More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1168 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1168  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
328 aa  660    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.528024  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1722  ketol-acid reductoisomerase  70.15 
 
 
328 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.801354  normal  0.0124349 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1541  ketol-acid reductoisomerase  68.62 
 
 
327 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0552  ketol-acid reductoisomerase  67.69 
 
 
331 aa  433  1e-120  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00831363 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1755  ketol-acid reductoisomerase  67.08 
 
 
328 aa  427  1e-118  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000701523 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1641  ketol-acid reductoisomerase  55.18 
 
 
335 aa  377  1e-103  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.75245  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1927  ketol-acid reductoisomerase  57.45 
 
 
335 aa  358  5e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  52.32 
 
 
329 aa  353  2e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2142  ketol-acid reductoisomerase  54.94 
 
 
340 aa  346  3e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0716485  normal  0.0660754 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  54.52 
 
 
330 aa  346  4e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3480  ketol-acid reductoisomerase  50.31 
 
 
341 aa  345  6e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.161207  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1590  ketol-acid reductoisomerase  51.38 
 
 
330 aa  343  2.9999999999999997e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  53.73 
 
 
330 aa  342  4e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1902  ketol-acid reductoisomerase  54.04 
 
 
330 aa  340  2e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  52.96 
 
 
330 aa  337  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1907  ketol-acid reductoisomerase  53.4 
 
 
339 aa  338  9.999999999999999e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.022886  hitchhiker  0.0000179587 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0873  ketol-acid reductoisomerase  50.62 
 
 
351 aa  334  1e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2172  ketol-acid reductoisomerase  53.42 
 
 
330 aa  332  6e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  52.68 
 
 
337 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0188  ketol-acid reductoisomerase  48.92 
 
 
335 aa  331  1e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0851  ketol-acid reductoisomerase  52.17 
 
 
330 aa  330  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  51.24 
 
 
330 aa  329  3e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0504  ketol-acid reductoisomerase  50.46 
 
 
333 aa  329  4e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.450267  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  50.46 
 
 
338 aa  328  6e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  52.47 
 
 
341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1245  ketol-acid reductoisomerase  50 
 
 
331 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1178  ketol-acid reductoisomerase  49.84 
 
 
326 aa  327  2.0000000000000001e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  52.16 
 
 
341 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2767  ketol-acid reductoisomerase  50.77 
 
 
352 aa  326  4.0000000000000003e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0959  ketol-acid reductoisomerase  47.55 
 
 
332 aa  324  1e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00572985 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1716  ketol-acid reductoisomerase  51.55 
 
 
335 aa  323  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1853  ketol-acid reductoisomerase  51.86 
 
 
335 aa  323  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1852  ketol-acid reductoisomerase  51.55 
 
 
335 aa  323  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0903  ketol-acid reductoisomerase  50.46 
 
 
351 aa  323  2e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0693  ketol-acid reductoisomerase  49.23 
 
 
336 aa  323  2e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1890  ketol-acid reductoisomerase  51.55 
 
 
335 aa  323  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  48.61 
 
 
338 aa  323  3e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0602  ketol-acid reductoisomerase  52.78 
 
 
330 aa  323  3e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0492028 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1709  ketol-acid reductoisomerase  51.86 
 
 
337 aa  322  4e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1968  ketol-acid reductoisomerase  51.55 
 
 
335 aa  322  4e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2819  ketol-acid reductoisomerase  50.77 
 
 
333 aa  322  5e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1545  ketol-acid reductoisomerase  48 
 
 
340 aa  322  6e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.159876  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1693  ketol-acid reductoisomerase  51.24 
 
 
335 aa  322  7e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1558  ketol-acid reductoisomerase  51.23 
 
 
336 aa  322  7e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4071  ketol-acid reductoisomerase  50.93 
 
 
342 aa  321  9.000000000000001e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1936  ketol-acid reductoisomerase  51.55 
 
