More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7780 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7780  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 		 331 aa  680    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.543395 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4071  ketol-acid reductoisomerase  74.62 
 
 		 342 aa  512  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2819  ketol-acid reductoisomerase  73.86 
 
 		 333 aa  512  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0708  ketol-acid reductoisomerase  73.94 
 
 		 355 aa  509  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3552  ketol-acid reductoisomerase  73.94 
 
 		 330 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.665615  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1468  ketol-acid reductoisomerase  73.31 
 
 		 342 aa  506  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000508699  normal  0.0138391 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6019  ketol-acid reductoisomerase  72.09 
 
 		 337 aa  494  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390752  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0613  ketol-acid reductoisomerase  70.43 
 
 		 331 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398516  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1337  ketol-acid reductoisomerase  72.64 
 
 		 342 aa  485  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8057  Ketol-acid reductoisomerase  74.47 
 
 		 329 aa  487  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0173  ketol-acid reductoisomerase  71.04 
 
 		 331 aa  474  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08890  ketol-acid reductoisomerase  71.17 
 
 		 337 aa  464  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3228  ketol-acid reductoisomerase  66.56 
 
 		 337 aa  458  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1092  ketol-acid reductoisomerase  69.21 
 
 		 331 aa  457  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3390  ketol-acid reductoisomerase  69 
 
 		 342 aa  457  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606091  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13016  ketol-acid reductoisomerase  65.85 
 
 		 333 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00176679  normal  0.164078 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3638  ketol-acid reductoisomerase  68.29 
 
 		 329 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1125  ketol-acid reductoisomerase  69.33 
 
 		 337 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1235  ketol-acid reductoisomerase  68.71 
 
 		 337 aa  447  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.362141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4354  ketol-acid reductoisomerase  69.82 
 
 		 336 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00327651  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2140  ketol-acid reductoisomerase  67.78 
 
 		 342 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2862  ketol-acid reductoisomerase  67.08 
 
 		 333 aa  446  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10700  ketol-acid reductoisomerase  67.17 
 
 		 342 aa  444  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.72382 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18790  ketol-acid reductoisomerase  66.97 
 
 		 343 aa  441  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1410  ketol-acid reductoisomerase  66.57 
 
 		 342 aa  439  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1908  ketol-acid reductoisomerase  65.64 
 
 		 337 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20924  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1888  ketol-acid reductoisomerase  65.64 
 
 		 337 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.0861807 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1954  ketol-acid reductoisomerase  65.64 
 
 		 337 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.85036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08550  ketol-acid reductoisomerase  66.56 
 
 		 343 aa  435  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0566957  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4237  ketol-acid reductoisomerase  64.72 
 
 		 337 aa  435  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.317024  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  61.09 
 
 		 331 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2124  ketol-acid reductoisomerase  65.03 
 
 		 337 aa  437  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1902  ketol-acid reductoisomerase  64.85 
 
 		 341 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  61.21 
 
 		 331 aa  433  1e-120  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1708  ketol-acid reductoisomerase  65.96 
 
 		 345 aa  432  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.301189 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2384  ketol-acid reductoisomerase  66.36 
 
 		 341 aa  434  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1987  ketol-acid reductoisomerase  64.55 
 
 		 341 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  60.3 
 
 		 331 aa  429  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1976  ketol-acid reductoisomerase  64.55 
 
 		 341 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  59.57 
 
 		 329 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1165  ketol-acid reductoisomerase  65.65 
 
 		 342 aa  430  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal  0.0402172 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  59.57 
 
 		 329 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1879  ketol-acid reductoisomerase  63.83 
 
 		 342 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  59.57 
 
 		 329 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  62.73 
 
 		 331 aa  424  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  58.97 
 
 		 331 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  59.76 
 
 		 329 aa  421  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1242  ketol-acid reductoisomerase  60.37 
 
 		 340 aa  421  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 		 335 aa  423  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3480  ketol-acid reductoisomerase  59.94 
 
 		 341 aa  421  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.161207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 		 331 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  59.27 
 
 		 329 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  60.3 
 
 		 331 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 		 330 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 		 333 aa  419  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  59.27 
 
 		 331 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  59.76 
 
 		 330 aa  419  1e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  64.49 
 
 		 337 aa  421  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  61.82 
 
 		 331 aa  414  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  62.12 
 
 		 331 aa  415  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  60.74 
 
 		 330 aa  411  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  60.24 
 
 		 327 aa  414  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  60.19 
 
 		 330 aa  414  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2537  ketol-acid reductoisomerase  63 
 
 		 341 aa  411  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00800327  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4447  ketol-acid reductoisomerase  61.4 
 
 		 337 aa  408  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  59.27 
 
 		 339 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  62.12 
 
 		 330 aa  409  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3892  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 		 336 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2277  ketol-acid reductoisomerase  63 
 
 		 341 aa  409  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1127  ketol-acid reductoisomerase  59.45 
 
 		 340 aa  409  1e-113  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1490  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 		 336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1519  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 		 336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  60.86 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1310  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 		 336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1283  ketol-acid reductoisomerase  61.4 
 
 		 336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1284  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 		 336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 		 330 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1558  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 		 336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1875  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 		 331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000873272 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1419  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 		 336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  57.88 
 
 		 331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1452  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 		 336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2767  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 		 352 aa  404  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1321  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 		 336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02605  ketol-acid reductoisomerase  59.35 
 
 		 333 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1905  ketol-acid reductoisomerase  60.98 
 
 		 333 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1902  ketol-acid reductoisomerase  59.08 
 
 		 330 aa  403  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0374  ketol-acid reductoisomerase  58.23 
 
 		 340 aa  404  1e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  60.98 
 
 		 330 aa  401  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  60.91 
 
 		 336 aa  403  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1690  ketol-acid reductoisomerase  61.28 
 
 		 331 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300621  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1716  ketol-acid reductoisomerase  62.77 
 
 		 335 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0329  ketol-acid reductoisomerase  58.23 
 
 		 339 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1107  ketol-acid reductoisomerase  59.03 
 
 		 335 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1852  ketol-acid reductoisomerase  62.77 
 
 		 335 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1890  ketol-acid reductoisomerase  62.77 
 
 		 335 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1122  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 		 336 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0870487  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  60.61 
 
 		 336 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  58.84 
 
 		 339 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1709  ketol-acid reductoisomerase  62.58 
 
 		 337 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>