More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2172 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2172  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
329 aa  679    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1245  ketol-acid reductoisomerase  78.35 
 
 
331 aa  550  1e-155  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0082  ketol-acid reductoisomerase  81.16 
 
 
331 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.562426  normal  0.207631 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0602  ketol-acid reductoisomerase  78.12 
 
 
330 aa  524  1e-147  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0492028 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0481  ketol-acid reductoisomerase  77.2 
 
 
329 aa  511  1e-144  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.495995  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  64.85 
 
 
331 aa  441  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  64.11 
 
 
330 aa  444  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  63.03 
 
 
330 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  62.12 
 
 
331 aa  431  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  62.58 
 
 
338 aa  429  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  61.4 
 
 
333 aa  426  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  64.31 
 
 
341 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10850  ketol-acid reductoisomerase  63.8 
 
 
330 aa  426  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  64.31 
 
 
341 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  63.55 
 
 
338 aa  422  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1853  ketol-acid reductoisomerase  63.47 
 
 
335 aa  422  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1968  ketol-acid reductoisomerase  63.47 
 
 
335 aa  421  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  62.46 
 
 
338 aa  423  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1716  ketol-acid reductoisomerase  63.16 
 
 
335 aa  418  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  66.15 
 
 
344 aa  419  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1852  ketol-acid reductoisomerase  63.16 
 
 
335 aa  418  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1890  ketol-acid reductoisomerase  63.16 
 
 
335 aa  418  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3489  ketol-acid reductoisomerase  63.16 
 
 
335 aa  421  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1709  ketol-acid reductoisomerase  61.89 
 
 
337 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1936  ketol-acid reductoisomerase  62.85 
 
 
335 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1693  ketol-acid reductoisomerase  62.85 
 
 
335 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1668  ketol-acid reductoisomerase  63.16 
 
 
335 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  61.96 
 
 
338 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2484  ketol-acid reductoisomerase  65.15 
 
 
333 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000401864  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  62.62 
 
 
338 aa  412  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  61.09 
 
 
329 aa  412  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1907  ketol-acid reductoisomerase  62.85 
 
 
339 aa  414  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.022886  hitchhiker  0.0000179587 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2142  ketol-acid reductoisomerase  61.96 
 
 
340 aa  411  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0716485  normal  0.0660754 
 
 
-
 
NC_002936  DET0831  ketol-acid reductoisomerase  62.27 
 
 
332 aa  411  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.357029  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0750  ketol-acid reductoisomerase  61.35 
 
 
332 aa  409  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  61.21 
 
 
331 aa  411  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  61.85 
 
 
338 aa  410  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2144  ketol-acid reductoisomerase  60.9 
 
 
337 aa  409  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128688  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_735  ketol-acid reductoisomerase  61.35 
 
 
332 aa  408  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.122769  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  61.82 
 
 
331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0228  ketol-acid reductoisomerase  64.85 
 
 
332 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000772212  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 
338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  64.55 
 
 
330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1189  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 
332 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0225  ketol-acid reductoisomerase  66.15 
 
 
330 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.677869  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  60.87 
 
 
336 aa  404  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  61.52 
 
 
331 aa  403  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  61.99 
 
 
338 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0220  ketol-acid reductoisomerase  62.42 
 
 
335 aa  404  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22789  normal  0.0211125 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  60.43 
 
 
336 aa  401  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  60.74 
 
 
336 aa  403  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  60.91 
 
 
331 aa  403  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  61.99 
 
 
338 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1519  ketol-acid reductoisomerase  61.85 
 
 
336 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1310  ketol-acid reductoisomerase  61.54 
 
 
336 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1283  ketol-acid reductoisomerase  61.85 
 
 
336 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1284  ketol-acid reductoisomerase  61.85 
 
 
336 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  57.98 
 
 
330 aa  398  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3892  ketol-acid reductoisomerase  61.54 
 
 
336 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1419  ketol-acid reductoisomerase  61.54 
 
 
336 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3020  ketol-acid reductoisomerase  60.61 
 
 
336 aa  398  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000242382  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0410  ketol-acid reductoisomerase  62.58 
 
 
329 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0354  ketol-acid reductoisomerase  64.62 
 
 
341 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  61.96 
 
 
330 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0065  ketol-acid reductoisomerase  63.5 
 
 
333 aa  400  9.999999999999999e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000348279  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1343  ketol-acid reductoisomerase  61.21 
 
 
331 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1490  ketol-acid reductoisomerase  61.23 
 
 
336 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1122  ketol-acid reductoisomerase  60.92 
 
 
336 aa  395  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0870487  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  59.51 
 
 
327 aa  396  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1452  ketol-acid reductoisomerase  61.23 
 
 
336 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1558  ketol-acid reductoisomerase  61.54 
 
 
336 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1321  ketol-acid reductoisomerase  60.92 
 
 
336 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  58.28 
 
 
338 aa  391  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  57.98 
 
 
338 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  57.14 
 
 
329 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  58.28 
 
 
338 aa  391  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  57.14 
 
 
329 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1680  ketol-acid reductoisomerase  60.69 
 
 
330 aa  394  1e-108  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0233  ketol-acid reductoisomerase  60.69 
 
 
330 aa  394  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  56.84 
 
 
329 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0922  ketol-acid reductoisomerase  60.06 
 
 
330 aa  392  1e-108  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  57.93 
 
 
338 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  56.53 
 
 
329 aa  388  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  57.98 
 
 
330 aa  389  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  59.76 
 
 
338 aa  388  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3381  ketol-acid reductoisomerase  57.8 
 
 
339 aa  388  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  58.36 
 
 
331 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  58.05 
 
 
331 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0991  ketol-acid reductoisomerase  63.83 
 
 
331 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  59.5 
 
 
330 aa  390  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1902  ketol-acid reductoisomerase  58.28 
 
 
330 aa  388  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  57.36 
 
 
338 aa  391  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1020  ketol-acid reductoisomerase  63.83 
 
 
331 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.488917 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  57.67 
 
 
338 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  56.75 
 
 
338 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  58.77 
 
 
335 aa  390  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  58.05 
 
 
331 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1690  ketol-acid reductoisomerase  61.96 
 
 
331 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300621  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  57.36 
 
 
338 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1538  ketol-acid reductoisomerase  58.81 
 
 
330 aa  385  1e-106  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>