More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1708 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1708  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 		 345 aa  697    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.301189 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10700  ketol-acid reductoisomerase  90.43 
 
 		 342 aa  605  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.72382 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1165  ketol-acid reductoisomerase  86.38 
 
 		 342 aa  580  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal  0.0402172 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1410  ketol-acid reductoisomerase  84.93 
 
 		 342 aa  567  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3390  ketol-acid reductoisomerase  80 
 
 		 342 aa  543  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606091  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2140  ketol-acid reductoisomerase  77.39 
 
 		 342 aa  530  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1337  ketol-acid reductoisomerase  78.26 
 
 		 342 aa  516  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08550  ketol-acid reductoisomerase  77.13 
 
 		 343 aa  514  1.0000000000000001e-145  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0566957  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2384  ketol-acid reductoisomerase  77.1 
 
 		 341 aa  511  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2537  ketol-acid reductoisomerase  74.78 
 
 		 341 aa  508  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00800327  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18790  ketol-acid reductoisomerase  74.78 
 
 		 343 aa  504  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2277  ketol-acid reductoisomerase  73.62 
 
 		 341 aa  502  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1468  ketol-acid reductoisomerase  71.72 
 
 		 342 aa  502  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000508699  normal  0.0138391 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4071  ketol-acid reductoisomerase  71.18 
 
 		 342 aa  493  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6019  ketol-acid reductoisomerase  67.57 
 
 		 337 aa  461  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390752  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08890  ketol-acid reductoisomerase  70.57 
 
 		 337 aa  458  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2819  ketol-acid reductoisomerase  65.96 
 
 		 333 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3552  ketol-acid reductoisomerase  66.67 
 
 		 330 aa  450  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.665615  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0613  ketol-acid reductoisomerase  64.63 
 
 		 331 aa  444  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398516  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8057  Ketol-acid reductoisomerase  66.26 
 
 		 329 aa  432  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3228  ketol-acid reductoisomerase  64.02 
 
 		 337 aa  432  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  62.24 
 
 		 331 aa  431  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7780  ketol-acid reductoisomerase  65.96 
 
 		 331 aa  431  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.543395 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1326  ketol-acid reductoisomerase  60.81 
 
 		 350 aa  431  1e-119  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  62.92 
 
 		 331 aa  429  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1125  ketol-acid reductoisomerase  66.67 
 
 		 337 aa  425  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1235  ketol-acid reductoisomerase  67.27 
 
 		 337 aa  426  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.362141 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  62.61 
 
 		 331 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 		 331 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 		 331 aa  422  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3638  ketol-acid reductoisomerase  65.14 
 
 		 329 aa  422  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0173  ketol-acid reductoisomerase  64.94 
 
 		 331 aa  421  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1092  ketol-acid reductoisomerase  64.53 
 
 		 331 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  58.97 
 
 		 329 aa  415  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1879  ketol-acid reductoisomerase  60.71 
 
 		 342 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 		 331 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1888  ketol-acid reductoisomerase  62.8 
 
 		 337 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.0861807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1908  ketol-acid reductoisomerase  62.8 
 
 		 337 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20924  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1902  ketol-acid reductoisomerase  61.42 
 
 		 341 aa  414  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0708  ketol-acid reductoisomerase  62.05 
 
 		 355 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1954  ketol-acid reductoisomerase  62.8 
 
 		 337 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.85036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  58.66 
 
 		 329 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13016  ketol-acid reductoisomerase  61.45 
 
 		 333 aa  413  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00176679  normal  0.164078 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1987  ketol-acid reductoisomerase  61.13 
 
 		 341 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2862  ketol-acid reductoisomerase  63.3 
 
 		 333 aa  413  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2130  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 		 334 aa  411  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  61.23 
 
 		 339 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  58.97 
 
 		 329 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  61.47 
 
 		 327 aa  414  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1976  ketol-acid reductoisomerase  61.13 
 
 		 341 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2093  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 		 334 aa  411  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  59.94 
 
 		 338 aa  412  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 		 338 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  59.94 
 
 		 338 aa  411  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  59.76 
 
 		 339 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  58.31 
 
 		 331 aa  408  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  60.55 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1490  ketol-acid reductoisomerase  60.24 
 
 		 339 aa  409  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  58.66 
 
 		 329 aa  408  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2124  ketol-acid reductoisomerase  62.2 
 
 		 337 aa  408  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 		 339 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2418  ketol-acid reductoisomerase  59.64 
 
 		 339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4237  ketol-acid reductoisomerase  61.59 
 
 		 337 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.317024  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0285  ketol-acid reductoisomerase  59.38 
 
 		 339 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.772607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  64.17 
 
 		 337 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0329  ketol-acid reductoisomerase  59.38 
 
 		 339 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  58.05 
 
 		 333 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  63 
 
 		 338 aa  403  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  58.77 
 
 		 338 aa  402  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 		 338 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  59.69 
 
 		 339 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0504  ketol-acid reductoisomerase  57.72 
 
 		 338 aa  401  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000262639  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3416  ketol-acid reductoisomerase  58.1 
 
 		 339 aa  401  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 		 338 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0361  ketol-acid reductoisomerase  59.38 
 
 		 339 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1327  ketol-acid reductoisomerase  60.81 
 
 		 350 aa  404  1e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0867  ketol-acid reductoisomerase  61.11 
 
 		 340 aa  401  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  57.85 
 
 		 336 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  60.3 
 
 		 331 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  58.97 
 
 		 338 aa  398  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 		 331 aa  400  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3341  ketol-acid reductoisomerase  58.23 
 
 		 339 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.764687  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3248  ketol-acid reductoisomerase  58.23 
 
 		 339 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167766  normal  0.961188 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2102  ketol-acid reductoisomerase  57.62 
 
 		 339 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6082  ketol-acid reductoisomerase  58.23 
 
 		 339 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1668  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 		 334 aa  396  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  58.95 
 
 		 338 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  58.05 
 
 		 338 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1875  ketol-acid reductoisomerase  58.1 
 
 		 331 aa  397  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000873272 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1581  ketol-acid reductoisomerase  58.33 
 
 		 340 aa  396  1e-109  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2341  ketol-acid reductoisomerase  57.14 
 
 		 339 aa  395  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2518  ketol-acid reductoisomerase  59.15 
 
 		 338 aa  395  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  59.69 
 
 		 339 aa  395  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1242  ketol-acid reductoisomerase  58.72 
 
 		 340 aa  396  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1496  ketol-acid reductoisomerase  57.45 
 
 		 339 aa  395  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0558834  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  57.62 
 
 		 329 aa  394  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2466  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 		 339 aa  397  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498417  normal  0.4902 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  58.95 
 
 		 338 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2501  ketol-acid reductoisomerase  58.95 
 
 		 338 aa  395  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000349706  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  57.1 
 
 		 340 aa  395  1e-109  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>