More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4354 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4354  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 		 336 aa  689    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00327651  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6019  ketol-acid reductoisomerase  71.43 
 
 		 337 aa  500  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390752  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2819  ketol-acid reductoisomerase  68.69 
 
 		 333 aa  479  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0613  ketol-acid reductoisomerase  69.09 
 
 		 331 aa  476  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398516  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3228  ketol-acid reductoisomerase  67.36 
 
 		 337 aa  468  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13016  ketol-acid reductoisomerase  67.87 
 
 		 333 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00176679  normal  0.164078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3552  ketol-acid reductoisomerase  69 
 
 		 330 aa  464  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.665615  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08890  ketol-acid reductoisomerase  70.92 
 
 		 337 aa  460  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1468  ketol-acid reductoisomerase  67.17 
 
 		 342 aa  459  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000508699  normal  0.0138391 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2862  ketol-acid reductoisomerase  68.47 
 
 		 333 aa  457  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0173  ketol-acid reductoisomerase  69.09 
 
 		 331 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0708  ketol-acid reductoisomerase  68.29 
 
 		 355 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4071  ketol-acid reductoisomerase  67.48 
 
 		 342 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1888  ketol-acid reductoisomerase  66.47 
 
 		 337 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.0861807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1908  ketol-acid reductoisomerase  66.47 
 
 		 337 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20924  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7780  ketol-acid reductoisomerase  69.82 
 
 		 331 aa  449  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.543395 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1954  ketol-acid reductoisomerase  66.47 
 
 		 337 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.85036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1092  ketol-acid reductoisomerase  67.68 
 
 		 331 aa  444  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3638  ketol-acid reductoisomerase  67.79 
 
 		 329 aa  445  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4237  ketol-acid reductoisomerase  65.88 
 
 		 337 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.317024  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8057  Ketol-acid reductoisomerase  68.2 
 
 		 329 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2124  ketol-acid reductoisomerase  65.58 
 
 		 337 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1125  ketol-acid reductoisomerase  67.66 
 
 		 337 aa  442  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1235  ketol-acid reductoisomerase  67.06 
 
 		 337 aa  436  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.362141 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  59.94 
 
 		 330 aa  429  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  64.92 
 
 		 337 aa  427  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  61.4 
 
 		 331 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  60.98 
 
 		 330 aa  427  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2172  ketol-acid reductoisomerase  60.67 
 
 		 330 aa  424  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  60.37 
 
 		 339 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  60.74 
 
 		 339 aa  426  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2418  ketol-acid reductoisomerase  61.04 
 
 		 339 aa  426  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18790  ketol-acid reductoisomerase  62.54 
 
 		 343 aa  421  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1902  ketol-acid reductoisomerase  60.06 
 
 		 330 aa  424  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  61.28 
 
 		 331 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  61.59 
 
 		 330 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  59.76 
 
 		 330 aa  422  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 		 339 aa  420  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  59.57 
 
 		 331 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  62.92 
 
 		 331 aa  418  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1545  ketol-acid reductoisomerase  61.47 
 
 		 340 aa  421  1e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.159876  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08550  ketol-acid reductoisomerase  65.15 
 
 		 343 aa  420  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0566957  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  60.06 
 
 		 331 aa  419  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1490  ketol-acid reductoisomerase  59.57 
 
 		 339 aa  418  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  60.67 
 
 		 333 aa  418  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  59.02 
 
 		 330 aa  418  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0329  ketol-acid reductoisomerase  59.27 
 
 		 339 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2466  ketol-acid reductoisomerase  60.43 
 
 		 339 aa  416  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498417  normal  0.4902 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  59.15 
 
 		 331 aa  415  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3341  ketol-acid reductoisomerase  59.15 
 
 		 339 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.764687  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0285  ketol-acid reductoisomerase  59.27 
 
 		 339 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.772607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2720  ketol-acid reductoisomerase  57.62 
 
 		 339 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194376  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  60.55 
 
 		 338 aa  416  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  57.01 
 
 		 338 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0361  ketol-acid reductoisomerase  59.27 
 
 		 339 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  59.02 
 
 		 329 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  58.72 
 
 		 329 aa  411  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1962  ketol-acid reductoisomerase  59.1 
 
 		 339 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.971323  normal  0.40215 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3248  ketol-acid reductoisomerase  58.54 
 
 		 339 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167766  normal  0.961188 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  59.02 
 
 		 329 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2102  ketol-acid reductoisomerase  58.23 
 
 		 339 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3106  ketol-acid reductoisomerase  63.41 
 
 		 345 aa  412  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0851  ketol-acid reductoisomerase  57.93 
 
 		 330 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2492  ketol-acid reductoisomerase  57.61 
 
 		 339 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal  0.156046 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1875  ketol-acid reductoisomerase  59.16 
 
 		 331 aa  407  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000873272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3563  ketol-acid reductoisomerase  59.21 
 
 		 330 aa  409  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0252536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2341  ketol-acid reductoisomerase  57.32 
 
 		 339 aa  408  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3416  ketol-acid reductoisomerase  58.97 
 
 		 339 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  58.9 
 
 		 339 aa  410  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2767  ketol-acid reductoisomerase  57.93 
 
 		 352 aa  409  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6082  ketol-acid reductoisomerase  57.93 
 
 		 339 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  58.54 
 
 		 331 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  58.54 
 
 		 331 aa  408  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  59.63 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1165  ketol-acid reductoisomerase  62.8 
 
 		 342 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal  0.0402172 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  57.06 
 
 		 338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  58.72 
 
 		 330 aa  404  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2749  ketol-acid reductoisomerase  57.61 
 
 		 339 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  58.41 
 
 		 329 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3480  ketol-acid reductoisomerase  58.43 
 
 		 341 aa  405  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.161207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  58.23 
 
 		 331 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  56.76 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  60.06 
 
 		 338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1242  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 		 340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  59.63 
 
 		 338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1879  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 		 342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2559  ketol-acid reductoisomerase  58.54 
 
 		 339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1127  ketol-acid reductoisomerase  57.1 
 
 		 340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3390  ketol-acid reductoisomerase  62.5 
 
 		 342 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606091  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1337  ketol-acid reductoisomerase  63.11 
 
 		 342 aa  404  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2778  ketol-acid reductoisomerase  57.45 
 
 		 339 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0374  ketol-acid reductoisomerase  57.4 
 
 		 340 aa  402  1e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0867  ketol-acid reductoisomerase  58.43 
 
 		 340 aa  404  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  59.2 
 
 		 336 aa  401  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1410  ketol-acid reductoisomerase  61.89 
 
 		 342 aa  401  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 		 331 aa  399  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  57.14 
 
 		 339 aa  398  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1987  ketol-acid reductoisomerase  59.76 
 
 		 341 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1976  ketol-acid reductoisomerase  59.76 
 
 		 341 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2384  ketol-acid reductoisomerase  63.19 
 
 		 341 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>