More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0600 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0600  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
336 aa  687    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  64.53 
 
 
327 aa  443  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  63.91 
 
 
331 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  60.61 
 
 
338 aa  441  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  65.85 
 
 
344 aa  435  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  62.61 
 
 
331 aa  435  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1875  ketol-acid reductoisomerase  62.54 
 
 
331 aa  437  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000873272 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  65.76 
 
 
331 aa  434  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  60.48 
 
 
340 aa  433  1e-120  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  62.69 
 
 
331 aa  432  1e-120  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  62.69 
 
 
331 aa  431  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  59.58 
 
 
340 aa  434  1e-120  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1367  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 
340 aa  431  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.845865  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  62.08 
 
 
331 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  61.59 
 
 
331 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0867  ketol-acid reductoisomerase  58.68 
 
 
340 aa  428  1e-119  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  59.7 
 
 
338 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0948  ketol-acid reductoisomerase  58.98 
 
 
340 aa  428  1e-119  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.525725  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  63.06 
 
 
336 aa  427  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  60.3 
 
 
338 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  62.08 
 
 
331 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  61.47 
 
 
333 aa  425  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  62.76 
 
 
336 aa  426  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  58.18 
 
 
336 aa  426  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2142  ketol-acid reductoisomerase  61.19 
 
 
340 aa  424  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0716485  normal  0.0660754 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  62.92 
 
 
331 aa  423  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  61.82 
 
 
335 aa  422  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  60.73 
 
 
339 aa  423  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  61.98 
 
 
341 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  61.52 
 
 
338 aa  421  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  59.69 
 
 
329 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1581  ketol-acid reductoisomerase  57.19 
 
 
340 aa  421  1e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  63.83 
 
 
331 aa  418  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1879  ketol-acid reductoisomerase  63.83 
 
 
342 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  60.24 
 
 
329 aa  420  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0541  ketol-acid reductoisomerase  56.59 
 
 
340 aa  421  1e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 
329 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  59.52 
 
 
338 aa  419  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1907  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 
339 aa  419  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.022886  hitchhiker  0.0000179587 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  62.2 
 
 
337 aa  418  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  61.47 
 
 
331 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2319  ketol-acid reductoisomerase  57.88 
 
 
338 aa  417  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1905  ketol-acid reductoisomerase  63.53 
 
 
333 aa  419  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 
329 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  56.97 
 
 
338 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  62.12 
 
 
338 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1519  ketol-acid reductoisomerase  61.47 
 
 
336 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1310  ketol-acid reductoisomerase  61.47 
 
 
336 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1283  ketol-acid reductoisomerase  61.47 
 
 
336 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1284  ketol-acid reductoisomerase  61.47 
 
 
336 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2093  ketol-acid reductoisomerase  62.05 
 
 
334 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1419  ketol-acid reductoisomerase  61.47 
 
 
336 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1468  ketol-acid reductoisomerase  60.61 
 
 
342 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000508699  normal  0.0138391 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1558  ketol-acid reductoisomerase  61.77 
 
 
336 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0329  ketol-acid reductoisomerase  59.52 
 
 
339 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  61.03 
 
 
339 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  58.18 
 
 
338 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1472  ketol-acid reductoisomerase  58.88 
 
 
346 aa  415  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0116  ketol-acid reductoisomerase  56.68 
 
 
359 aa  416  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0285  ketol-acid reductoisomerase  59.52 
 
 
339 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.772607  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2130  ketol-acid reductoisomerase  62.05 
 
 
334 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1668  ketol-acid reductoisomerase  61.33 
 
 
334 aa  412  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1902  ketol-acid reductoisomerase  63.61 
 
 
341 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  61.26 
 
 
341 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  57.58 
 
 
338 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0361  ketol-acid reductoisomerase  59.21 
 
 
339 aa  411  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1321  ketol-acid reductoisomerase  60.86 
 
 
336 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1545  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 
340 aa  414  1e-114  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.159876  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2518  ketol-acid reductoisomerase  61.63 
 
 
338 aa  412  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  58.33 
 
 
330 aa  412  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 
339 aa  412  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  60.61 
 
 
338 aa  413  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  59.52 
 
 
339 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0504  ketol-acid reductoisomerase  56.36 
 
 
338 aa  412  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000262639  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1452  ketol-acid reductoisomerase  61.47 
 
 
336 aa  414  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  60.61 
 
 
338 aa  413  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1490  ketol-acid reductoisomerase  61.16 
 
 
336 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  61.82 
 
 
331 aa  413  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  59.63 
 
 
330 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1127  ketol-acid reductoisomerase  57.19 
 
 
340 aa  414  1e-114  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1690  ketol-acid reductoisomerase  62.8 
 
 
331 aa  411  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300621  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  58.79 
 
 
338 aa  409  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  59.09 
 
 
338 aa  410  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1490  ketol-acid reductoisomerase  60.42 
 
 
339 aa  410  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1987  ketol-acid reductoisomerase  63.3 
 
 
341 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3892  ketol-acid reductoisomerase  60.86 
 
 
336 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1337  ketol-acid reductoisomerase  61.93 
 
 
342 aa  408  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  57.14 
 
 
330 aa  410  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2166  ketol-acid reductoisomerase  62.69 
 
 
329 aa  408  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1951  ketol-acid reductoisomerase  56.06 
 
 
338 aa  409  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1976  ketol-acid reductoisomerase  63.3 
 
 
341 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2121  ketol-acid reductoisomerase  56.97 
 
 
338 aa  409  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  61.89 
 
 
330 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3381  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 
339 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2418  ketol-acid reductoisomerase  60.12 
 
 
339 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  59.08 
 
 
329 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1771  ketol-acid reductoisomerase  56.06 
 
 
338 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.09387  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0220  ketol-acid reductoisomerase  59.09 
 
 
335 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22789  normal  0.0211125 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 
330 aa  405  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2501  ketol-acid reductoisomerase  56.5 
 
 
338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000349706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>