More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3480 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3480  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 		 341 aa  705    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.161207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6019  ketol-acid reductoisomerase  63.14 
 
 		 337 aa  439  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390752  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  59.52 
 
 		 338 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  58.97 
 
 		 331 aa  418  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  59.02 
 
 		 330 aa  416  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  58.97 
 
 		 330 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1879  ketol-acid reductoisomerase  63.53 
 
 		 342 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  58.97 
 
 		 330 aa  412  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  57.32 
 
 		 329 aa  412  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08890  ketol-acid reductoisomerase  62.54 
 
 		 337 aa  412  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  59.2 
 
 		 338 aa  412  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  58.28 
 
 		 335 aa  410  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  59.63 
 
 		 331 aa  407  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1235  ketol-acid reductoisomerase  62.24 
 
 		 337 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.362141 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 		 331 aa  408  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  59.63 
 
 		 331 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  59.02 
 
 		 331 aa  409  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3638  ketol-acid reductoisomerase  62.58 
 
 		 329 aa  410  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  59.08 
 
 		 337 aa  408  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  59.63 
 
 		 331 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 		 331 aa  404  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1902  ketol-acid reductoisomerase  62.39 
 
 		 341 aa  404  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4071  ketol-acid reductoisomerase  57.36 
 
 		 342 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1092  ketol-acid reductoisomerase  61.89 
 
 		 331 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  58.72 
 
 		 331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1907  ketol-acid reductoisomerase  57.36 
 
 		 339 aa  404  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.022886  hitchhiker  0.0000179587 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1245  ketol-acid reductoisomerase  61.49 
 
 		 331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2142  ketol-acid reductoisomerase  57.58 
 
 		 340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0716485  normal  0.0660754 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  57.19 
 
 		 336 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  58.41 
 
 		 330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2172  ketol-acid reductoisomerase  57.45 
 
 		 330 aa  401  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  59.52 
 
 		 338 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  59.1 
 
 		 339 aa  402  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1987  ketol-acid reductoisomerase  62.08 
 
 		 341 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  58.01 
 
 		 338 aa  402  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3563  ketol-acid reductoisomerase  57.54 
 
 		 330 aa  403  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0252536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1490  ketol-acid reductoisomerase  57.23 
 
 		 339 aa  401  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  57.27 
 
 		 327 aa  401  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7780  ketol-acid reductoisomerase  59.94 
 
 		 331 aa  402  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.543395 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  62.92 
 
 		 330 aa  403  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1976  ketol-acid reductoisomerase  62.08 
 
 		 341 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  58.36 
 
 		 330 aa  403  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  59.63 
 
 		 329 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1468  ketol-acid reductoisomerase  58.36 
 
 		 342 aa  403  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000508699  normal  0.0138391 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0867  ketol-acid reductoisomerase  56.89 
 
 		 340 aa  402  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  59.02 
 
 		 329 aa  401  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0065  ketol-acid reductoisomerase  60.06 
 
 		 333 aa  401  1e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000348279  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  59.02 
 
 		 329 aa  401  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1125  ketol-acid reductoisomerase  61.03 
 
 		 337 aa  401  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891733 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  59.52 
 
 		 338 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10850  ketol-acid reductoisomerase  60.55 
 
 		 330 aa  398  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1902  ketol-acid reductoisomerase  57.14 
 
 		 330 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0851  ketol-acid reductoisomerase  57.45 
 
 		 330 aa  398  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  57.1 
 
 		 338 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1242  ketol-acid reductoisomerase  54.95 
 
 		 340 aa  397  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  58.41 
 
 		 329 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  56.59 
 
 		 338 aa  397  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3552  ketol-acid reductoisomerase  58.23 
 
 		 330 aa  396  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.665615  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  55.96 
 
 		 333 aa  395  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1343  ketol-acid reductoisomerase  58.48 
 
 		 331 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2749  ketol-acid reductoisomerase  55.72 
 
 		 339 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1581  ketol-acid reductoisomerase  56.76 
 
 		 340 aa  393  1e-108  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  56.19 
 
 		 338 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1962  ketol-acid reductoisomerase  56.02 
 
 		 339 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.971323  normal  0.40215 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0613  ketol-acid reductoisomerase  56.53 
 
 		 331 aa  393  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398516  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  57.19 
 
 		 331 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2418  ketol-acid reductoisomerase  58.72 
 
 		 339 aa  393  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  55.69 
 
 		 338 aa  394  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0285  ketol-acid reductoisomerase  56.06 
 
 		 339 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.772607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2492  ketol-acid reductoisomerase  55.72 
 
 		 339 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal  0.156046 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2819  ketol-acid reductoisomerase  55.15 
 
 		 333 aa  393  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0329  ketol-acid reductoisomerase  56.06 
 
 		 339 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1472  ketol-acid reductoisomerase  55.75 
 
 		 346 aa  391  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  56.36 
 
 		 339 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0228  ketol-acid reductoisomerase  59.34 
 
 		 332 aa  393  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000772212  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3416  ketol-acid reductoisomerase  55.45 
 
 		 339 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1905  ketol-acid reductoisomerase  58.84 
 
 		 333 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  57.45 
 
 		 339 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  58.36 
 
 		 330 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  54.49 
 
 		 340 aa  390  1e-107  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1367  ketol-acid reductoisomerase  54.19 
 
 		 340 aa  389  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.845865  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2778  ketol-acid reductoisomerase  54.82 
 
 		 339 aa  388  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0361  ketol-acid reductoisomerase  55.76 
 
 		 339 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  58.48 
 
 		 331 aa  391  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  54.49 
 
 		 340 aa  391  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1545  ketol-acid reductoisomerase  56.53 
 
 		 340 aa  389  1e-107  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.159876  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1496  ketol-acid reductoisomerase  55.42 
 
 		 339 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0558834  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  57.27 
 
 		 331 aa  389  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1127  ketol-acid reductoisomerase  55.99 
 
 		 340 aa  390  1e-107  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  55.66 
 
 		 339 aa  385  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1020  ketol-acid reductoisomerase  59.09 
 
 		 331 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.488917 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2518  ketol-acid reductoisomerase  55.59 
 
 		 338 aa  387  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  55.39 
 
 		 338 aa  385  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  58.36 
 
 		 344 aa  384  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0991  ketol-acid reductoisomerase  59.09 
 
 		 331 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1337  ketol-acid reductoisomerase  58.31 
 
 		 342 aa  387  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0600  ketol-acid reductoisomerase  56.12 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0917  ketol-acid reductoisomerase  55.59 
 
 		 339 aa  385  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0699462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>