More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1092 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1092  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 		 331 aa  672    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3638  ketol-acid reductoisomerase  92.71 
 
 		 329 aa  599  1e-170  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6019  ketol-acid reductoisomerase  76.9 
 
 		 337 aa  526  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390752  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1468  ketol-acid reductoisomerase  72.56 
 
 		 342 aa  492  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000508699  normal  0.0138391 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0613  ketol-acid reductoisomerase  72.7 
 
 		 331 aa  487  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398516  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2819  ketol-acid reductoisomerase  70.69 
 
 		 333 aa  486  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0708  ketol-acid reductoisomerase  72.56 
 
 		 355 aa  481  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1125  ketol-acid reductoisomerase  75.99 
 
 		 337 aa  478  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1235  ketol-acid reductoisomerase  75.08 
 
 		 337 aa  479  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.362141 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4071  ketol-acid reductoisomerase  69.72 
 
 		 342 aa  473  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08890  ketol-acid reductoisomerase  74.47 
 
 		 337 aa  473  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3552  ketol-acid reductoisomerase  69.51 
 
 		 330 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.665615  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8057  Ketol-acid reductoisomerase  71.34 
 
 		 329 aa  463  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0173  ketol-acid reductoisomerase  70.25 
 
 		 331 aa  457  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7780  ketol-acid reductoisomerase  69.21 
 
 		 331 aa  456  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.543395 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1337  ketol-acid reductoisomerase  68.58 
 
 		 342 aa  453  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1879  ketol-acid reductoisomerase  69.85 
 
 		 342 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2140  ketol-acid reductoisomerase  68.29 
 
 		 342 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4354  ketol-acid reductoisomerase  67.68 
 
 		 336 aa  444  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00327651  normal  0.0800927 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  66.06 
 
 		 338 aa  444  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3390  ketol-acid reductoisomerase  67.38 
 
 		 342 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606091  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1902  ketol-acid reductoisomerase  68.6 
 
 		 341 aa  441  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  63.94 
 
 		 331 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  65.56 
 
 		 331 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  64.33 
 
 		 333 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1976  ketol-acid reductoisomerase  68.29 
 
 		 341 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18790  ketol-acid reductoisomerase  67.58 
 
 		 343 aa  439  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1987  ketol-acid reductoisomerase  68.29 
 
 		 341 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1242  ketol-acid reductoisomerase  64.33 
 
 		 340 aa  436  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  62.12 
 
 		 330 aa  434  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 		 330 aa  435  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  67.81 
 
 		 337 aa  434  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1165  ketol-acid reductoisomerase  66.36 
 
 		 342 aa  431  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal  0.0402172 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1875  ketol-acid reductoisomerase  63.22 
 
 		 331 aa  433  1e-120  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000873272 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1902  ketol-acid reductoisomerase  61.4 
 
 		 330 aa  433  1e-120  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  67.58 
 
 		 330 aa  431  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  63 
 
 		 335 aa  432  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  62.54 
 
 		 331 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 		 330 aa  431  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  63.41 
 
 		 331 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  61.82 
 
 		 338 aa  432  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  63.41 
 
 		 331 aa  430  1e-119  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1410  ketol-acid reductoisomerase  65.55 
 
 		 342 aa  427  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  62.39 
 
 		 338 aa  424  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2384  ketol-acid reductoisomerase  64.95 
 
 		 341 aa  426  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  62.27 
 
 		 330 aa  426  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  62.8 
 
 		 331 aa  427  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2172  ketol-acid reductoisomerase  61.4 
 
 		 330 aa  427  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10700  ketol-acid reductoisomerase  64.94 
 
 		 342 aa  427  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.72382 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  63.22 
 
 		 338 aa  424  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3480  ketol-acid reductoisomerase  61.89 
 
 		 341 aa  426  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.161207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0851  ketol-acid reductoisomerase  61.09 
 
 		 330 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  63.22 
 
 		 338 aa  424  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0065  ketol-acid reductoisomerase  64.74 
 
 		 333 aa  424  1e-118  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000348279  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  61.35 
 
 		 330 aa  423  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  61.28 
 
 		 329 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  62.39 
 
 		 338 aa  422  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  61.28 
 
 		 329 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  61.21 
 
 		 331 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  63 
 
 		 338 aa  424  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  61.63 
 
 		 331 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  65.15 
 
 		 331 aa  424  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  61.4 
 
 		 329 aa  420  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1708  ketol-acid reductoisomerase  64.53 
 
 		 345 aa  420  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.301189 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  61.03 
 
 		 331 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  61.28 
 
 		 329 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0228  ketol-acid reductoisomerase  65.55 
 
 		 332 aa  420  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000772212  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3228  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 		 337 aa  418  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  61.28 
 
 		 329 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13016  ketol-acid reductoisomerase  62.39 
 
 		 333 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00176679  normal  0.164078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4447  ketol-acid reductoisomerase  63.72 
 
 		 337 aa  415  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  63.33 
 
 		 331 aa  416  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  62.39 
 
 		 338 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  62.8 
 
 		 336 aa  411  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08550  ketol-acid reductoisomerase  64.83 
 
 		 343 aa  411  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0566957  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  62.39 
 
 		 327 aa  411  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 		 339 aa  413  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  58.23 
 
 		 330 aa  414  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1343  ketol-acid reductoisomerase  63.03 
 
 		 331 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3563  ketol-acid reductoisomerase  61.89 
 
 		 330 aa  412  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0252536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  59.39 
 
 		 336 aa  411  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2537  ketol-acid reductoisomerase  61.93 
 
 		 341 aa  411  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00800327  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1545  ketol-acid reductoisomerase  62.12 
 
 		 340 aa  414  1e-114  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.159876  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2277  ketol-acid reductoisomerase  61.03 
 
 		 341 aa  408  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10850  ketol-acid reductoisomerase  60.67 
 
 		 330 aa  409  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  59.09 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  62.5 
 
 		 336 aa  409  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3106  ketol-acid reductoisomerase  61.59 
 
 		 345 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2767  ketol-acid reductoisomerase  58.15 
 
 		 352 aa  407  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  63.41 
 
 		 344 aa  408  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  62.12 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2559  ketol-acid reductoisomerase  59.7 
 
 		 339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  61.82 
 
 		 331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1020  ketol-acid reductoisomerase  63.41 
 
 		 331 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.488917 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2518  ketol-acid reductoisomerase  62.92 
 
 		 338 aa  404  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2862  ketol-acid reductoisomerase  62.39 
 
 		 333 aa  404  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  57.4 
 
 		 339 aa  401  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0991  ketol-acid reductoisomerase  63.41 
 
 		 331 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08830  ketol-acid reductoisomerase  58.97 
 
 		 331 aa  399  9.999999999999999e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.334822  normal  0.238181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>