More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1641 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1641  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
335 aa  684    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.75245  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1927  ketol-acid reductoisomerase  71.04 
 
 
335 aa  489  1e-137  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1755  ketol-acid reductoisomerase  60.8 
 
 
328 aa  382  1e-105  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000701523 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1541  ketol-acid reductoisomerase  59.57 
 
 
327 aa  380  1e-104  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0552  ketol-acid reductoisomerase  60.19 
 
 
331 aa  379  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00831363 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1722  ketol-acid reductoisomerase  60.19 
 
 
328 aa  380  1e-104  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.801354  normal  0.0124349 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1168  ketol-acid reductoisomerase  55.18 
 
 
328 aa  358  8e-98  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.528024  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  54.71 
 
 
333 aa  358  8e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  51.7 
 
 
329 aa  347  2e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  53.73 
 
 
330 aa  347  2e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0873  ketol-acid reductoisomerase  50.93 
 
 
351 aa  345  7e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  50.3 
 
 
335 aa  343  2e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1175  ketol-acid reductoisomerase  51.85 
 
 
329 aa  340  1e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.273491  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0613  ketol-acid reductoisomerase  51.38 
 
 
331 aa  339  4e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398516  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  50.46 
 
 
330 aa  338  7e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10850  ketol-acid reductoisomerase  53.73 
 
 
330 aa  337  9.999999999999999e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  55.08 
 
 
331 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2142  ketol-acid reductoisomerase  53.09 
 
 
340 aa  333  2e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0716485  normal  0.0660754 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  52.01 
 
 
330 aa  333  2e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3480  ketol-acid reductoisomerase  51.23 
 
 
341 aa  332  4e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.161207  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2166  ketol-acid reductoisomerase  52.32 
 
 
329 aa  332  4e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  51.84 
 
 
338 aa  332  6e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  51.71 
 
 
330 aa  331  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1189  ketol-acid reductoisomerase  52.12 
 
 
332 aa  330  2e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1907  ketol-acid reductoisomerase  50.93 
 
 
339 aa  330  3e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.022886  hitchhiker  0.0000179587 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1709  ketol-acid reductoisomerase  52.01 
 
 
337 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0903  ketol-acid reductoisomerase  49.54 
 
 
351 aa  329  5.0000000000000004e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1538  ketol-acid reductoisomerase  49.69 
 
 
330 aa  328  8e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1968  ketol-acid reductoisomerase  51.7 
 
 
335 aa  328  8e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1853  ketol-acid reductoisomerase  51.7 
 
 
335 aa  328  8e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1936  ketol-acid reductoisomerase  51.7 
 
 
335 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2775  ketol-acid reductoisomerase  49.39 
 
 
338 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.987552  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1608  ketol-acid reductoisomerase  51.96 
 
 
335 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000345501  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1242  ketol-acid reductoisomerase  50.3 
 
 
340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  49.85 
 
 
338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0116  ketol-acid reductoisomerase  49.23 
 
 
359 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  52.31 
 
 
341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1951  ketol-acid reductoisomerase  49.23 
 
 
338 aa  326  3e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1668  ketol-acid reductoisomerase  51.39 
 
 
335 aa  326  3e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1771  ketol-acid reductoisomerase  49.23 
 
 
338 aa  326  3e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.09387  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3110  ketol-acid reductoisomerase  49.54 
 
 
338 aa  327  3e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090046  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1716  ketol-acid reductoisomerase  51.39 
 
 
335 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1693  ketol-acid reductoisomerase  51.39 
 
 
335 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1852  ketol-acid reductoisomerase  51.39 
 
 
335 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  50.31 
 
 
331 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1890  ketol-acid reductoisomerase  51.39 
 
 
335 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2767  ketol-acid reductoisomerase  49.07 
 
 
352 aa  326  4.0000000000000003e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  54.04 
 
