More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0481 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0481  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
329 aa  681    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.495995  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1245  ketol-acid reductoisomerase  78.05 
 
 
331 aa  535  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0602  ketol-acid reductoisomerase  80.85 
 
 
330 aa  526  1e-148  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0492028 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2172  ketol-acid reductoisomerase  77.2 
 
 
329 aa  510  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0082  ketol-acid reductoisomerase  76.9 
 
 
331 aa  504  9.999999999999999e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.562426  normal  0.207631 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  65.45 
 
 
331 aa  448  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  64.85 
 
 
330 aa  450  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  64.42 
 
 
330 aa  438  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  62.01 
 
 
338 aa  424  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  61.21 
 
 
331 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10850  ketol-acid reductoisomerase  63.5 
 
 
330 aa  419  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0225  ketol-acid reductoisomerase  67.38 
 
 
330 aa  415  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.677869  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  66.87 
 
 
330 aa  416  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 
338 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  61.23 
 
 
338 aa  414  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  63.69 
 
 
344 aa  414  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 
333 aa  411  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  63.08 
 
 
341 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  62.27 
 
 
336 aa  408  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1716  ketol-acid reductoisomerase  61.3 
 
 
335 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1693  ketol-acid reductoisomerase  61.3 
 
 
335 aa  408  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  63.08 
 
 
341 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1890  ketol-acid reductoisomerase  61.3 
 
 
335 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1852  ketol-acid reductoisomerase  61.3 
 
 
335 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1709  ketol-acid reductoisomerase  60.37 
 
 
337 aa  410  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2484  ketol-acid reductoisomerase  64.85 
 
 
333 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000401864  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1853  ketol-acid reductoisomerase  61.3 
 
 
335 aa  408  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2144  ketol-acid reductoisomerase  60.6 
 
 
337 aa  409  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1968  ketol-acid reductoisomerase  61.3 
 
 
335 aa  408  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  59.57 
 
 
338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1519  ketol-acid reductoisomerase  61.85 
 
 
336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1283  ketol-acid reductoisomerase  62.15 
 
 
336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1284  ketol-acid reductoisomerase  61.85 
 
 
336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  59.57 
 
 
338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3489  ketol-acid reductoisomerase  60.99 
 
 
335 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3892  ketol-acid reductoisomerase  62.15 
 
 
336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  63.03 
 
 
331 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  61.82 
 
 
331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  61.52 
 
 
331 aa  405  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  58.23 
 
 
338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1936  ketol-acid reductoisomerase  60.68 
 
 
335 aa  403  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1558  ketol-acid reductoisomerase  61.54 
 
 
336 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1490  ketol-acid reductoisomerase  61.54 
 
 
336 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1310  ketol-acid reductoisomerase  61.54 
 
 
336 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1668  ketol-acid reductoisomerase  60.99 
 
 
335 aa  403  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  61.52 
 
 
331 aa  403  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1419  ketol-acid reductoisomerase  61.54 
 
 
336 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  61.35 
 
 
336 aa  402  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1452  ketol-acid reductoisomerase  61.54 
 
 
336 aa  402  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1321  ketol-acid reductoisomerase  61.85 
 
 
336 aa  402  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0831  ketol-acid reductoisomerase  61.04 
 
 
332 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.357029  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0233  ketol-acid reductoisomerase  61.92 
 
 
330 aa  398  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  58.9 
 
 
327 aa  398  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0922  ketol-acid reductoisomerase  61.61 
 
 
330 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1538  ketol-acid reductoisomerase  60.68 
 
 
330 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1680  ketol-acid reductoisomerase  61.92 
 
 
330 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1189  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 
332 aa  396  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1343  ketol-acid reductoisomerase  60.3 
 
 
331 aa  394  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2142  ketol-acid reductoisomerase  59.51 
 
 
340 aa  397  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0716485  normal  0.0660754 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0750  ketol-acid reductoisomerase  60.43 
 
 
332 aa  396  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0354  ketol-acid reductoisomerase  64.02 
 
 
341 aa  396  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0112  ketol-acid reductoisomerase  62.58 
 
 
332 aa  397  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_735  ketol-acid reductoisomerase  60.12 
 
 
332 aa  395  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.122769  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  57.45 
 
 
331 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0065  ketol-acid reductoisomerase  62.42 
 
 
333 aa  392  1e-108  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000348279  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1122  ketol-acid reductoisomerase  59.69 
 
 
336 aa  392  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0870487  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  56.84 
 
 
329 aa  392  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2518  ketol-acid reductoisomerase  56.53 
 
 
338 aa  391  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1907  ketol-acid reductoisomerase  57.98 
 
 
339 aa  394  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.022886  hitchhiker  0.0000179587 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0228  ketol-acid reductoisomerase  62.73 
 
 
332 aa  392  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000772212  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  57.23 
 
 
336 aa  391  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1879  ketol-acid reductoisomerase  58.28 
 
 
342 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0220  ketol-acid reductoisomerase  61.82 
 
 
335 aa  390  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22789  normal  0.0211125 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  57.1 
 
 
338 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6019  ketol-acid reductoisomerase  59.19 
 
 
337 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390752  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  57.1 
 
 
338 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3563  ketol-acid reductoisomerase  57.63 
 
 
330 aa  389  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0252536  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  55.32 
 
 
338 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1175  ketol-acid reductoisomerase  59.75 
 
 
329 aa  387  1e-106  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.273491  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  55.32 
 
 
338 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  55.93 
 
 
338 aa  387  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1193  ketol-acid reductoisomerase  59.75 
 
 
334 aa  387  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1020  ketol-acid reductoisomerase  61.09 
 
 
331 aa  384  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.488917 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  55.93 
 
 
338 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  56.23 
 
 
329 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  55.93 
 
 
329 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1902  ketol-acid reductoisomerase  58.48 
 
 
341 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  55.62 
 
 
338 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  56.53 
 
 
331 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  55.32 
 
 
338 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0991  ketol-acid reductoisomerase  61.09 
 
 
331 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  55.32 
 
 
331 aa  383  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  55.02 
 
 
331 aa  382  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  55.52 
 
 
339 aa  383  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  55.76 
 
 
339 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  55.93 
 
 
329 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1976  ketol-acid reductoisomerase  58.48 
 
 
341 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  55.62 
 
 
329 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1987  ketol-acid reductoisomerase  58.48 
 
 
341 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1581  ketol-acid reductoisomerase  55.59 
 
 
340 aa  382  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>