More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1552 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
327 aa  671    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  80.73 
 
 
331 aa  554  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  81.04 
 
 
331 aa  540  9.999999999999999e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  80.43 
 
 
331 aa  535  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  78.53 
 
 
331 aa  531  1e-150  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  78.83 
 
 
331 aa  533  1e-150  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  78.22 
 
 
331 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  78.9 
 
 
331 aa  528  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1343  ketol-acid reductoisomerase  80.43 
 
 
331 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0991  ketol-acid reductoisomerase  82.82 
 
 
331 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1020  ketol-acid reductoisomerase  82.52 
 
 
331 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.488917 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  76.69 
 
 
331 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  75.77 
 
 
331 aa  514  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  76.38 
 
 
331 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  72.09 
 
 
329 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  71.78 
 
 
329 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  72.09 
 
 
329 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  71.78 
 
 
329 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2166  ketol-acid reductoisomerase  73.09 
 
 
329 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  66.87 
 
 
333 aa  455  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  69.42 
 
 
330 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  65.34 
 
 
338 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  67.28 
 
 
331 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1690  ketol-acid reductoisomerase  70.64 
 
 
331 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300621  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  63.5 
 
 
330 aa  451  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  65.85 
 
 
338 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  64.62 
 
 
330 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  66.36 
 
 
331 aa  444  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  65.44 
 
 
338 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  66.15 
 
 
338 aa  442  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  64.53 
 
 
330 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  69.02 
 
 
344 aa  443  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1905  ketol-acid reductoisomerase  69.72 
 
 
333 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  62.08 
 
 
330 aa  437  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  63.8 
 
 
338 aa  440  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  65.44 
 
 
338 aa  440  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  64.83 
 
 
338 aa  438  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  64 
 
 
340 aa  436  1e-121  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  62.58 
 
 
330 aa  434  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  64.94 
 
 
339 aa  437  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2142  ketol-acid reductoisomerase  64.53 
 
 
340 aa  434  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0716485  normal  0.0660754 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  64.22 
 
 
329 aa  435  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1976  ketol-acid reductoisomerase  66.36 
 
 
341 aa  435  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1902  ketol-acid reductoisomerase  66.67 
 
 
341 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1987  ketol-acid reductoisomerase  66.36 
 
 
341 aa  435  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  63.08 
 
 
340 aa  436  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  64.53 
 
 
336 aa  432  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  64.53 
 
 
336 aa  433  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1879  ketol-acid reductoisomerase  64.22 
 
 
342 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  65.64 
 
 
339 aa  432  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  64.11 
 
 
335 aa  432  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2484  ketol-acid reductoisomerase  68.81 
 
 
333 aa  432  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000401864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  63.91 
 
 
338 aa  431  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  63.91 
 
 
338 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  64 
 
 
336 aa  432  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1496  ketol-acid reductoisomerase  64.02 
 
 
339 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0558834  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1367  ketol-acid reductoisomerase  63.38 
 
 
340 aa  432  1e-120  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.845865  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  65.11 
 
 
337 aa  428  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0948  ketol-acid reductoisomerase  62.46 
 
 
340 aa  429  1e-119  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.525725  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1907  ketol-acid reductoisomerase  64.53 
 
 
339 aa  429  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.022886  hitchhiker  0.0000179587 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2501  ketol-acid reductoisomerase  62.69 
 
 
338 aa  427  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000349706  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3435  ketol-acid reductoisomerase  65.55 
 
 
331 aa  429  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00388132  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1902  ketol-acid reductoisomerase  61.47 
 
 
330 aa  429  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  63.3 
 
 
338 aa  428  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  63.61 
 
 
338 aa  428  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3020  ketol-acid reductoisomerase  64.53 
 
 
336 aa  428  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000242382  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  63 
 
 
338 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  62.15 
 
 
338 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  64.42 
 
 
339 aa  425  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  62.46 
 
 
338 aa  427  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  63.41 
 
 
339 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  66.97 
 
 
330 aa  426  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  63 
 
 
338 aa  425  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  62.15 
 
 
338 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2172  ketol-acid reductoisomerase  61.16 
 
 
330 aa  426  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1061  ketol-acid reductoisomerase  63 
 
 
338 aa  426  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  65.64 
 
 
338 aa  422  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  62.69 
 
 
338 aa  422  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2286  ketol-acid reductoisomerase  64.22 
 
 
338 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.465318 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1490  ketol-acid reductoisomerase  62.69 
 
 
339 aa  422  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0812  ketol-acid reductoisomerase  63 
 
 
338 aa  422  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1875  ketol-acid reductoisomerase  62.08 
 
 
331 aa  424  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000873272 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2518  ketol-acid reductoisomerase  63.61 
 
 
338 aa  423  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1047  ketol-acid reductoisomerase  64.22 
 
 
338 aa  421  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00873867  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  64 
 
 
338 aa  422  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2319  ketol-acid reductoisomerase  62.39 
 
 
338 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2102  ketol-acid reductoisomerase  62.5 
 
 
339 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0600  ketol-acid reductoisomerase  64.53 
 
 
336 aa  422  1e-117  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1652  ketol-acid reductoisomerase  64.22 
 
 
338 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3381  ketol-acid reductoisomerase  62.2 
 
 
339 aa  421  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6082  ketol-acid reductoisomerase  62.8 
 
 
339 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  64 
 
 
338 aa  422  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2263  ketol-acid reductoisomerase  64.22 
 
 
338 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1127  ketol-acid reductoisomerase  61.16 
 
 
340 aa  424  1e-117  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0851  ketol-acid reductoisomerase  60.55 
 
 
330 aa  423  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2775  ketol-acid reductoisomerase  61.96 
 
 
338 aa  422  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.987552  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2020  ketol-acid reductoisomerase  64.22 
 
 
338 aa  418  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1421  ketol-acid reductoisomerase  64.22 
 
 
338 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3248  ketol-acid reductoisomerase  62.2 
 
 
339 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167766  normal  0.961188 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3229  ketol-acid reductoisomerase  63.91 
 
 
338 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299676  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>