More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0228 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0228  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
332 aa  678    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000772212  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0065  ketol-acid reductoisomerase  77.11 
 
 
333 aa  515  1.0000000000000001e-145  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000348279  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  69.82 
 
 
333 aa  480  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  67.38 
 
 
330 aa  469  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  69.21 
 
 
331 aa  449  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  65.24 
 
 
331 aa  447  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  68.9 
 
 
331 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  68.58 
 
 
341 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1189  ketol-acid reductoisomerase  69.21 
 
 
332 aa  441  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  66.77 
 
 
331 aa  439  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  67.99 
 
 
341 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10850  ketol-acid reductoisomerase  66.16 
 
 
330 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  66.07 
 
 
336 aa  434  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  64.42 
 
 
338 aa  436  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2142  ketol-acid reductoisomerase  63.83 
 
 
340 aa  431  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0716485  normal  0.0660754 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  65.77 
 
 
336 aa  433  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  62.5 
 
 
330 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  64.95 
 
 
331 aa  432  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1907  ketol-acid reductoisomerase  64.44 
 
 
339 aa  434  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.022886  hitchhiker  0.0000179587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1343  ketol-acid reductoisomerase  64.95 
 
 
331 aa  428  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3638  ketol-acid reductoisomerase  65.55 
 
 
329 aa  426  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  63.08 
 
 
327 aa  424  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  62.88 
 
 
338 aa  422  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  62.2 
 
 
331 aa  421  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  62.88 
 
 
338 aa  422  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  63.8 
 
 
338 aa  418  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  60.37 
 
 
331 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  61.89 
 
 
331 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2484  ketol-acid reductoisomerase  65.85 
 
 
333 aa  419  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000401864  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  65.55 
 
 
344 aa  420  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  62.88 
 
 
338 aa  418  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  61.59 
 
 
329 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  61.16 
 
 
335 aa  418  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  66.46 
 
 
330 aa  418  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  63.8 
 
 
338 aa  418  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1245  ketol-acid reductoisomerase  63.5 
 
 
331 aa  420  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  61.28 
 
 
329 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  60.67 
 
 
331 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1092  ketol-acid reductoisomerase  65.55 
 
 
331 aa  420  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  62.77 
 
 
338 aa  419  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  61.59 
 
 
329 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  61.96 
 
 
338 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1519  ketol-acid reductoisomerase  63.75 
 
 
336 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1283  ketol-acid reductoisomerase  64.05 
 
 
336 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1284  ketol-acid reductoisomerase  63.75 
 
 
336 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1122  ketol-acid reductoisomerase  64.33 
 
 
336 aa  414  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0870487  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3563  ketol-acid reductoisomerase  60.92 
 
 
330 aa  416  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0252536  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3480  ketol-acid reductoisomerase  60.24 
 
 
341 aa  415  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.161207  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  60.37 
 
 
331 aa  415  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  60.98 
 
 
331 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6019  ketol-acid reductoisomerase  62.77 
 
 
337 aa  416  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390752  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  61.04 
 
 
330 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  60.73 
 
 
338 aa  415  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  62.27 
 
 
329 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1879  ketol-acid reductoisomerase  63.3 
 
 
342 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  60.98 
 
 
329 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0831  ketol-acid reductoisomerase  63.72 
 
 
332 aa  412  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.357029  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3892  ketol-acid reductoisomerase  63.44 
 
 
336 aa  412  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1987  ketol-acid reductoisomerase  64.63 
 
 
341 aa  411  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1452  ketol-acid reductoisomerase  63.14 
 
 
336 aa  411  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1490  ketol-acid reductoisomerase  63.44 
 
 
336 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_735  ketol-acid reductoisomerase  63.41 
 
 
332 aa  412  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.122769  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  60.98 
 
 
331 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1976  ketol-acid reductoisomerase  64.63 
 
 
341 aa  411  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1321  ketol-acid reductoisomerase  63.44 
 
 
336 aa  413  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  60.43 
 
 
330 aa  412  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1902  ketol-acid reductoisomerase  64.63 
 
 
341 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1558  ketol-acid reductoisomerase  63.44 
 
 
336 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2144  ketol-acid reductoisomerase  61.68 
 
 
337 aa  413  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128688  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1020  ketol-acid reductoisomerase  66.16 
 
 
331 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.488917 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1310  ketol-acid reductoisomerase  63.44 
 
 
336 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1716  ketol-acid reductoisomerase  62.96 
 
 
335 aa  408  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1668  ketol-acid reductoisomerase  63.27 
 
 
335 aa  408  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1709  ketol-acid reductoisomerase  63.27 
 
 
337 aa  409  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0750  ketol-acid reductoisomerase  63.41 
 
 
332 aa  411  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1419  ketol-acid reductoisomerase  63.44 
 
 
336 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1852  ketol-acid reductoisomerase  62.96 
 
 
335 aa  408  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1890  ketol-acid reductoisomerase  62.96 
 
 
335 aa  408  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3020  ketol-acid reductoisomerase  63 
 
 
336 aa  409  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000242382  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1853  ketol-acid reductoisomerase  63.58 
 
 
335 aa  410  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0991  ketol-acid reductoisomerase  66.16 
 
 
331 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1968  ketol-acid reductoisomerase  63.27 
 
 
335 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  65.64 
 
 
330 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1936  ketol-acid reductoisomerase  62.65 
 
 
335 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4071  ketol-acid reductoisomerase  60.86 
 
 
342 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1693  ketol-acid reductoisomerase  62.65 
 
 
335 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0602  ketol-acid reductoisomerase  63.94 
 
 
330 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0492028 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2767  ketol-acid reductoisomerase  57.98 
 
 
352 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2172  ketol-acid reductoisomerase  64.85 
 
 
329 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  58.48 
 
 
336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3489  ketol-acid reductoisomerase  62.65 
 
 
335 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1690  ketol-acid reductoisomerase  66.87 
 
 
331 aa  403  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300621  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  63.19 
 
 
338 aa  401  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  59.2 
 
 
330 aa  403  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1905  ketol-acid reductoisomerase  65.85 
 
 
333 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1242  ketol-acid reductoisomerase  59.21 
 
 
340 aa  401  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3435  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 
331 aa  401  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00388132  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1367  ketol-acid reductoisomerase  59.09 
 
 
340 aa  401  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.845865  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0851  ketol-acid reductoisomerase  58.28 
 
 
330 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  60.12 
 
 
330 aa  404  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>