More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1608 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1608  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
335 aa  687    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000345501  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  58.97 
 
 
330 aa  439  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  60.61 
 
 
333 aa  432  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10850  ketol-acid reductoisomerase  61.09 
 
 
330 aa  427  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 
338 aa  421  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  59.27 
 
 
330 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  60.43 
 
 
338 aa  422  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2144  ketol-acid reductoisomerase  60.78 
 
 
337 aa  421  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128688  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  61.86 
 
 
344 aa  420  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  59.51 
 
 
338 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  59.51 
 
 
338 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  59.04 
 
 
336 aa  418  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2319  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 
338 aa  417  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  59.34 
 
 
336 aa  418  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  60.12 
 
 
338 aa  421  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  59.2 
 
 
338 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  60.24 
 
 
341 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3563  ketol-acid reductoisomerase  58.77 
 
 
330 aa  414  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0252536  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  55.89 
 
 
331 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  58.9 
 
 
338 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  60.18 
 
 
331 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42500  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 
338 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  59.4 
 
 
341 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  58.1 
 
 
338 aa  413  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3020  ketol-acid reductoisomerase  59.52 
 
 
336 aa  413  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000242382  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3110  ketol-acid reductoisomerase  59.51 
 
 
338 aa  412  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090046  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  57.36 
 
 
338 aa  411  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  60.12 
 
 
336 aa  413  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  56.19 
 
 
335 aa  410  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0812  ketol-acid reductoisomerase  59.2 
 
 
338 aa  410  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  57.67 
 
 
338 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4447  ketol-acid reductoisomerase  61.63 
 
 
337 aa  410  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1122  ketol-acid reductoisomerase  60.73 
 
 
336 aa  409  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0870487  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  59.51 
 
 
338 aa  409  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1747  ketol-acid reductoisomerase  59.2 
 
 
347 aa  408  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.322981 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1061  ketol-acid reductoisomerase  58.59 
 
 
338 aa  409  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1115  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 
338 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  58.28 
 
 
338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2484  ketol-acid reductoisomerase  60.79 
 
 
333 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000401864  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1846  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 
338 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11584  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  58.36 
 
 
331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  56.53 
 
 
329 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  57.98 
 
 
338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0065  ketol-acid reductoisomerase  60.12 
 
 
333 aa  407  1.0000000000000001e-112  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000348279  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1421  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 
338 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1283  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 
338 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  58.9 
 
 
327 aa  406  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  56.44 
 
 
338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1276  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 
338 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1951  ketol-acid reductoisomerase  58.9 
 
 
338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  58.36 
 
 
331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0398  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 
338 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.422239  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  57.98 
 
 
338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  56.84 
 
 
329 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1771  ketol-acid reductoisomerase  58.9 
 
 
338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.09387  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  57.49 
 
 
338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0751  ketol-acid reductoisomerase  59.82 
 
 
338 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1330  ketol-acid reductoisomerase  58.59 
 
 
338 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1989  ketol-acid reductoisomerase  57.98 
 
 
338 aa  402  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5590  ketol-acid reductoisomerase  58.59 
 
 
338 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  57.45 
 
 
331 aa  401  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  56.23 
 
 
329 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  57.8 
 
 
338 aa  402  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1047  ketol-acid reductoisomerase  59.51 
 
 
338 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00873867  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3324  ketol-acid reductoisomerase  59.63 
 
 
338 aa  402  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  57.49 
 
 
338 aa  401  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3229  ketol-acid reductoisomerase  58.59 
 
 
338 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299676  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2020  ketol-acid reductoisomerase  59.51 
 
 
338 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0524  ketol-acid reductoisomerase  57.36 
 
 
338 aa  401  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.181387  normal  0.0101595 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1652  ketol-acid reductoisomerase  58.9 
 
 
338 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2103  ketol-acid reductoisomerase  58.72 
 
 
338 aa  402  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.124469 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2263  ketol-acid reductoisomerase  58.9 
 
 
338 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  57.75 
 
 
331 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2286  ketol-acid reductoisomerase  58.9 
 
 
338 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.465318 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  54.88 
 
 
340 aa  402  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  55.93 
 
 
331 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2775  ketol-acid reductoisomerase  56.36 
 
 
338 aa  400  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.987552  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  54.88 
 
 
340 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1310  ketol-acid reductoisomerase  59.21 
 
 
336 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2179  ketol-acid reductoisomerase  58.59 
 
 
338 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956116  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0529  ketol-acid reductoisomerase  57.36 
 
 
338 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2891  ketol-acid reductoisomerase  58.41 
 
 
338 aa  399  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0051674 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1015  ketol-acid reductoisomerase  58.59 
 
 
338 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801365  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1419  ketol-acid reductoisomerase  59.21 
 
 
336 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0228  ketol-acid reductoisomerase  59.45 
 
 
332 aa  398  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000772212  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  58.72 
 
 
339 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1780  ketol-acid reductoisomerase  56.88 
 
 
338 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2121  ketol-acid reductoisomerase  57.06 
 
 
338 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4865  ketol-acid reductoisomerase  58.59 
 
 
338 aa  401  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  56.23 
 
 
329 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1690  ketol-acid reductoisomerase  59.57 
 
 
331 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300621  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2301  ketol-acid reductoisomerase  58.59 
 
 
338 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0932177  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1367  ketol-acid reductoisomerase  54.57 
 
 
340 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.845865  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2501  ketol-acid reductoisomerase  58.9 
 
 
338 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000349706  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  58.05 
 
 
330 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1321  ketol-acid reductoisomerase  58.61 
 
 
336 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  55.59 
 
 
339 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1283  ketol-acid reductoisomerase  59.21 
 
 
336 aa  397  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0750  ketol-acid reductoisomerase  58.91 
 
 
332 aa  395  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3892  ketol-acid reductoisomerase  59.21 
 
 
336 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>