More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1468 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1468  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 		 342 aa  696    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000508699  normal  0.0138391 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4071  ketol-acid reductoisomerase  81.29 
 
 		 342 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1337  ketol-acid reductoisomerase  77.35 
 
 		 342 aa  521  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6019  ketol-acid reductoisomerase  74.77 
 
 		 337 aa  509  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390752  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1410  ketol-acid reductoisomerase  74.71 
 
 		 342 aa  501  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2819  ketol-acid reductoisomerase  71.6 
 
 		 333 aa  499  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3390  ketol-acid reductoisomerase  74.71 
 
 		 342 aa  499  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606091  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10700  ketol-acid reductoisomerase  74.12 
 
 		 342 aa  497  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.72382 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2140  ketol-acid reductoisomerase  73.53 
 
 		 342 aa  491  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08550  ketol-acid reductoisomerase  74.05 
 
 		 343 aa  488  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0566957  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7780  ketol-acid reductoisomerase  73.31 
 
 		 331 aa  486  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.543395 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1165  ketol-acid reductoisomerase  72.94 
 
 		 342 aa  484  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal  0.0402172 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1708  ketol-acid reductoisomerase  71.72 
 
 		 345 aa  482  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.301189 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18790  ketol-acid reductoisomerase  72.43 
 
 		 343 aa  482  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1125  ketol-acid reductoisomerase  75.08 
 
 		 337 aa  483  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891733 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08890  ketol-acid reductoisomerase  76.29 
 
 		 337 aa  481  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2384  ketol-acid reductoisomerase  73.45 
 
 		 341 aa  480  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3552  ketol-acid reductoisomerase  71.17 
 
 		 330 aa  479  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.665615  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1235  ketol-acid reductoisomerase  74.16 
 
 		 337 aa  478  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.362141 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0613  ketol-acid reductoisomerase  68.69 
 
 		 331 aa  475  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398516  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3228  ketol-acid reductoisomerase  70.21 
 
 		 337 aa  474  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2537  ketol-acid reductoisomerase  72.35 
 
 		 341 aa  476  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00800327  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1092  ketol-acid reductoisomerase  72.56 
 
 		 331 aa  472  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3638  ketol-acid reductoisomerase  71.34 
 
 		 329 aa  472  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2277  ketol-acid reductoisomerase  70.88 
 
 		 341 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1908  ketol-acid reductoisomerase  71.12 
 
 		 337 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20924  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1888  ketol-acid reductoisomerase  71.12 
 
 		 337 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.0861807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8057  Ketol-acid reductoisomerase  70.03 
 
 		 329 aa  463  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1954  ketol-acid reductoisomerase  71.12 
 
 		 337 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.85036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13016  ketol-acid reductoisomerase  68.62 
 
 		 333 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00176679  normal  0.164078 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0708  ketol-acid reductoisomerase  68.2 
 
 		 355 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2124  ketol-acid reductoisomerase  70.21 
 
 		 337 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  64.11 
 
 		 331 aa  455  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4237  ketol-acid reductoisomerase  69.91 
 
 		 337 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.317024  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2862  ketol-acid reductoisomerase  70.77 
 
 		 333 aa  452  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0173  ketol-acid reductoisomerase  67.78 
 
 		 331 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  63.5 
 
 		 331 aa  449  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  62.88 
 
 		 331 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  62.88 
 
 		 331 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  62.27 
 
 		 331 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4354  ketol-acid reductoisomerase  67.17 
 
 		 336 aa  440  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00327651  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  62.08 
 
 		 329 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  60.86 
 
 		 329 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  60.86 
 
 		 329 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  60.86 
 
 		 329 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  61.04 
 
 		 331 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1902  ketol-acid reductoisomerase  65.85 
 
 		 341 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  66.16 
 
 		 337 aa  431  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1976  ketol-acid reductoisomerase  65.54 
 
 		 341 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1987  ketol-acid reductoisomerase  65.54 
 
 		 341 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1875  ketol-acid reductoisomerase  62.61 
 
 		 331 aa  428  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000873272 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  60.74 
 
 		 335 aa  427  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1879  ketol-acid reductoisomerase  64.44 
 
 		 342 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0867  ketol-acid reductoisomerase  62.61 
 
 		 340 aa  424  1e-117  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1581  ketol-acid reductoisomerase  60.61 
 
 		 340 aa  421  1e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  59.69 
 
 		 331 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  61.47 
 
 		 338 aa  419  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  57.27 
 
 		 340 aa  414  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  60.12 
 
 		 339 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  56.97 
 
 		 340 aa  414  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  58.72 
 
 		 330 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  58.9 
 
 		 333 aa  414  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  62.15 
 
 		 331 aa  411  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1367  ketol-acid reductoisomerase  57.27 
 
 		 340 aa  413  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.845865  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  60.31 
 
 		 327 aa  413  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1127  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 		 340 aa  414  1e-114  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  59.33 
 
 		 338 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0948  ketol-acid reductoisomerase  57.88 
 
 		 340 aa  410  1e-113  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.525725  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1326  ketol-acid reductoisomerase  60.37 
 
 		 350 aa  410  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08830  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 		 331 aa  410  1e-113  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.334822  normal  0.238181 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  59.02 
 
 		 329 aa  410  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  62.08 
 
 		 338 aa  408  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  59.2 
 
 		 331 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  57.49 
 
 		 330 aa  405  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  58.1 
 
 		 330 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  64.13 
 
 		 330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  58.33 
 
 		 330 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  58.1 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  58.79 
 
 		 338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  57.49 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  58.79 
 
 		 338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2093  ketol-acid reductoisomerase  60.92 
 
 		 334 aa  402  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1668  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 		 334 aa  401  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  61.09 
 
 		 336 aa  404  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  60.86 
 
 		 338 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  60.62 
 
 		 331 aa  404  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  56.84 
 
 		 339 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 		 336 aa  402  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  57.62 
 
 		 339 aa  401  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  59.33 
 
 		 338 aa  403  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0374  ketol-acid reductoisomerase  57.45 
 
 		 340 aa  402  1e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  60.86 
 
 		 338 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1472  ketol-acid reductoisomerase  57.74 
 
 		 346 aa  402  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  57.62 
 
 		 339 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3480  ketol-acid reductoisomerase  58.36 
 
 		 341 aa  403  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.161207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2130  ketol-acid reductoisomerase  60.92 
 
 		 334 aa  402  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2501  ketol-acid reductoisomerase  58.72 
 
 		 338 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000349706  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1989  ketol-acid reductoisomerase  57.58 
 
 		 338 aa  398  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2518  ketol-acid reductoisomerase  61.47 
 
 		 338 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0329  ketol-acid reductoisomerase  55.93 
 
 		 339 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>