More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1755 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1755  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 		 328 aa  657    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000701523 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1541  ketol-acid reductoisomerase  84.4 
 
 		 327 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0552  ketol-acid reductoisomerase  84.71 
 
 		 331 aa  534  1e-151  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00831363 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1722  ketol-acid reductoisomerase  82.57 
 
 		 328 aa  529  1e-149  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.801354  normal  0.0124349 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1168  ketol-acid reductoisomerase  67.08 
 
 		 328 aa  426  1e-118  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.528024  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1641  ketol-acid reductoisomerase  60.8 
 
 		 335 aa  401  9.999999999999999e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.75245  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  55.08 
 
 		 333 aa  381  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1927  ketol-acid reductoisomerase  60.31 
 
 		 335 aa  374  1e-102  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  54.77 
 
 		 330 aa  371  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1189  ketol-acid reductoisomerase  57.23 
 
 		 332 aa  363  2e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  53.54 
 
 		 331 aa  362  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  54.46 
 
 		 335 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  53.54 
 
 		 331 aa  359  3e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  52.96 
 
 		 330 aa  356  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  52.31 
 
 		 329 aa  356  2.9999999999999997e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  53.56 
 
 		 338 aa  356  2.9999999999999997e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  52.62 
 
 		 329 aa  356  2.9999999999999997e-97  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  55.38 
 
 		 341 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0873  ketol-acid reductoisomerase  52.47 
 
 		 351 aa  353  2e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10850  ketol-acid reductoisomerase  55.08 
 
 		 330 aa  353  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  52.62 
 
 		 331 aa  353  2e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  52.31 
 
 		 331 aa  352  2.9999999999999997e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  52.31 
 
 		 331 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  52.31 
 
 		 329 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  56.31 
 
 		 331 aa  352  2.9999999999999997e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  52.31 
 
 		 331 aa  352  4e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  52.31 
 
 		 329 aa  352  4e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  52.31 
 
 		 330 aa  352  4e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1968  ketol-acid reductoisomerase  55.42 
 
 		 335 aa  352  4e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1545  ketol-acid reductoisomerase  53.54 
 
 		 340 aa  352  5e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.159876  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3480  ketol-acid reductoisomerase  52.16 
 
 		 341 aa  352  5.9999999999999994e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.161207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1709  ketol-acid reductoisomerase  55.42 
 
 		 337 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1936  ketol-acid reductoisomerase  55.42 
 
 		 335 aa  351  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0116  ketol-acid reductoisomerase  53.42 
 
 		 359 aa  351  1e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  53.25 
 
 		 329 aa  350  2e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2142  ketol-acid reductoisomerase  54.94 
 
 		 340 aa  350  2e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0716485  normal  0.0660754 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1853  ketol-acid reductoisomerase  54.8 
 
 		 335 aa  350  3e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  55.38 
 
 		 341 aa  349  3e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0228  ketol-acid reductoisomerase  57.54 
 
 		 332 aa  349  4e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000772212  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  52.63 
 
 		 330 aa  348  5e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1716  ketol-acid reductoisomerase  54.8 
 
 		 335 aa  347  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1693  ketol-acid reductoisomerase  54.8 
 
 		 335 aa  347  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1668  ketol-acid reductoisomerase  54.49 
 
 		 335 aa  348  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1852  ketol-acid reductoisomerase  54.8 
 
 		 335 aa  347  1e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  51.69 
 
 		 331 aa  348  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1890  ketol-acid reductoisomerase  54.8 
 
 		 335 aa  347  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3489  ketol-acid reductoisomerase  54.49 
 
 		 335 aa  348  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1907  ketol-acid reductoisomerase  54.63 
 
 		 339 aa  347  2e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.022886  hitchhiker  0.0000179587 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0851  ketol-acid reductoisomerase  52.01 
 
 		 330 aa  347  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0112  ketol-acid reductoisomerase  56.31 
 
