More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3552 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3552  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
330 aa  675    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.665615  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2819  ketol-acid reductoisomerase  85.15 
 
 
333 aa  590  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8057  Ketol-acid reductoisomerase  85.41 
 
 
329 aa  566  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0613  ketol-acid reductoisomerase  79.94 
 
 
331 aa  541  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398516  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4071  ketol-acid reductoisomerase  74.09 
 
 
342 aa  497  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0173  ketol-acid reductoisomerase  75.3 
 
 
331 aa  496  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6019  ketol-acid reductoisomerase  72.78 
 
 
337 aa  485  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7780  ketol-acid reductoisomerase  73.94 
 
 
331 aa  486  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.543395 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0708  ketol-acid reductoisomerase  71.43 
 
 
355 aa  481  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57193  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2140  ketol-acid reductoisomerase  72.64 
 
 
342 aa  481  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1468  ketol-acid reductoisomerase  71.17 
 
 
342 aa  479  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000508699  normal  0.0138391 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3390  ketol-acid reductoisomerase  72.64 
 
 
342 aa  475  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606091  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1125  ketol-acid reductoisomerase  72.78 
 
 
337 aa  456  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000891733 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08550  ketol-acid reductoisomerase  70.86 
 
 
343 aa  451  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0566957  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3638  ketol-acid reductoisomerase  69.82 
 
 
329 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1337  ketol-acid reductoisomerase  67.78 
 
 
342 aa  449  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08890  ketol-acid reductoisomerase  73.09 
 
 
337 aa  449  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1092  ketol-acid reductoisomerase  69.51 
 
 
331 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3228  ketol-acid reductoisomerase  66.36 
 
 
337 aa  444  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4354  ketol-acid reductoisomerase  69 
 
 
336 aa  444  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00327651  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10700  ketol-acid reductoisomerase  68.09 
 
 
342 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.72382 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1235  ketol-acid reductoisomerase  71.25 
 
 
337 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.362141 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2384  ketol-acid reductoisomerase  68.5 
 
 
341 aa  442  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13016  ketol-acid reductoisomerase  65.95 
 
 
333 aa  442  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00176679  normal  0.164078 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2862  ketol-acid reductoisomerase  68.71 
 
 
333 aa  442  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1165  ketol-acid reductoisomerase  68.2 
 
 
342 aa  439  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal  0.0402172 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1410  ketol-acid reductoisomerase  67.48 
 
 
342 aa  438  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18790  ketol-acid reductoisomerase  67.28 
 
 
343 aa  436  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1888  ketol-acid reductoisomerase  66.36 
 
 
337 aa  431  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.0861807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1908  ketol-acid reductoisomerase  66.36 
 
 
337 aa  431  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20924  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1708  ketol-acid reductoisomerase  66.67 
 
 
345 aa  431  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.301189 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1954  ketol-acid reductoisomerase  66.36 
 
 
337 aa  431  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.85036  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  62.42 
 
 
331 aa  431  1e-119  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 
331 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  62.61 
 
 
331 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2124  ketol-acid reductoisomerase  65.75 
 
 
337 aa  428  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322343  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 
331 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2277  ketol-acid reductoisomerase  65.44 
 
 
341 aa  425  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  61.52 
 
 
331 aa  426  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4237  ketol-acid reductoisomerase  65.14 
 
 
337 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.317024  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2537  ketol-acid reductoisomerase  65.14 
 
 
341 aa  424  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00800327  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  61.28 
 
 
329 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  60.98 
 
 
329 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  66.98 
 
 
337 aa  421  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  61.28 
 
 
329 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 
331 aa  415  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  60.98 
 
 
329 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  61.54 
 
 
330 aa  412  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1879  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 
342 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3563  ketol-acid reductoisomerase  60.74 
 
 
330 aa  409  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0252536  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1242  ketol-acid reductoisomerase  61.09 
 
 
340 aa  409  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  60.19 
 
 
330 aa  408  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2172  ketol-acid reductoisomerase  60.92 
 
 
330 aa  408  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  58.9 
 
 
340 aa  404  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 
330 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 
331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1875  ketol-acid reductoisomerase  61.85 
 
 
331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000873272 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 
331 aa  403  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  60.12 
 
 
339 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0285  ketol-acid reductoisomerase  58.54 
 
 
339 aa  402  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.772607  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  59.2 
 
 
339 aa  404  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  62.5 
 
 
331 aa  401  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1902  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 
330 aa  404  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1902  ketol-acid reductoisomerase  60.3 
 
 
341 aa  401  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1976  ketol-acid reductoisomerase  60.3 
 
 
341 aa  401  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  59.26 
 
 
330 aa  401  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  57.98 
 
 
340 aa  404  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1987  ketol-acid reductoisomerase  60.3 
 
 
341 aa  401  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  60.55 
 
 
338 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0329  ketol-acid reductoisomerase  58.54 
 
 
339 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1367  ketol-acid reductoisomerase  58.9 
 
 
340 aa  404  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.845865  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  59.63 
 
 
338 aa  401  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  62.92 
 
 
331 aa  404  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  58.84 
 
 
339 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  61.16 
 
 
335 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  60.12 
 
 
327 aa  398  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  60.12 
 
 
339 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0361  ketol-acid reductoisomerase  58.23 
 
 
339 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2418  ketol-acid reductoisomerase  58.59 
 
 
339 aa  399  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1490  ketol-acid reductoisomerase  58.59 
 
 
339 aa  398  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  61.16 
 
 
338 aa  400  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0851  ketol-acid reductoisomerase  59.08 
 
 
330 aa  398  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  59.51 
 
 
338 aa  395  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0867  ketol-acid reductoisomerase  58.28 
 
 
340 aa  395  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6082  ketol-acid reductoisomerase  58.59 
 
 
339 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3248  ketol-acid reductoisomerase  58.9 
 
 
339 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167766  normal  0.961188 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0948  ketol-acid reductoisomerase  57.98 
 
 
340 aa  395  1e-109  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.525725  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3480  ketol-acid reductoisomerase  58.23 
 
 
341 aa  396  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.161207  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1545  ketol-acid reductoisomerase  59.45 
 
 
340 aa  394  1e-108  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.159876  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2466  ketol-acid reductoisomerase  58.41 
 
 
339 aa  392  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498417  normal  0.4902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3416  ketol-acid reductoisomerase  57.62 
 
 
339 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2102  ketol-acid reductoisomerase  57.98 
 
 
339 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  58.91 
 
 
333 aa  392  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1496  ketol-acid reductoisomerase  58.72 
 
 
339 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0558834  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  62.39 
 
 
338 aa  388  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  58.36 
 
 
338 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2341  ketol-acid reductoisomerase  57.36 
 
 
339 aa  390  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 
338 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 
338 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3341  ketol-acid reductoisomerase  57.67 
 
 
339 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.764687  normal  0.0745922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>