More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0112 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0112  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
332 aa  682    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  61.93 
 
 
331 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  63.41 
 
 
330 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  61.89 
 
 
331 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  64.95 
 
 
336 aa  425  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  64.05 
 
 
336 aa  421  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0220  ketol-acid reductoisomerase  64.02 
 
 
335 aa  424  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22789  normal  0.0211125 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10850  ketol-acid reductoisomerase  63.33 
 
 
330 aa  422  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  60.37 
 
 
330 aa  420  1e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  64.02 
 
 
331 aa  411  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  64.94 
 
 
330 aa  412  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  59.15 
 
 
333 aa  412  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2144  ketol-acid reductoisomerase  60.83 
 
 
337 aa  411  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128688  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  59.27 
 
 
338 aa  413  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0225  ketol-acid reductoisomerase  65.85 
 
 
330 aa  409  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.677869  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  62.24 
 
 
331 aa  409  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  62.5 
 
 
331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1245  ketol-acid reductoisomerase  60.37 
 
 
331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  61.59 
 
 
331 aa  401  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0708  ketol-acid reductoisomerase  64.94 
 
 
335 aa  404  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1189  ketol-acid reductoisomerase  59.64 
 
 
332 aa  402  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0831  ketol-acid reductoisomerase  60.54 
 
 
332 aa  401  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.357029  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0481  ketol-acid reductoisomerase  62.58 
 
 
329 aa  397  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.495995  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  59.94 
 
 
341 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_735  ketol-acid reductoisomerase  59.64 
 
 
332 aa  398  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.122769  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0750  ketol-acid reductoisomerase  59.94 
 
 
332 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  56.84 
 
 
338 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  57.45 
 
 
338 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  56.23 
 
 
338 aa  395  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  57.85 
 
 
329 aa  397  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2767  ketol-acid reductoisomerase  57.41 
 
 
352 aa  395  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  56.84 
 
 
338 aa  395  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0991  ketol-acid reductoisomerase  62.54 
 
 
331 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0410  ketol-acid reductoisomerase  61.23 
 
 
329 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  57.14 
 
 
338 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1020  ketol-acid reductoisomerase  62.54 
 
 
331 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.488917 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1343  ketol-acid reductoisomerase  58.91 
 
 
331 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  56.57 
 
 
330 aa  391  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  57.01 
 
 
331 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  57.01 
 
 
329 aa  391  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  56.4 
 
 
331 aa  388  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  57.23 
 
 
327 aa  390  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  55.45 
 
 
338 aa  389  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  57.14 
 
 
330 aa  389  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  59.04 
 
 
341 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  56.4 
 
 
329 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0873  ketol-acid reductoisomerase  56.13 
 
 
351 aa  389  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  55.62 
 
 
336 aa  388  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1538  ketol-acid reductoisomerase  57.63 
 
 
330 aa  387  1e-106  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0354  ketol-acid reductoisomerase  64 
 
 
341 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0922  ketol-acid reductoisomerase  57.63 
 
 
330 aa  385  1e-106  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  56.1 
 
 
329 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1680  ketol-acid reductoisomerase  57.94 
 
 
330 aa  386  1e-106  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  56.1 
 
 
329 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  59.64 
 
 
344 aa  386  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0065  ketol-acid reductoisomerase  60.24 
 
 
333 aa  386  1e-106  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000348279  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1242  ketol-acid reductoisomerase  58.43 
 
 
340 aa  385  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2484  ketol-acid reductoisomerase  61.59 
 
 
333 aa  381  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000401864  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  56.53 
 
 
330 aa  384  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0228  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 
332 aa  381  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000772212  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2172  ketol-acid reductoisomerase  61.04 
 
 
329 aa  384  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0602  ketol-acid reductoisomerase  60.87 
 
 
330 aa  384  1e-105  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0492028 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0867  ketol-acid reductoisomerase  52.73 
 
 
340 aa  381  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2984  ketol-acid reductoisomerase  58.15 
 
 
333 aa  381  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0372563  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3026  ketol-acid reductoisomerase  58.15 
 
 
333 aa  381  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  56.23 
 
 
338 aa  382  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0233  ketol-acid reductoisomerase  57.63 
 
 
330 aa  382  1e-105  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0851  ketol-acid reductoisomerase  56.53 
 
 
330 aa  382  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  59.38 
 
 
338 aa  380  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  57.49 
 
 
335 aa  379  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1936  ketol-acid reductoisomerase  57.72 
 
 
335 aa  378  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  52.73 
 
 
340 aa  379  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  56.88 
 
 
330 aa  379  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1310  ketol-acid reductoisomerase  58.84 
 
 
336 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3552  ketol-acid reductoisomerase  57.27 
 
 
330 aa  378  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.665615  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2819  ketol-acid reductoisomerase  56.1 
 
 
333 aa  379  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1987  ketol-acid reductoisomerase  58.73 
 
 
341 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0613  ketol-acid reductoisomerase  57.19 
 
 
331 aa  381  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398516  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1989  ketol-acid reductoisomerase  53.8 
 
 
338 aa  380  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2518  ketol-acid reductoisomerase  57.58 
 
 
338 aa  381  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  54.88 
 
 
331 aa  379  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  54.88 
 
 
331 aa  379  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0948  ketol-acid reductoisomerase  53.64 
 
 
340 aa  380  1e-104  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.525725  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1419  ketol-acid reductoisomerase  58.84 
 
 
336 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  56.23 
 
 
338 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1976  ketol-acid reductoisomerase  58.73 
 
 
341 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1709  ketol-acid reductoisomerase  57.36 
 
 
337 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  54.88 
 
 
331 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  58.23 
 
 
330 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  56.23 
 
 
338 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1175  ketol-acid reductoisomerase  56.7 
 
 
329 aa  378  1e-104  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.273491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1968  ketol-acid reductoisomerase  57.41 
 
 
335 aa  378  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1902  ketol-acid reductoisomerase  58.73 
 
 
341 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0082  ketol-acid reductoisomerase  60.06 
 
 
331 aa  380  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.562426  normal  0.207631 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  54.88 
 
 
331 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  53.33 
 
 
340 aa  377  1e-103  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1283  ketol-acid reductoisomerase  58.54 
 
 
336 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1853  ketol-acid reductoisomerase  57.1 
 
 
335 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2775  ketol-acid reductoisomerase  53.35 
 
 
338 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.987552  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1875  ketol-acid reductoisomerase  56.53 
 
 
331 aa  376  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000873272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>