More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1410 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1410  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
342 aa  692    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10700  ketol-acid reductoisomerase  87.13 
 
 
342 aa  585  1e-166  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.72382 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1165  ketol-acid reductoisomerase  87.13 
 
 
342 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal  0.0402172 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1708  ketol-acid reductoisomerase  84.93 
 
 
345 aa  568  1e-161  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.301189 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3390  ketol-acid reductoisomerase  80.99 
 
 
342 aa  549  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606091  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2140  ketol-acid reductoisomerase  79.24 
 
 
342 aa  542  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1337  ketol-acid reductoisomerase  80.41 
 
 
342 aa  536  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2384  ketol-acid reductoisomerase  79.53 
 
 
341 aa  526  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1468  ketol-acid reductoisomerase  74.71 
 
 
342 aa  520  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000508699  normal  0.0138391 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2537  ketol-acid reductoisomerase  73.98 
 
 
341 aa  504  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00800327  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4071  ketol-acid reductoisomerase  73.31 
 
 
342 aa  502  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2277  ketol-acid reductoisomerase  72.81 
 
 
341 aa  499  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08550  ketol-acid reductoisomerase  74.26 
 
 
343 aa  497  1e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0566957  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18790  ketol-acid reductoisomerase  72.89 
 
 
343 aa  496  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6019  ketol-acid reductoisomerase  69.33 
 
 
337 aa  462  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390752  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3552  ketol-acid reductoisomerase  67.48 
 
 
330 aa  457  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.665615  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2819  ketol-acid reductoisomerase  65.77 
 
 
333 aa  450  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08890  ketol-acid reductoisomerase  70.25 
 
 
337 aa  449  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0613  ketol-acid reductoisomerase  65.24 
 
 
331 aa  444  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398516  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3228  ketol-acid reductoisomerase  65.64 
 
 
337 aa  442  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7780  ketol-acid reductoisomerase  66.57 
 
 
331 aa  437  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.543395 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1235  ketol-acid reductoisomerase  69.63 
 
 
337 aa  435  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.362141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8057  Ketol-acid reductoisomerase  66.57 
 
 
329 aa  431  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1125  ketol-acid reductoisomerase  69.02 
 
 
337 aa  434  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000891733 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1326  ketol-acid reductoisomerase  62.54 
 
 
350 aa  429  1e-119  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13016  ketol-acid reductoisomerase  64 
 
 
333 aa  428  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00176679  normal  0.164078 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  61.03 
 
 
331 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0173  ketol-acid reductoisomerase  65.85 
 
 
331 aa  428  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 
329 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1092  ketol-acid reductoisomerase  65.55 
 
 
331 aa  426  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 
329 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0708  ketol-acid reductoisomerase  64.85 
 
 
355 aa  425  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57193  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  61.09 
 
 
331 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1888  ketol-acid reductoisomerase  64.42 
 
 
337 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.0861807 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  61.4 
 
 
331 aa  424  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 
331 aa  421  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3638  ketol-acid reductoisomerase  65.24 
 
 
329 aa  422  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 
329 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1908  ketol-acid reductoisomerase  64.42 
 
 
337 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20924  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  59.57 
 
 
329 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1954  ketol-acid reductoisomerase  64.42 
 
 
337 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.85036  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 
331 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2862  ketol-acid reductoisomerase  64.62 
 
 
333 aa  421  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  64.51 
 
 
337 aa  418  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 
338 aa  420  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1902  ketol-acid reductoisomerase  60.83 
 
 
341 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2124  ketol-acid reductoisomerase  63.5 
 
 
337 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322343  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  58.97 
 
 
331 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2518  ketol-acid reductoisomerase  62.5 
 
 
338 aa  412  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1987  ketol-acid reductoisomerase  60.53 
 
 
341 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4237  ketol-acid reductoisomerase  62.88 
 
 
337 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.317024  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1976  ketol-acid reductoisomerase  60.53 
 
 
341 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0504  ketol-acid reductoisomerase  59.38 
 
 
338 aa  411  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000262639  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1989  ketol-acid reductoisomerase  60.12 
 
 
338 aa  408  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 
338 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1242  ketol-acid reductoisomerase  59.41 
 
 
340 aa  410  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  58.18 
 
 
333 aa  410  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2501  ketol-acid reductoisomerase  60.74 
 
 
338 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000349706  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 
338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  59.27 
 
 
339 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1875  ketol-acid reductoisomerase  58.59 
 
 
331 aa  402  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000873272 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  56.29 
 
 
335 aa  403  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 
336 aa  404  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  59.33 
 
 
329 aa  401  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1780  ketol-acid reductoisomerase  59.45 
 
 
338 aa  401  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  59.69 
 
 
338 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  59.69 
 
 
338 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 
338 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 
338 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4354  ketol-acid reductoisomerase  61.89 
 
 
336 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00327651  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  59.58 
 
 
336 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0867  ketol-acid reductoisomerase  59.08 
 
 
340 aa  398  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2130  ketol-acid reductoisomerase  61.09 
 
 
334 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1879  ketol-acid reductoisomerase  57.82 
 
 
342 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08830  ketol-acid reductoisomerase  57.67 
 
 
331 aa  401  9.999999999999999e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.334822  normal  0.238181 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1902  ketol-acid reductoisomerase  57.23 
 
 
330 aa  398  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  59.51 
 
 
327 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  58.9 
 
 
339 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  58.28 
 
 
339 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 
338 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42500  ketol-acid reductoisomerase  59.51 
 
 
338 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  58.9 
 
 
338 aa  398  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  58.59 
 
 
338 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2093  ketol-acid reductoisomerase  61.09 
 
 
334 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  58.41 
 
 
339 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  59.52 
 
 
331 aa  397  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1327  ketol-acid reductoisomerase  62.54 
 
 
350 aa  396  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0329  ketol-acid reductoisomerase  57.36 
 
 
339 aa  395  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  58.36 
 
 
331 aa  395  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0285  ketol-acid reductoisomerase  57.36 
 
 
339 aa  395  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.772607  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1127  ketol-acid reductoisomerase  57.67 
 
 
340 aa  395  1e-109  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1668  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 
334 aa  394  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  58.36 
 
 
338 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0361  ketol-acid reductoisomerase  57.36 
 
 
339 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0529  ketol-acid reductoisomerase  58.15 
 
 
338 aa  392  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  57.36 
 
 
336 aa  393  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0541  ketol-acid reductoisomerase  58.77 
 
 
340 aa  394  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2539  ketol-acid reductoisomerase  59.57 
 
 
338 aa  392  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0383173  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  56.84 
 
 
330 aa  394  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2466  ketol-acid reductoisomerase  58.36 
 
 
339 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498417  normal  0.4902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>