More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0602 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0602  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
330 aa  679    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0492028 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1245  ketol-acid reductoisomerase  81.1 
 
 
331 aa  553  1e-156  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0481  ketol-acid reductoisomerase  80.85 
 
 
329 aa  527  1e-148  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.495995  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0082  ketol-acid reductoisomerase  77.88 
 
 
331 aa  522  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.562426  normal  0.207631 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2172  ketol-acid reductoisomerase  78.12 
 
 
329 aa  523  1e-147  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  65.64 
 
 
330 aa  451  1.0000000000000001e-126  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  62.73 
 
 
330 aa  444  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10850  ketol-acid reductoisomerase  65.34 
 
 
330 aa  432  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  62.73 
 
 
331 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  62.42 
 
 
331 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2484  ketol-acid reductoisomerase  66.67 
 
 
333 aa  426  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000401864  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  64.13 
 
 
341 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  66.87 
 
 
330 aa  424  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  64.02 
 
 
341 aa  425  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2144  ketol-acid reductoisomerase  62.2 
 
 
337 aa  423  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128688  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  64.94 
 
 
344 aa  419  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  61.52 
 
 
338 aa  419  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  60.61 
 
 
338 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  63.94 
 
 
331 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1709  ketol-acid reductoisomerase  60.37 
 
 
337 aa  414  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  60.49 
 
 
329 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1853  ketol-acid reductoisomerase  61.3 
 
 
335 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0225  ketol-acid reductoisomerase  66.46 
 
 
330 aa  416  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.677869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1716  ketol-acid reductoisomerase  61.3 
 
 
335 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  63.33 
 
 
331 aa  413  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1968  ketol-acid reductoisomerase  61.3 
 
 
335 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1852  ketol-acid reductoisomerase  61.3 
 
 
335 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3489  ketol-acid reductoisomerase  61.3 
 
 
335 aa  413  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1890  ketol-acid reductoisomerase  61.3 
 
 
335 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  59.69 
 
 
338 aa  409  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1936  ketol-acid reductoisomerase  60.68 
 
 
335 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1693  ketol-acid reductoisomerase  60.99 
 
 
335 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1668  ketol-acid reductoisomerase  60.99 
 
 
335 aa  408  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  59.88 
 
 
338 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  62.73 
 
 
331 aa  408  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  58.79 
 
 
338 aa  407  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  62.42 
 
 
331 aa  410  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  58.48 
 
 
338 aa  409  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 
333 aa  410  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0831  ketol-acid reductoisomerase  61.77 
 
 
332 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.357029  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0228  ketol-acid reductoisomerase  63.55 
 
 
332 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000772212  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0354  ketol-acid reductoisomerase  64.33 
 
 
341 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  58.79 
 
 
336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3480  ketol-acid reductoisomerase  59.94 
 
 
341 aa  401  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.161207  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0750  ketol-acid reductoisomerase  61.16 
 
 
332 aa  404  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1193  ketol-acid reductoisomerase  62.31 
 
 
334 aa  402  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  59.2 
 
 
327 aa  404  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1343  ketol-acid reductoisomerase  61.03 
 
 
331 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  61.35 
 
 
336 aa  402  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  61.66 
 
 
336 aa  403  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_735  ketol-acid reductoisomerase  60.55 
 
 
332 aa  402  1e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.122769  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1189  ketol-acid reductoisomerase  61.7 
 
 
332 aa  404  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2142  ketol-acid reductoisomerase  58.97 
 
 
340 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0716485  normal  0.0660754 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0991  ketol-acid reductoisomerase  63.53 
 
 
331 aa  397  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1020  ketol-acid reductoisomerase  63.53 
 
 
331 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.488917 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1907  ketol-acid reductoisomerase  58.66 
 
 
339 aa  399  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.022886  hitchhiker  0.0000179587 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1519  ketol-acid reductoisomerase  60.92 
 
 
336 aa  396  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1283  ketol-acid reductoisomerase  60.92 
 
 
336 aa  395  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1284  ketol-acid reductoisomerase  60.92 
 
 
336 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1680  ketol-acid reductoisomerase  61.61 
 
 
330 aa  397  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  56.97 
 
 
338 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3892  ketol-acid reductoisomerase  60.92 
 
 
336 aa  394  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1538  ketol-acid reductoisomerase  60.99 
 
 
330 aa  396  1e-109  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0922  ketol-acid reductoisomerase  60.99 
 
 
330 aa  395  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0065  ketol-acid reductoisomerase  62.35 
 
 
333 aa  397  1e-109  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000348279  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1321  ketol-acid reductoisomerase  60.92 
 
 
336 aa  393  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3563  ketol-acid reductoisomerase  59.19 
 
 
330 aa  393  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0252536  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  60.3 
 
 
330 aa  391  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1310  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 
336 aa  391  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0220  ketol-acid reductoisomerase  60.91 
 
 
335 aa  392  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22789  normal  0.0211125 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2518  ketol-acid reductoisomerase  57.7 
 
 
338 aa  393  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  57.45 
 
 
329 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1419  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 
336 aa  391  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  57.45 
 
 
329 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  57.27 
 
 
338 aa  393  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3435  ketol-acid reductoisomerase  61.33 
 
 
331 aa  394  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00388132  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0233  ketol-acid reductoisomerase  61.3 
 
 
330 aa  394  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1558  ketol-acid reductoisomerase  60.62 
 
 
336 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1452  ketol-acid reductoisomerase  60.31 
 
 
336 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  56.84 
 
 
331 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1905  ketol-acid reductoisomerase  60.91 
 
 
333 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1490  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 
336 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  56.23 
 
 
331 aa  389  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  56.23 
 
 
331 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2166  ketol-acid reductoisomerase  61.4 
 
 
329 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  56.84 
 
 
329 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1122  ketol-acid reductoisomerase  58.84 
 
 
336 aa  389  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0870487  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  58.33 
 
 
338 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0019  hypothetical protein  56.48 
 
 
346 aa  389  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2984  ketol-acid reductoisomerase  58.77 
 
 
333 aa  388  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0372563  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3026  ketol-acid reductoisomerase  58.77 
 
 
333 aa  388  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  58.33 
 
 
338 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  57.14 
 
 
329 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2272  ketol-acid reductoisomerase  58.48 
 
 
338 aa  386  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  56.8 
 
 
331 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  55.76 
 
 
338 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1242  ketol-acid reductoisomerase  57.8 
 
 
340 aa  385  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1690  ketol-acid reductoisomerase  61.21 
 
 
331 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300621  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  57.1 
 
 
331 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  54.85 
 
 
338 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>