 
336 aa  325  5e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  51.38 
 
 
338 aa  325  5e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  49.85 
 
 
338 aa  325  5e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1545  ketol-acid reductoisomerase  50 
 
 
340 aa  325  6e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.159876  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  54.04 
 
 
336 aa  325  6e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2984  ketol-acid reductoisomerase  52.94 
 
 
333 aa  325  7e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0372563  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3026  ketol-acid reductoisomerase  52.94 
 
 
333 aa  325  7e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.219596 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  50.46 
 
 
330 aa  325  9e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  48.92 
 
 
338 aa  324  1e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1690  ketol-acid reductoisomerase  51.7 
 
 
331 aa  324  1e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300621  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0410  ketol-acid reductoisomerase  51.08 
 
 
329 aa  323  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  50.93 
 
 
330 aa  324  2e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4071  ketol-acid reductoisomerase  51.08 
 
 
342 aa  323  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2144  ketol-acid reductoisomerase  51.67 
 
 
337 aa  324  2e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.128688  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  52.15 
 
 
344 aa  323  3e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0922  ketol-acid reductoisomerase  49.07 
 
 
330 aa  323  3e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  51.51 
 
 
341 aa  323  3e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  50.78 
 
 
330 aa  322  4e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3552  ketol-acid reductoisomerase  50.93 
 
 
330 aa  322  4e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.665615  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  48.77 
 
 
338 aa  322  5e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0220  ketol-acid reductoisomerase  52.65 
 
 
335 aa  322  6e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22789  normal  0.0211125 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2484  ketol-acid reductoisomerase  52.45 
 
 
333 aa  322  6e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000401864  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1680  ketol-acid reductoisomerase  49.07 
 
 
330 aa  321  8e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1245  ketol-acid reductoisomerase  51.41 
 
 
331 aa  322  8e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3489  ketol-acid reductoisomerase  50.77 
 
 
335 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2518  ketol-acid reductoisomerase  50.46 
 
 
338 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  49.22 
 
 
327 aa  320  9.999999999999999e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2819  ketol-acid reductoisomerase  48.92 
 
 
333 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1107  ketol-acid reductoisomerase  52.77 
 
 
335 aa  321  9.999999999999999e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  51.7 
 
 
337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3073  ketol-acid reductoisomerase  48.78 
 
 
338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0071293 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  49.23 
 
 
329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1747  ketol-acid reductoisomerase  48.3 
 
 
347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.322981 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  48.61 
 
 
338 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2121  ketol-acid reductoisomerase  49.69 
 
 
338 aa  320  3e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1905  ketol-acid reductoisomerase  51.39 
 
 
333 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  49.23 
 
 
329 aa  319  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0233  ketol-acid reductoisomerase  48.77 
 
 
330 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  48.3 
 
 
338 aa  318  6e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1122  ketol-acid reductoisomerase  49.55 
 
 
336 aa  318  6e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0870487  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0851  ketol-acid reductoisomerase  49.85 
 
 
330 aa  318  6e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1201  ketol-acid reductoisomerase  52.44 
 
 
335 aa  318  7e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.460879  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  53.73 
 
 
330 aa  318  7e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  48.3 
 
 
331 aa  318  7e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1966  ketol-acid reductoisomerase  52.12 
 
 
340 aa  318  7.999999999999999e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0065  ketol-acid reductoisomerase  51.54 
 
 
333 aa  318  9e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000348279  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1581  ketol-acid reductoisomerase  47.52 
 
 
340 aa  317  1e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2654  ketol-acid reductoisomerase  49.69 
 
 
344 aa  318  1e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  49.23 
 
 
329 aa  317  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0019  hypothetical protein  49.22 
 
 
346 aa  318  1e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  48.3 
 
 
338 aa  317  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4865  ketol-acid reductoisomerase  48.61 
 
 
338 aa  317  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3328  ketol-acid reductoisomerase  54.07 
 
 
324 aa  317  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.379867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>