More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0739 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2172  ketol-acid reductoisomerase  90.61 
 
 		 330 aa  634    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 		 330 aa  686    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  89.7 
 
 		 330 aa  625  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  88.18 
 
 		 330 aa  619  1e-176  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0851  ketol-acid reductoisomerase  87.58 
 
 		 330 aa  618  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1902  ketol-acid reductoisomerase  88.18 
 
 		 330 aa  617  1e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  87.58 
 
 		 330 aa  615  1e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  67.88 
 
 		 337 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  63 
 
 		 338 aa  441  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  62.58 
 
 		 327 aa  434  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  61.35 
 
 		 331 aa  435  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  63.8 
 
 		 331 aa  424  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  64.11 
 
 		 331 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  61.77 
 
 		 338 aa  425  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  63.3 
 
 		 338 aa  422  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1875  ketol-acid reductoisomerase  62.04 
 
 		 331 aa  422  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000873272 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  61.42 
 
 		 331 aa  422  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0504  ketol-acid reductoisomerase  59.94 
 
 		 338 aa  422  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000262639  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  63.3 
 
 		 338 aa  422  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  63.64 
 
 		 330 aa  421  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  59.02 
 
 		 338 aa  418  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 		 338 aa  417  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  61.11 
 
 		 331 aa  420  1e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  59.33 
 
 		 338 aa  418  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  59.57 
 
 		 338 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6019  ketol-acid reductoisomerase  60.19 
 
 		 337 aa  419  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390752  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  60.24 
 
 		 338 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  61.77 
 
 		 338 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 		 331 aa  414  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  64.42 
 
 		 330 aa  415  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2121  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 		 338 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  60.8 
 
 		 331 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  60.55 
 
 		 336 aa  414  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1343  ketol-acid reductoisomerase  61.77 
 
 		 331 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1690  ketol-acid reductoisomerase  63.03 
 
 		 331 aa  414  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300621  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3480  ketol-acid reductoisomerase  58.97 
 
 		 341 aa  412  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.161207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0529  ketol-acid reductoisomerase  57.8 
 
 		 338 aa  411  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 		 331 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2166  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 		 329 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08830  ketol-acid reductoisomerase  61.3 
 
 		 331 aa  412  1e-114  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.334822  normal  0.238181 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13016  ketol-acid reductoisomerase  58.64 
 
 		 333 aa  412  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00176679  normal  0.164078 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  59.27 
 
 		 338 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  58.36 
 
 		 329 aa  411  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2501  ketol-acid reductoisomerase  58.97 
 
 		 338 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000349706  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  60.86 
 
 		 338 aa  413  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2819  ketol-acid reductoisomerase  60.19 
 
 		 333 aa  411  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  59.57 
 
 		 331 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  58.66 
 
 		 338 aa  408  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0611  ketol-acid reductoisomerase  58.72 
 
 		 338 aa  408  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  57.8 
 
 		 338 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0613  ketol-acid reductoisomerase  59.57 
 
 		 331 aa  409  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398516  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1989  ketol-acid reductoisomerase  57.49 
 
 		 338 aa  410  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  58.72 
 
 		 330 aa  408  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42500  ketol-acid reductoisomerase  58.1 
 
 		 338 aa  408  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 		 329 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  59.27 
 
 		 338 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1545  ketol-acid reductoisomerase  58.64 
 
 		 340 aa  408  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.159876  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0524  ketol-acid reductoisomerase  57.49 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.181387  normal  0.0101595 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  60.3 
 
 		 331 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  59.27 
 
 		 338 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  60.19 
 
 		 329 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  57.8 
 
 		 338 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  59.27 
 
 		 330 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 		 329 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1780  ketol-acid reductoisomerase  58.41 
 
 		 338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1092  ketol-acid reductoisomerase  61.35 
 
 		 331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0991  ketol-acid reductoisomerase  63.91 
 
 		 331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1907  ketol-acid reductoisomerase  59.76 
 
 		 339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.022886  hitchhiker  0.0000179587 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  60.19 
 
 		 329 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  58.05 
 
 		 338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3638  ketol-acid reductoisomerase  62.04 
 
 		 329 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3228  ketol-acid reductoisomerase  56.79 
 
 		 337 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1020  ketol-acid reductoisomerase  63.91 
 
 		 331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.488917 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1496  ketol-acid reductoisomerase  56.97 
 
 		 339 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0558834  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  57.45 
 
 		 338 aa  404  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0116  ketol-acid reductoisomerase  56.84 
 
 		 359 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2775  ketol-acid reductoisomerase  57.88 
 
 		 338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.987552  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  59.69 
 
 		 335 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1879  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 		 342 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1902  ketol-acid reductoisomerase  62.04 
 
 		 341 aa  401  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0867  ketol-acid reductoisomerase  56.36 
 
 		 340 aa  402  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3073  ketol-acid reductoisomerase  57.75 
 
 		 338 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3552  ketol-acid reductoisomerase  59.26 
 
 		 330 aa  401  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.665615  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  61.77 
 
 		 331 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2319  ketol-acid reductoisomerase  57.45 
 
 		 338 aa  401  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3229  ketol-acid reductoisomerase  59.27 
 
 		 338 aa  401  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0812  ketol-acid reductoisomerase  58.97 
 
 		 338 aa  401  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  59.94 
 
 		 331 aa  404  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0173  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 		 331 aa  401  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  62.69 
 
 		 341 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  56.67 
 
 		 339 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1421  ketol-acid reductoisomerase  59.57 
 
 		 338 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2518  ketol-acid reductoisomerase  58.66 
 
 		 338 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1047  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 		 338 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00873867  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1976  ketol-acid reductoisomerase  62.04 
 
 		 341 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1115  ketol-acid reductoisomerase  59.57 
 
 		 338 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1330  ketol-acid reductoisomerase  59.02 
 
 		 338 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2020  ketol-acid reductoisomerase  59.57 
 
 		 338 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>