More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0155 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 		 330 aa  674    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1690  ketol-acid reductoisomerase  91.21 
 
 		 331 aa  589  1e-167  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300621  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2166  ketol-acid reductoisomerase  84.5 
 
 		 329 aa  546  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1905  ketol-acid reductoisomerase  82.37 
 
 		 333 aa  537  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  70.21 
 
 		 329 aa  499  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0410  ketol-acid reductoisomerase  72.95 
 
 		 329 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  68.29 
 
 		 331 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  69.42 
 
 		 327 aa  473  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  67.88 
 
 		 338 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  64.94 
 
 		 338 aa  466  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  67.48 
 
 		 333 aa  461  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  65.35 
 
 		 330 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  65.15 
 
 		 331 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  69.21 
 
 		 331 aa  456  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  64.24 
 
 		 330 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1968  ketol-acid reductoisomerase  68.29 
 
 		 335 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1853  ketol-acid reductoisomerase  67.99 
 
 		 335 aa  454  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1907  ketol-acid reductoisomerase  66.16 
 
 		 339 aa  455  1e-127  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.022886  hitchhiker  0.0000179587 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  64.95 
 
 		 339 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1283  ketol-acid reductoisomerase  67.78 
 
 		 336 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  69.21 
 
 		 331 aa  452  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1709  ketol-acid reductoisomerase  67.89 
 
 		 337 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1127  ketol-acid reductoisomerase  63.53 
 
 		 340 aa  453  1.0000000000000001e-126  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3489  ketol-acid reductoisomerase  67.68 
 
 		 335 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1343  ketol-acid reductoisomerase  67.48 
 
 		 331 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1519  ketol-acid reductoisomerase  67.48 
 
 		 336 aa  450  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1310  ketol-acid reductoisomerase  67.48 
 
 		 336 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1716  ketol-acid reductoisomerase  67.68 
 
 		 335 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1693  ketol-acid reductoisomerase  67.68 
 
 		 335 aa  450  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1284  ketol-acid reductoisomerase  67.48 
 
 		 336 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  63.64 
 
 		 338 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  63.94 
 
 		 330 aa  448  1e-125  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1321  ketol-acid reductoisomerase  68.09 
 
 		 336 aa  450  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1419  ketol-acid reductoisomerase  67.48 
 
 		 336 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1852  ketol-acid reductoisomerase  67.68 
 
 		 335 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  63.03 
 
 		 338 aa  450  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  65.55 
 
 		 339 aa  450  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1558  ketol-acid reductoisomerase  67.78 
 
 		 336 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  63.03 
 
 		 340 aa  448  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1890  ketol-acid reductoisomerase  67.68 
 
 		 335 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  65.85 
 
 		 338 aa  448  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3381  ketol-acid reductoisomerase  64.35 
 
 		 339 aa  449  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1936  ketol-acid reductoisomerase  67.28 
 
 		 335 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  63.33 
 
 		 340 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1668  ketol-acid reductoisomerase  67.07 
 
 		 335 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3892  ketol-acid reductoisomerase  67.17 
 
 		 336 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1490  ketol-acid reductoisomerase  66.87 
 
 		 336 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2142  ketol-acid reductoisomerase  64.65 
 
 		 340 aa  444  1.0000000000000001e-124  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0716485  normal  0.0660754 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  66.06 
 
 		 338 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1367  ketol-acid reductoisomerase  62.73 
 
 		 340 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.845865  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1452  ketol-acid reductoisomerase  67.48 
 
 		 336 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  66.57 
 
 		 344 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  63.03 
 
 		 338 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  63 
 
 		 336 aa  445  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1122  ketol-acid reductoisomerase  66.57 
 
 		 336 aa  442  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0870487  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  67.17 
 
 		 341 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  64.95 
 
 		 339 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  64.22 
 
 		 338 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  63.83 
 
 		 338 aa  442  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1962  ketol-acid reductoisomerase  64.35 
 
 		 339 aa  443  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.971323  normal  0.40215 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1496  ketol-acid reductoisomerase  63.75 
 
 		 339 aa  441  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0558834  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  66.26 
 
 		 331 aa  442  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  63.64 
 
 		 330 aa  442  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  67.48 
 
 		 341 aa  441  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  62.69 
 
 		 338 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  62.2 
 
 		 330 aa  438  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0329  ketol-acid reductoisomerase  64.05 
 
 		 339 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  63.33 
 
 		 338 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  63.64 
 
 		 339 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2778  ketol-acid reductoisomerase  64.35 
 
 		 339 aa  440  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  64.42 
 
 		 331 aa  437  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  64.63 
 
 		 339 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  62.73 
 
 		 338 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  63.03 
 
 		 330 aa  439  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0285  ketol-acid reductoisomerase  64.05 
 
 		 339 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.772607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  66.87 
 
 		 331 aa  437  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1193  ketol-acid reductoisomerase  66.26 
 
 		 334 aa  439  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0651  ketol-acid reductoisomerase  64.05 
 
 		 340 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.261788 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2484  ketol-acid reductoisomerase  67.38 
 
 		 333 aa  436  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000401864  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0361  ketol-acid reductoisomerase  63.75 
 
 		 339 aa  436  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1781  ketol-acid reductoisomerase  64.05 
 
 		 339 aa  436  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1989  ketol-acid reductoisomerase  61.16 
 
 		 338 aa  434  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1865  ketol-acid reductoisomerase  64.05 
 
 		 340 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  65.34 
 
 		 331 aa  436  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1902  ketol-acid reductoisomerase  62.12 
 
 		 330 aa  435  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  65.03 
 
 		 331 aa  436  1e-121  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1581  ketol-acid reductoisomerase  60.86 
 
 		 340 aa  437  1e-121  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0514  ketol-acid reductoisomerase  64.05 
 
 		 340 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  64.53 
 
 		 338 aa  436  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3248  ketol-acid reductoisomerase  63.03 
 
 		 339 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167766  normal  0.961188 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2121  ketol-acid reductoisomerase  61.52 
 
 		 338 aa  436  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2319  ketol-acid reductoisomerase  61.52 
 
 		 338 aa  435  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3416  ketol-acid reductoisomerase  63.14 
 
 		 339 aa  435  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  62.73 
 
 		 338 aa  434  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3020  ketol-acid reductoisomerase  63.83 
 
 		 336 aa  434  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000242382  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  64.53 
 
 		 338 aa  436  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1760  ketol-acid reductoisomerase  63.44 
 
 		 340 aa  436  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.146114  normal  0.299859 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  65.14 
 
 		 338 aa  431  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2492  ketol-acid reductoisomerase  62.24 
 
 		 339 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal  0.156046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2466  ketol-acid reductoisomerase  63.41 
 
 		 339 aa  432  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498417  normal  0.4902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>