More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0922 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0233  ketol-acid reductoisomerase  98.79 
 
 
330 aa  671    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1680  ketol-acid reductoisomerase  98.79 
 
 
330 aa  673    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1538  ketol-acid reductoisomerase  92.12 
 
 
330 aa  636    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0922  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
330 aa  679    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1175  ketol-acid reductoisomerase  71.73 
 
 
329 aa  503  1e-141  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.273491  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  60.68 
 
 
330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0220  ketol-acid reductoisomerase  61.88 
 
 
335 aa  393  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22789  normal  0.0211125 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1245  ketol-acid reductoisomerase  61.32 
 
 
331 aa  392  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  59.13 
 
 
330 aa  388  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  57.45 
 
 
333 aa  385  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  57.89 
 
 
338 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  58.07 
 
 
331 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1875  ketol-acid reductoisomerase  56.97 
 
 
331 aa  382  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000873272 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  56.97 
 
 
329 aa  382  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  58.2 
 
 
331 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0481  ketol-acid reductoisomerase  61.61 
 
 
329 aa  380  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.495995  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  57.28 
 
 
338 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2484  ketol-acid reductoisomerase  61.49 
 
 
333 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000401864  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  57.14 
 
 
331 aa  376  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0867  ketol-acid reductoisomerase  54.8 
 
 
340 aa  375  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  58.2 
 
 
330 aa  376  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  57.59 
 
 
338 aa  375  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0082  ketol-acid reductoisomerase  60.37 
 
 
331 aa  375  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.562426  normal  0.207631 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  56.97 
 
 
330 aa  373  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  59.13 
 
 
330 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  59.94 
 
 
336 aa  372  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  56.39 
 
 
327 aa  372  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0602  ketol-acid reductoisomerase  60.99 
 
 
330 aa  374  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0492028 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2172  ketol-acid reductoisomerase  60.06 
 
 
329 aa  372  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  57.89 
 
 
338 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  59.32 
 
 
331 aa  374  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  56.97 
 
 
338 aa  374  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0225  ketol-acid reductoisomerase  63.47 
 
 
330 aa  373  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.677869  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  57.89 
 
 
338 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  56.21 
 
 
331 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  55.11 
 
 
338 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  55.73 
 
 
338 aa  371  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  59.33 
 
 
336 aa  369  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  55.73 
 
 
338 aa  368  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  56.66 
 
 
330 aa  368  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  56.21 
 
 
331 aa  370  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2767  ketol-acid reductoisomerase  53.73 
 
 
352 aa  369  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  55.42 
 
 
338 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  56.97 
 
 
330 aa  370  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  56.35 
 
 
338 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0374  ketol-acid reductoisomerase  54.52 
 
 
340 aa  367  1e-100  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0948  ketol-acid reductoisomerase  52.94 
 
 
340 aa  366  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.525725  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  54.8 
 
 
338 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0903  ketol-acid reductoisomerase  53.42 
 
 
351 aa  367  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  55.59 
 
 
331 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  58.7 
 
 
331 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  55.28 
 
 
331 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  52.94 
 
 
338 aa  367  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0873  ketol-acid reductoisomerase  52.65 
 
 
351 aa  364  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0708  ketol-acid reductoisomerase  60.06 
 
 
335 aa  366  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  55.11 
 
 
338 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  54.18 
 
 
336 aa  364  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1496  ketol-acid reductoisomerase  54.01 
 
 
339 aa  364  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0558834  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2144  ketol-acid reductoisomerase  56.76 
 
 
337 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128688  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0112  ketol-acid reductoisomerase  57.63 
 
 
332 aa  366  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  56.35 
 
 
338 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  55.28 
 
 
329 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1127  ketol-acid reductoisomerase  53.56 
 
 
340 aa  366  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2654  ketol-acid reductoisomerase  55.76 
 
 
344 aa  364  1e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1902  ketol-acid reductoisomerase  57.28 
 
 
330 aa  364  1e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  57.45 
 
 
331 aa  364  1e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0541  ketol-acid reductoisomerase  53.56 
 
 
340 aa  364  1e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  55.28 
 
 
329 aa  364  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1962  ketol-acid reductoisomerase  53.7 
 
 
339 aa  364  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.971323  normal  0.40215 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3552  ketol-acid reductoisomerase  57.54 
 
 
330 aa  363  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.665615  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  54.8 
 
 
338 aa  362  5.0000000000000005e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1853  ketol-acid reductoisomerase  56.66 
 
 
335 aa  362  6e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  54.66 
 
 
329 aa  362  6e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1968  ketol-acid reductoisomerase  56.66 
 
 
335 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  52.94 
 
 
340 aa  361  7.0000000000000005e-99  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  55.28 
 
 
329 aa  361  8e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  58.05 
 
 
331 aa  360  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0354  ketol-acid reductoisomerase  58.48 
 
 
341 aa  361  1e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1709  ketol-acid reductoisomerase  55.93 
 
 
337 aa  361  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  54.35 
 
 
331 aa  361  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10850  ketol-acid reductoisomerase  57.59 
 
 
330 aa  360  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0851  ketol-acid reductoisomerase  55.73 
 
 
330 aa  361  1e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  54.01 
 
 
339 aa  360  2e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1367  ketol-acid reductoisomerase  53.25 
 
 
340 aa  360  2e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.845865  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0812  ketol-acid reductoisomerase  54.18 
 
 
338 aa  360  2e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  54.18 
 
 
338 aa  360  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2172  ketol-acid reductoisomerase  56.35 
 
 
330 aa  360  2e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  53.25 
 
 
340 aa  359  3e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2492  ketol-acid reductoisomerase  53.09 
 
 
339 aa  359  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal  0.156046 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2778  ketol-acid reductoisomerase  53.09 
 
 
339 aa  359  4e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3563  ketol-acid reductoisomerase  55.49 
 
 
330 aa  358  5e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0252536  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2121  ketol-acid reductoisomerase  52.94 
 
 
338 aa  358  5e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2020  ketol-acid reductoisomerase  55.11 
 
 
338 aa  358  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1905  ketol-acid reductoisomerase  58.82 
 
 
333 aa  358  6e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  56.21 
 
 
344 aa  358  8e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2984  ketol-acid reductoisomerase  56.04 
 
 
333 aa  358  8e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0372563  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3026  ketol-acid reductoisomerase  56.04 
 
 
333 aa  358  8e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3110  ketol-acid reductoisomerase  53.56 
 
 
338 aa  358  8e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090046  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  61.06 
 
 
330 aa  358  9e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3489  ketol-acid reductoisomerase  56.04 
 
 
335 aa  358  9e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>