More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0283 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 		 330 aa  682    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  77.88 
 
 		 331 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2484  ketol-acid reductoisomerase  74.85 
 
 		 333 aa  500  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000401864  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10850  ketol-acid reductoisomerase  69.7 
 
 		 330 aa  486  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2144  ketol-acid reductoisomerase  69.25 
 
 		 337 aa  481  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128688  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  65.35 
 
 		 330 aa  478  1e-134  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  66.87 
 
 		 333 aa  476  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0354  ketol-acid reductoisomerase  71.65 
 
 		 341 aa  471  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  65.65 
 
 		 338 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  69.7 
 
 		 331 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0225  ketol-acid reductoisomerase  73.09 
 
 		 330 aa  465  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.677869  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  66.67 
 
 		 331 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  69.39 
 
 		 330 aa  463  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  63.61 
 
 		 338 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  67.88 
 
 		 336 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  67.88 
 
 		 336 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  67.17 
 
 		 344 aa  456  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  63.72 
 
 		 338 aa  457  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  64.74 
 
 		 338 aa  454  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  63.91 
 
 		 338 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1709  ketol-acid reductoisomerase  66.26 
 
 		 337 aa  447  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1968  ketol-acid reductoisomerase  66.06 
 
 		 335 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1853  ketol-acid reductoisomerase  66.06 
 
 		 335 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  67.58 
 
 		 331 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  62.8 
 
 		 338 aa  446  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  65.65 
 
 		 341 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  65.15 
 
 		 341 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 		 338 aa  441  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1879  ketol-acid reductoisomerase  64.83 
 
 		 342 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  64.53 
 
 		 327 aa  444  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1690  ketol-acid reductoisomerase  67.17 
 
 		 331 aa  441  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300621  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1936  ketol-acid reductoisomerase  65.14 
 
 		 335 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1716  ketol-acid reductoisomerase  65.14 
 
 		 335 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1693  ketol-acid reductoisomerase  65.14 
 
 		 335 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1668  ketol-acid reductoisomerase  65.44 
 
 		 335 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  65.35 
 
 		 330 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1852  ketol-acid reductoisomerase  65.14 
 
 		 335 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 		 338 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2319  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 		 338 aa  437  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  63.61 
 
 		 338 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1890  ketol-acid reductoisomerase  65.14 
 
 		 335 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  61.09 
 
 		 338 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  63.61 
 
 		 338 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3489  ketol-acid reductoisomerase  65.44 
 
 		 335 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  61.09 
 
 		 329 aa  434  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1905  ketol-acid reductoisomerase  66.87 
 
 		 333 aa  436  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1976  ketol-acid reductoisomerase  63.64 
 
 		 341 aa  434  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1245  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 		 331 aa  436  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2102  ketol-acid reductoisomerase  60.61 
 
 		 339 aa  434  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  60.06 
 
 		 338 aa  435  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1987  ketol-acid reductoisomerase  63.64 
 
 		 341 aa  434  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1902  ketol-acid reductoisomerase  63.64 
 
 		 341 aa  435  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  64.55 
 
 		 331 aa  437  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2775  ketol-acid reductoisomerase  59.15 
 
 		 338 aa  432  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.987552  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  61.09 
 
 		 330 aa  433  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2166  ketol-acid reductoisomerase  65.35 
 
 		 329 aa  432  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3416  ketol-acid reductoisomerase  60.3 
 
 		 339 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3341  ketol-acid reductoisomerase  60.3 
 
 		 339 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.764687  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  59.27 
 
 		 338 aa  433  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  59.63 
 
 		 336 aa  431  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  60.67 
 
 		 339 aa  428  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  58.97 
 
 		 338 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2142  ketol-acid reductoisomerase  62.61 
 
 		 340 aa  429  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0716485  normal  0.0660754 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 		 335 aa  431  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1907  ketol-acid reductoisomerase  62.61 
 
 		 339 aa  429  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.022886  hitchhiker  0.0000179587 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3073  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 		 338 aa  430  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071293 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3020  ketol-acid reductoisomerase  62.42 
 
 		 336 aa  431  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000242382  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  58.97 
 
 		 338 aa  428  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0812  ketol-acid reductoisomerase  59.27 
 
 		 338 aa  427  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2218  ketol-acid reductoisomerase  62.24 
 
 		 331 aa  429  1e-119  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 		 331 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2466  ketol-acid reductoisomerase  60.67 
 
 		 339 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498417  normal  0.4902 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2103  ketol-acid reductoisomerase  60.98 
 
 		 338 aa  431  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.124469 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  60.3 
 
 		 339 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  60.3 
 
 		 339 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1127  ketol-acid reductoisomerase  57.75 
 
 		 340 aa  429  1e-119  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  62.2 
 
 		 338 aa  424  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0285  ketol-acid reductoisomerase  59.7 
 
 		 339 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.772607  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1846  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11584  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1421  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0329  ketol-acid reductoisomerase  59.7 
 
 		 339 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2891  ketol-acid reductoisomerase  60.67 
 
 		 338 aa  427  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0051674 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  57.49 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 		 331 aa  426  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1122  ketol-acid reductoisomerase  63.83 
 
 		 336 aa  426  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0870487  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1047  ketol-acid reductoisomerase  59.57 
 
 		 338 aa  424  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00873867  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1283  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3248  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 		 339 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167766  normal  0.961188 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0708  ketol-acid reductoisomerase  65.76 
 
 		 335 aa  425  1e-118  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0361  ketol-acid reductoisomerase  59.7 
 
 		 339 aa  424  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0751  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  58.36 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1276  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1490  ketol-acid reductoisomerase  63.53 
 
 		 336 aa  425  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1115  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2301  ketol-acid reductoisomerase  59.27 
 
 		 338 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0932177  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  57.49 
 
 		 338 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0398  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.422239  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0851  ketol-acid reductoisomerase  61.4 
 
 		 330 aa  424  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3892  ketol-acid reductoisomerase  63.83 
 
 		 336 aa  426  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>