86.32 
 
 
331 aa  554  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  71.73 
 
 
331 aa  501  1e-141  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  71.43 
 
 
331 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  71.12 
 
 
331 aa  498  1e-140  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  71.12 
 
 
331 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  70.21 
 
 
329 aa  487  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  70.21 
 
 
329 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  70.21 
 
 
329 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  69.3 
 
 
331 aa  484  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  69 
 
 
331 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  70.21 
 
 
329 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  67.28 
 
 
338 aa  474  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  65.56 
 
 
333 aa  472  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  70.3 
 
 
331 aa  472  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  67.58 
 
 
330 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  66.36 
 
 
338 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  66.77 
 
 
338 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  67.27 
 
 
331 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  69.02 
 
 
338 aa  463  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  65.03 
 
 
338 aa  462  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  66.67 
 
 
338 aa  461  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  64.72 
 
 
330 aa  461  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  69.02 
 
 
338 aa  463  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  64.72 
 
 
338 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1879  ketol-acid reductoisomerase  67.78 
 
 
342 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  64.33 
 
 
338 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  69.7 
 
 
330 aa  459  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  66.16 
 
 
329 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  69.21 
 
 
330 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1987  ketol-acid reductoisomerase  67.88 
 
 
341 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  66.67 
 
 
336 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1902  ketol-acid reductoisomerase  68.18 
 
 
341 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1976  ketol-acid reductoisomerase  67.88 
 
 
341 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  65.65 
 
 
335 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  63.5 
 
 
336 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2142  ketol-acid reductoisomerase  65.85 
 
 
340 aa  451  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0716485  normal  0.0660754 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  66.67 
 
 
336 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1907  ketol-acid reductoisomerase  66.46 
 
 
339 aa  453  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.022886  hitchhiker  0.0000179587 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  64.62 
 
 
330 aa  449  1e-125  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2166  ketol-acid reductoisomerase  68.9 
 
 
329 aa  448  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  63.61 
 
 
330 aa  448  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  63.91 
 
 
338 aa  449  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  64.63 
 
 
338 aa  445  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  67.89 
 
 
338 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  64.11 
 
 
330 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  64.63 
 
 
338 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2484  ketol-acid reductoisomerase  68.48 
 
 
333 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000401864  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2518  ketol-acid reductoisomerase  66.36 
 
 
338 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3020  ketol-acid reductoisomerase  66.36 
 
 
336 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000242382  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1690  ketol-acid reductoisomerase  69.51 
 
 
331 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300621  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3563  ketol-acid reductoisomerase  63.69 
 
 
330 aa  441  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0252536  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  62.92 
 
 
330 aa  443  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  65.42 
 
 
337 aa  441  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  66.97 
 
 
341 aa  443  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  63.72 
 
 
338 aa  441  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  67.17 
 
 
344 aa  442  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0851  ketol-acid reductoisomerase  62.69 
 
 
330 aa  443  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3435  ketol-acid reductoisomerase  64.95 
 
 
331 aa  437  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00388132  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2775  ketol-acid reductoisomerase  61.77 
 
 
338 aa  439  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.987552  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0228  ketol-acid reductoisomerase  66.77 
 
 
332 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000772212  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  67.17 
 
 
341 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1245  ketol-acid reductoisomerase  62.24 
 
 
331 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2144  ketol-acid reductoisomerase  65.07 
 
 
337 aa  438  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128688  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1545  ketol-acid reductoisomerase  64.33 
 
 
340 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.159876  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1905  ketol-acid reductoisomerase  67.38 
 
 
333 aa  437  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1061  ketol-acid reductoisomerase  63.11 
 
 
338 aa  436  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  61.96 
 
 
338 aa  435  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42500  ketol-acid reductoisomerase  61.96 
 
 
338 aa  435  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  62.61 
 
 
339 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0613  ketol-acid reductoisomerase  63.11 
 
 
331 aa  436  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398516  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1989  ketol-acid reductoisomerase  61.35 
 
 
338 aa  436  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  63.61 
 
 
339 aa  435  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4071  ketol-acid reductoisomerase  63.53 
 
 
342 aa  437  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2501  ketol-acid reductoisomerase  62.69 
 
 
338 aa  437  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000349706  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  63.41 
 
 
338 aa  437  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 
339 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6019  ketol-acid reductoisomerase  62.39 
 
 
337 aa  433  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390752  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1846  ketol-acid reductoisomerase  63.72 
 
 
338 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11584  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1421  ketol-acid reductoisomerase  63.72 
 
 
338 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1902  ketol-acid reductoisomerase  61.47 
 
 
330 aa  431  1e-120  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1047  ketol-acid reductoisomerase  64.02 
 
 
338 aa  433  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00873867  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1276  ketol-acid reductoisomerase  63.72 
 
 
338 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2121  ketol-acid reductoisomerase  61.28 
 
 
338 aa  431  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2319  ketol-acid reductoisomerase  62.8 
 
 
338 aa  434  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10850  ketol-acid reductoisomerase  65.24 
 
 
330 aa  432  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  62.2 
 
 
338 aa  431  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0398  ketol-acid reductoisomerase  63.72 
 
 
338 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.422239  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1283  ketol-acid reductoisomerase  63.72 
 
 
338 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1496  ketol-acid reductoisomerase  62.61 
 
 
339 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0558834  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  60.74 
 
 
338 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0812  ketol-acid reductoisomerase  63.11 
 
 
338 aa  433  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0751  ketol-acid reductoisomerase  63.72 
 
 
338 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  60.74 
 
 
338 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>