More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1927 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1927  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
335 aa  681    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1641  ketol-acid reductoisomerase  71.04 
 
 
335 aa  510  1e-143  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.75245  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1722  ketol-acid reductoisomerase  62.15 
 
 
328 aa  394  1e-108  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.801354  normal  0.0124349 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1541  ketol-acid reductoisomerase  60.62 
 
 
327 aa  390  1e-107  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0552  ketol-acid reductoisomerase  59.69 
 
 
331 aa  381  1e-105  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00831363 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1755  ketol-acid reductoisomerase  60.31 
 
 
328 aa  376  1e-103  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000701523 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1168  ketol-acid reductoisomerase  57.45 
 
 
328 aa  360  2e-98  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.528024  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1175  ketol-acid reductoisomerase  52.63 
 
 
329 aa  347  1e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.273491  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1189  ketol-acid reductoisomerase  53.17 
 
 
332 aa  346  3e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  50.91 
 
 
333 aa  343  2e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  55.38 
 
 
331 aa  343  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0116  ketol-acid reductoisomerase  50.93 
 
 
359 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  51.69 
 
 
330 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  50.77 
 
 
330 aa  340  2e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2142  ketol-acid reductoisomerase  54.01 
 
 
340 aa  338  5.9999999999999996e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0716485  normal  0.0660754 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  49.24 
 
 
335 aa  338  8e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  51.54 
 
 
338 aa  337  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  50.15 
 
 
331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1907  ketol-acid reductoisomerase  53.09 
 
 
339 aa  335  9e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.022886  hitchhiker  0.0000179587 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1581  ketol-acid reductoisomerase  48.3 
 
 
340 aa  332  6e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  50.78 
 
 
330 aa  332  8e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2819  ketol-acid reductoisomerase  51.08 
 
 
333 aa  329  4e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  50.76 
 
 
338 aa  328  6e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10850  ketol-acid reductoisomerase  52.17 
 
 
330 aa  328  6e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  51.67 
 
 
338 aa  328  8e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1951  ketol-acid reductoisomerase  51.16 
 
 
338 aa  328  9e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1771  ketol-acid reductoisomerase  51.16 
 
 
338 aa  328  9e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.09387  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  52.62 
 
 
336 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0613  ketol-acid reductoisomerase  51.23 
 
 
331 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398516  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  48.61 
 
 
338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2775  ketol-acid reductoisomerase  50.83 
 
 
338 aa  326  3e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.987552  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  49.54 
 
 
329 aa  326  3e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  52.62 
 
 
336 aa  327  3e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  51.5 
 
 
338 aa  326  3e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  48.3 
 
 
338 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  51.33 
 
 
338 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0812  ketol-acid reductoisomerase  51.33 
 
 
338 aa  325  6e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  48.92 
 
 
338 aa  325  7e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  49.23 
 
 
338 aa  325  8.000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1283  ketol-acid reductoisomerase  51.06 
 
 
336 aa  324  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1558  ketol-acid reductoisomerase  51.06 
 
 
336 aa  324  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1242  ketol-acid reductoisomerase  49.55 
 
 
340 aa  324  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3480  ketol-acid reductoisomerase  49.38 
 
 
341 aa  325  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.161207  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3552  ketol-acid reductoisomerase  50.46 
 
 
330 aa  324  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.665615  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0873  ketol-acid reductoisomerase  50.62 
 
 
351 aa  324  1e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  48.61 
 
 
338 aa  324  1e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1519  ketol-acid reductoisomerase  50.76 
 
 
336 aa  323  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1284  ketol-acid reductoisomerase  50.76 
 
 
336 aa  323  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0851  ketol-acid reductoisomerase  49.85 
 
 
330 aa  323  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3073  ketol-acid reductoisomerase  51.5 
 
 
338 aa  323  3e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0071293 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1545  ketol-acid reductoisomerase  48.92 
 
 
340 aa  323  3e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.159876  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0374  ketol-acid reductoisomerase  48.76 
 
 
340 aa  323  3e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  51.85 
 
 
344 aa  323  3e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1747  ketol-acid reductoisomerase  48.61 
 
 
347 aa  323  3e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.322981 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  49.07 
 
 
338 aa  323  4e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1490  ketol-acid reductoisomerase  50.76 
 
 
336 aa  323  4e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1321  ketol-acid reductoisomerase  50.45 
 
 
336 aa  322  4e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1608  ketol-acid reductoisomerase  52.41 
 
 
335 aa  323  4e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000345501  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  48.61 
 
 
338 aa  322  5e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3892  ketol-acid reductoisomerase  50.15 
 
 
336 aa  322  5e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1452  ketol-acid reductoisomerase  50.45 
 
 
336 aa  322  6e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  49.54 
 
 
330 aa  322  8e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3110  ketol-acid reductoisomerase  50.83 
 
 
338 aa  321  9.000000000000001e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090046  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1310  ketol-acid reductoisomerase  50.76 
 
 
336 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  50.5 
 
 
338 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  50.94 
 
 
330 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1419  ketol-acid reductoisomerase  50.76 
 
 
336 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0541  ketol-acid reductoisomerase  47.2 
 
 
340 aa  321  9.999999999999999e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  49.23 
 
 
338 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  47.69 
 
 
331 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0922  ketol-acid reductoisomerase  48.77 
 
 
330 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  48.92 
 
 
330 aa  321  9.999999999999999e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1061  ketol-acid reductoisomerase  50.67 
 
 
338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1680  ketol-acid reductoisomerase  48.77 
 
 
330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1902  ketol-acid reductoisomerase  50.46 
 
 
330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1538  ketol-acid reductoisomerase  48.77 
 
 
330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  48.61 
 
 
338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2144  ketol-acid reductoisomerase  50.76 
 
 
337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128688  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  51.42 
 
 
337 aa  320  3e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  49.69 
 
 
336 aa  319  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  51.08 
 
 
341 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  50.77 
 
 
341 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0233  ketol-acid reductoisomerase  48.46 
 
 
330 aa  317  1e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  51.67 
 
 
338 aa  317  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  49.53 
 
 
330 aa  317  2e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  51.67 
 
 
338 aa  317  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2319  ketol-acid reductoisomerase  50.67 
 
 
338 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0529  ketol-acid reductoisomerase  46.88 
 
 
338 aa  316  3e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  50.15 
 
 
331 aa  317  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1122  ketol-acid reductoisomerase  49.85 
 
 
336 aa  316  4e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0870487  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0524  ketol-acid reductoisomerase  46.88 
 
 
338 aa  316  4e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.181387  normal  0.0101595 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4865  ketol-acid reductoisomerase  49.83 
 
 
338 aa  316  5e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2166  ketol-acid reductoisomerase  49.85 
 
 
329 aa  315  6e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0948  ketol-acid reductoisomerase  46.58 
 
 
340 aa  315  7e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.525725  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4071  ketol-acid reductoisomerase  48.77 
 
 
342 aa  315  8e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2767  ketol-acid reductoisomerase  49.23 
 
 
352 aa  315  8e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1966  ketol-acid reductoisomerase  51.36 
 
 
340 aa  315  9e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2518  ketol-acid reductoisomerase  50.46 
 
 
338 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1245  ketol-acid reductoisomerase  48.74 
 
 
331 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2984  ketol-acid reductoisomerase  52.01 
 
 
333 aa  314  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0372563  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>