More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0290 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0290  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
338 aa  692    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.233304 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3328  ketol-acid reductoisomerase  65.81 
 
 
324 aa  433  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02605  ketol-acid reductoisomerase  64.54 
 
 
333 aa  430  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1107  ketol-acid reductoisomerase  63.55 
 
 
335 aa  426  1e-118  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1201  ketol-acid reductoisomerase  63.55 
 
 
335 aa  427  1e-118  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.460879  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  57.94 
 
 
329 aa  396  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  58.01 
 
 
331 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  55.56 
 
 
333 aa  385  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  56.35 
 
 
330 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  56.35 
 
 
327 aa  383  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  56.66 
 
 
338 aa  383  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2819  ketol-acid reductoisomerase  55.73 
 
 
333 aa  378  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  57.59 
 
 
331 aa  378  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0410  ketol-acid reductoisomerase  58.2 
 
 
329 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  57.28 
 
 
338 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  54.18 
 
 
331 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  54.97 
 
 
338 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  54.49 
 
 
331 aa  374  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  54.8 
 
 
331 aa  377  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0504  ketol-acid reductoisomerase  55.28 
 
 
338 aa  375  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000262639  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  55.28 
 
 
336 aa  376  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  54.35 
 
 
338 aa  375  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  54.49 
 
 
331 aa  374  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1690  ketol-acid reductoisomerase  58.57 
 
 
331 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300621  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  58.02 
 
 
330 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  56.66 
 
 
331 aa  373  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  55.11 
 
 
331 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0613  ketol-acid reductoisomerase  55.08 
 
 
331 aa  371  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398516  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  52.78 
 
 
335 aa  372  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2767  ketol-acid reductoisomerase  53.89 
 
 
352 aa  372  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  54.18 
 
 
329 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  54.18 
 
 
329 aa  371  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  56.21 
 
 
338 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3480  ketol-acid reductoisomerase  53.42 
 
 
341 aa  371  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.161207  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4071  ketol-acid reductoisomerase  55.9 
 
 
342 aa  374  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1496  ketol-acid reductoisomerase  55.25 
 
 
339 aa  371  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0558834  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  56.35 
 
 
338 aa  374  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  56.21 
 
 
338 aa  371  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0894  ketol-acid reductoisomerase  56.21 
 
 
338 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.331734  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  53.56 
 
 
340 aa  369  1e-101  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0747  ketol-acid reductoisomerase  56.21 
 
 
338 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  54.18 
 
 
331 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1242  ketol-acid reductoisomerase  54.01 
 
 
340 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3381  ketol-acid reductoisomerase  54.8 
 
 
339 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0611  ketol-acid reductoisomerase  54.49 
 
 
339 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194417  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  55.11 
 
 
339 aa  368  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  52.96 
 
 
330 aa  368  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1020  ketol-acid reductoisomerase  58.82 
 
 
331 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.488917 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0013  ketol-acid reductoisomerase  56.04 
 
 
331 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86609  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0991  ketol-acid reductoisomerase  58.82 
 
 
331 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  53.87 
 
 
329 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6019  ketol-acid reductoisomerase  54.97 
 
 
337 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390752  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1468  ketol-acid reductoisomerase  54.97 
 
 
342 aa  368  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000508699  normal  0.0138391 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1127  ketol-acid reductoisomerase  53.85 
 
 
340 aa  369  1e-101  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2559  ketol-acid reductoisomerase  55.05 
 
 
339 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  52.5 
 
 
330 aa  368  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  53.25 
 
 
331 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  52.32 
 
 
340 aa  366  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1490  ketol-acid reductoisomerase  53.21 
 
 
339 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2749  ketol-acid reductoisomerase  54.49 
 
 
339 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2418  ketol-acid reductoisomerase  54.49 
 
 
339 aa  366  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0903  ketol-acid reductoisomerase  53.27 
 
 
351 aa  367  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1989  ketol-acid reductoisomerase  54.35 
 
 
338 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2246  ketol-acid reductoisomerase  53.21 
 
 
339 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  56.04 
 
 
336 aa  365  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0636  ketol-acid reductoisomerase  54.97 
 
 
338 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2492  ketol-acid reductoisomerase  54.18 
 
 
339 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal  0.156046 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  56.97 
 
 
330 aa  365  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1780  ketol-acid reductoisomerase  54.49 
 
 
338 aa  366  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  56.66 
 
 
344 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  54.04 
 
 
338 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4335  ketol-acid reductoisomerase  56.04 
 
 
331 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  54.18 
 
 
329 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0173  ketol-acid reductoisomerase  56.04 
 
 
331 aa  364  1e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0948  ketol-acid reductoisomerase  52.8 
 
 
340 aa  364  1e-99  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.525725  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3011  ketol-acid reductoisomerase  53.66 
 
 
339 aa  364  1e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186602 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1367  ketol-acid reductoisomerase  52.63 
 
 
340 aa  364  1e-99  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.845865  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1905  ketol-acid reductoisomerase  57.28 
 
 
333 aa  364  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1310  ketol-acid reductoisomerase  58.28 
 
 
336 aa  363  2e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  54.35 
 
 
338 aa  363  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1419  ketol-acid reductoisomerase  58.28 
 
 
336 aa  363  2e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1337  ketol-acid reductoisomerase  56.66 
 
 
342 aa  363  2e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  53.42 
 
 
337 aa  363  2e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1962  ketol-acid reductoisomerase  53.56 
 
 
339 aa  363  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.971323  normal  0.40215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1343  ketol-acid reductoisomerase  56.35 
 
 
331 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2539  ketol-acid reductoisomerase  54.8 
 
 
338 aa  363  3e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0383173  hitchhiker  0.00121107 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0867  ketol-acid reductoisomerase  55.28 
 
 
340 aa  363  3e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7780  ketol-acid reductoisomerase  54.77 
 
 
331 aa  363  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.543395 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2166  ketol-acid reductoisomerase  56.39 
 
 
329 aa  362  4e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1490  ketol-acid reductoisomerase  57.98 
 
 
336 aa  362  4e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0225  ketol-acid reductoisomerase  58.39 
 
 
330 aa  362  4e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.677869  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  57.14 
 
 
341 aa  362  4e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0524  ketol-acid reductoisomerase  54.66 
 
 
338 aa  362  4e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.181387  normal  0.0101595 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1472  ketol-acid reductoisomerase  53.33 
 
 
346 aa  362  4e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6082  ketol-acid reductoisomerase  52.6 
 
 
339 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2501  ketol-acid reductoisomerase  54.04 
 
 
338 aa  362  6e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000349706  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  52.81 
 
 
330 aa  362  6e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10850  ketol-acid reductoisomerase  55.11 
 
 
330 aa  362  7.0000000000000005e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0529  ketol-acid reductoisomerase  54.66 
 
 
338 aa  361  8e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0228  ketol-acid reductoisomerase  57.96 
 
 
332 aa  361  8e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000772212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>