More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3328 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3328  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
324 aa  660    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02605  ketol-acid reductoisomerase  87.5 
 
 
333 aa  585  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1201  ketol-acid reductoisomerase  83.07 
 
 
335 aa  561  1.0000000000000001e-159  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.460879  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1107  ketol-acid reductoisomerase  82.76 
 
 
335 aa  558  1e-158  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0290  ketol-acid reductoisomerase  64.06 
 
 
338 aa  413  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.233304 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  60.97 
 
 
331 aa  389  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  58.04 
 
 
329 aa  387  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 
331 aa  385  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1490  ketol-acid reductoisomerase  59.19 
 
 
339 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2418  ketol-acid reductoisomerase  59.62 
 
 
339 aa  385  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  58.71 
 
 
327 aa  381  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  58.68 
 
 
339 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  58.73 
 
 
331 aa  381  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  59.68 
 
 
331 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  58.04 
 
 
339 aa  380  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  55.87 
 
 
331 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3228  ketol-acid reductoisomerase  57.74 
 
 
337 aa  376  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  57.64 
 
 
338 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  56.83 
 
 
329 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7780  ketol-acid reductoisomerase  58.2 
 
 
331 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.543395 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3480  ketol-acid reductoisomerase  59.22 
 
 
341 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.161207  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  57.78 
 
 
331 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  58.1 
 
 
331 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  57.94 
 
 
339 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  56.83 
 
 
329 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  58.86 
 
 
339 aa  375  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0329  ketol-acid reductoisomerase  57.63 
 
 
339 aa  376  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  56.83 
 
 
329 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0285  ketol-acid reductoisomerase  57.63 
 
 
339 aa  376  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.772607  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4071  ketol-acid reductoisomerase  57.74 
 
 
342 aa  375  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3416  ketol-acid reductoisomerase  57.01 
 
 
339 aa  374  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6019  ketol-acid reductoisomerase  58.39 
 
 
337 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390752  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  59.03 
 
 
331 aa  372  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  55.14 
 
 
335 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  56.87 
 
 
337 aa  374  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2492  ketol-acid reductoisomerase  56.78 
 
 
339 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal  0.156046 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  58.2 
 
 
338 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0361  ketol-acid reductoisomerase  57.63 
 
 
339 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3341  ketol-acid reductoisomerase  57.23 
 
 
339 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.764687  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2102  ketol-acid reductoisomerase  56.6 
 
 
339 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2749  ketol-acid reductoisomerase  57.1 
 
 
339 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1496  ketol-acid reductoisomerase  55.97 
 
 
339 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0558834  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  56.45 
 
 
330 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1337  ketol-acid reductoisomerase  60.77 
 
 
342 aa  372  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1879  ketol-acid reductoisomerase  58.73 
 
 
342 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  56.37 
 
 
338 aa  371  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  56.92 
 
 
339 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  55.81 
 
 
330 aa  368  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  56.83 
 
 
331 aa  368  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1989  ketol-acid reductoisomerase  55.41 
 
 
338 aa  368  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  59.24 
 
 
338 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2559  ketol-acid reductoisomerase  57.55 
 
 
339 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  56.83 
 
 
329 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3248  ketol-acid reductoisomerase  56.29 
 
 
339 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167766  normal  0.961188 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  59.24 
 
 
338 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1519  ketol-acid reductoisomerase  58.75 
 
 
336 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  57.76 
 
 
344 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1310  ketol-acid reductoisomerase  58.75 
 
 
336 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1283  ketol-acid reductoisomerase  58.75 
 
 
336 aa  365  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1284  ketol-acid reductoisomerase  58.75 
 
 
336 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2778  ketol-acid reductoisomerase  55.84 
 
 
339 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  55.41 
 
 
330 aa  366  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1962  ketol-acid reductoisomerase  55.84 
 
 
339 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.971323  normal  0.40215 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  55.73 
 
 
330 aa  367  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42500  ketol-acid reductoisomerase  55.1 
 
 
338 aa  364  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1419  ketol-acid reductoisomerase  58.75 
 
 
336 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1902  ketol-acid reductoisomerase  58.1 
 
 
341 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.289546  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1976  ketol-acid reductoisomerase  58.1 
 
 
341 aa  364  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2857  ketol-acid reductoisomerase  57.63 
 
 
339 aa  364  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.658942  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0504  ketol-acid reductoisomerase  54.84 
 
 
338 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000262639  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  55.81 
 
 
338 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2767  ketol-acid reductoisomerase  54.95 
 
 
352 aa  367  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  55.81 
 
 
338 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1987  ketol-acid reductoisomerase  58.1 
 
 
341 aa  364  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1490  ketol-acid reductoisomerase  58.75 
 
 
336 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1468  ketol-acid reductoisomerase  56.13 
 
 
342 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000508699  normal  0.0138391 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0613  ketol-acid reductoisomerase  54.26 
 
 
331 aa  364  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398516  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  55.41 
 
 
338 aa  364  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1781  ketol-acid reductoisomerase  57.1 
 
 
339 aa  364  1e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  56.27 
 
 
338 aa  364  1e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2819  ketol-acid reductoisomerase  54.14 
 
 
333 aa  363  2e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1558  ketol-acid reductoisomerase  58.44 
 
 
336 aa  363  2e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1321  ketol-acid reductoisomerase  58.13 
 
 
336 aa  363  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6082  ketol-acid reductoisomerase  55.35 
 
 
339 aa  363  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2862  ketol-acid reductoisomerase  58.39 
 
 
333 aa  363  2e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1690  ketol-acid reductoisomerase  60 
 
 
331 aa  363  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300621  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  59.31 
 
 
330 aa  362  3e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  54.92 
 
 
330 aa  362  4e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  58.1 
 
 
330 aa  362  4e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0851  ketol-acid reductoisomerase  55.48 
 
 
330 aa  362  4e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2142  ketol-acid reductoisomerase  59.11 
 
 
340 aa  362  5.0000000000000005e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0716485  normal  0.0660754 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1452  ketol-acid reductoisomerase  58.13 
 
 
336 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  56.83 
 
 
338 aa  362  6e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3381  ketol-acid reductoisomerase  55.95 
 
 
339 aa  361  7.0000000000000005e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0410  ketol-acid reductoisomerase  56.47 
 
 
329 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0948  ketol-acid reductoisomerase  51.72 
 
 
340 aa  361  9e-99  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.525725  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2466  ketol-acid reductoisomerase  55.62 
 
 
339 aa  361  1e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498417  normal  0.4902 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3892  ketol-acid reductoisomerase  58.13 
 
 
336 aa  360  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3552  ketol-acid reductoisomerase  56.13 
 
 
330 aa  360  1e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.665615  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0903  ketol-acid reductoisomerase  54.31 
 
 
351 aa  361  1e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>