 
335 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  48.92 
 
 
329 aa  321  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  48.62 
 
 
329 aa  321  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  48.62 
 
 
329 aa  320  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1519  ketol-acid reductoisomerase  51.23 
 
 
336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1283  ketol-acid reductoisomerase  51.23 
 
 
336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1284  ketol-acid reductoisomerase  51.23 
 
 
336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3489  ketol-acid reductoisomerase  51.24 
 
 
335 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1668  ketol-acid reductoisomerase  51.55 
 
 
335 aa  319  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  48.92 
 
 
331 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  48 
 
 
331 aa  319  3.9999999999999996e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  47.69 
 
 
331 aa  319  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  48.62 
 
 
331 aa  319  5e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  48.62 
 
 
329 aa  318  6e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1321  ketol-acid reductoisomerase  50.93 
 
 
336 aa  318  6e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  48 
 
 
331 aa  318  7e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  50.15 
 
 
338 aa  318  7.999999999999999e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6019  ketol-acid reductoisomerase  49.85 
 
 
337 aa  318  9e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390752  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  47.69 
 
 
331 aa  318  1e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3552  ketol-acid reductoisomerase  50.15 
 
 
330 aa  317  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.665615  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1310  ketol-acid reductoisomerase  51.23 
 
 
336 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1419  ketol-acid reductoisomerase  51.23 
 
 
336 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  51.39 
 
 
330 aa  317  2e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1107  ketol-acid reductoisomerase  50.65 
 
 
335 aa  317  2e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1668  ketol-acid reductoisomerase  50.31 
 
 
334 aa  316  3e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1452  ketol-acid reductoisomerase  50.62 
 
 
336 aa  316  3e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4447  ketol-acid reductoisomerase  50.46 
 
 
337 aa  316  3e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1490  ketol-acid reductoisomerase  50.93 
 
 
336 aa  316  3e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0410  ketol-acid reductoisomerase  50.77 
 
 
329 aa  316  4e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  50.15 
 
 
330 aa  316  4e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  47.69 
 
 
331 aa  315  6e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3892  ketol-acid reductoisomerase  50.62 
 
 
336 aa  315  6e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2319  ketol-acid reductoisomerase  49.23 
 
 
338 aa  314  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1201  ketol-acid reductoisomerase  50.33 
 
 
335 aa  314  9.999999999999999e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.460879  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3563  ketol-acid reductoisomerase  47.99 
 
 
330 aa  314  9.999999999999999e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0252536  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  48.92 
 
 
338 aa  314  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1122  ketol-acid reductoisomerase  50 
 
 
336 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0870487  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  51.69 
 
 
331 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2654  ketol-acid reductoisomerase  50.31 
 
 
344 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  48.62 
 
 
331 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13016  ketol-acid reductoisomerase  49.38 
 
 
333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00176679  normal  0.164078 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3228  ketol-acid reductoisomerase  48.92 
 
 
337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2775  ketol-acid reductoisomerase  48.92 
 
 
338 aa  312  4.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.987552  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0387  ketol-acid reductoisomerase  51.38 
 
 
336 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0065  ketol-acid reductoisomerase  52.31 
 
 
333 aa  312  5.999999999999999e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000348279  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  51.69 
 
 
330 aa  312  5.999999999999999e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3328  ketol-acid reductoisomerase  50.16 
 
 
324 aa  311  6.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10850  ketol-acid reductoisomerase  49.85 
 
 
330 aa  311  9e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0225  ketol-acid reductoisomerase  53.25 
 
 
330 aa  311  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.677869  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02605  ketol-acid reductoisomerase  50.33 
 
 
333 aa  311  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3110  ketol-acid reductoisomerase  47.99 
 
 
338 aa  311  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090046  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  48.92 
 
 
338 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0370  ketol-acid reductoisomerase  51.38 
 
 
336 aa  310  2e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1242  ketol-acid reductoisomerase  48 
 
 
340 aa  310  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0228  ketol-acid reductoisomerase  53.23 
 
 
332 aa  310  2e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000772212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>