 		 332 aa  346  4e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  54.77 
 
 		 336 aa  345  5e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6019  ketol-acid reductoisomerase  54.49 
 
 		 337 aa  345  6e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390752  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2819  ketol-acid reductoisomerase  54.15 
 
 		 333 aa  344  8.999999999999999e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  54.57 
 
 		 337 aa  344  8.999999999999999e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  54.46 
 
 		 336 aa  344  1e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0220  ketol-acid reductoisomerase  56.21 
 
 		 335 aa  344  1e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22789  normal  0.0211125 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1245  ketol-acid reductoisomerase  54.15 
 
 		 331 aa  344  1e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0959  ketol-acid reductoisomerase  51.07 
 
 		 332 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00572985 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1242  ketol-acid reductoisomerase  52.31 
 
 		 340 aa  342  5.999999999999999e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  51.38 
 
 		 331 aa  342  8e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3552  ketol-acid reductoisomerase  54.77 
 
 		 330 aa  341  8e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.665615  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  52.63 
 
 		 338 aa  340  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2767  ketol-acid reductoisomerase  51.08 
 
 		 352 aa  340  2e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2775  ketol-acid reductoisomerase  50.46 
 
 		 338 aa  340  2e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.987552  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  56.31 
 
 		 344 aa  340  2e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  51.39 
 
 		 338 aa  339  2.9999999999999998e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  52.17 
 
 		 327 aa  339  4e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0225  ketol-acid reductoisomerase  56.35 
 
 		 330 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.677869  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  51.7 
 
 		 336 aa  338  5.9999999999999996e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  54.15 
 
 		 331 aa  338  7e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0613  ketol-acid reductoisomerase  53.4 
 
 		 331 aa  338  8e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398516  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0922  ketol-acid reductoisomerase  51.7 
 
 		 330 aa  338  8e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1962  ketol-acid reductoisomerase  51.23 
 
 		 339 aa  337  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.971323  normal  0.40215 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1538  ketol-acid reductoisomerase  51.08 
 
 		 330 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  51.08 
 
 		 338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0233  ketol-acid reductoisomerase  51.7 
 
 		 330 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  51.39 
 
 		 338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1680  ketol-acid reductoisomerase  51.7 
 
 		 330 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1061  ketol-acid reductoisomerase  51.08 
 
 		 338 aa  336  2.9999999999999997e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2492  ketol-acid reductoisomerase  50.62 
 
 		 339 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal  0.156046 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4071  ketol-acid reductoisomerase  53.4 
 
 		 342 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1283  ketol-acid reductoisomerase  52.92 
 
 		 336 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  52.01 
 
 		 330 aa  335  5e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  50.46 
 
 		 338 aa  335  5e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1321  ketol-acid reductoisomerase  52.92 
 
 		 336 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1558  ketol-acid reductoisomerase  52.62 
 
 		 336 aa  335  7e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4865  ketol-acid reductoisomerase  49.54 
 
 		 338 aa  335  7.999999999999999e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  52.02 
 
 		 330 aa  335  7.999999999999999e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2172  ketol-acid reductoisomerase  56.31 
 
 		 329 aa  335  9e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1310  ketol-acid reductoisomerase  52.92 
 
 		 336 aa  334  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3073  ketol-acid reductoisomerase  50.15 
 
 		 338 aa  334  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071293 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1419  ketol-acid reductoisomerase  52.92 
 
 		 336 aa  334  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1122  ketol-acid reductoisomerase  52.62 
 
 		 336 aa  334  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0870487  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  55.69 
 
 		 330 aa  334  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2749  ketol-acid reductoisomerase  50.93 
 
 		 339 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2778  ketol-acid reductoisomerase  50.62 
 
 		 339 aa  333  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  50.15 
 
 		 338 aa  333  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  50.77 
 
 		 338 aa  333  2e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  50.46 
 
 		 338 aa  333  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1468  ketol-acid reductoisomerase  51.08 
 
 		 342 aa  333  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000508699  normal  0.0138391 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>