More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1178 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1178  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 
326 aa  669    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1245  ketol-acid reductoisomerase  57.1 
 
 
331 aa  364  1e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1660  ketol-acid reductoisomerase  55.86 
 
 
329 aa  363  1e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0738  ketol-acid reductoisomerase  55.25 
 
 
337 aa  358  9e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137896  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1552  ketol-acid reductoisomerase  55.28 
 
 
327 aa  357  9.999999999999999e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.524606  normal  0.100511 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0839  ketol-acid reductoisomerase  54.35 
 
 
331 aa  357  1.9999999999999998e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.528098  hitchhiker  0.00311805 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1550  ketol-acid reductoisomerase  54.04 
 
 
331 aa  356  2.9999999999999997e-97  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  53.4 
 
 
338 aa  355  5e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  53.7 
 
 
338 aa  354  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2142  ketol-acid reductoisomerase  53.23 
 
 
340 aa  353  2e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0716485  normal  0.0660754 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1875  ketol-acid reductoisomerase  55.9 
 
 
331 aa  353  2e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000873272 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20051  ketol-acid reductoisomerase  53.42 
 
 
331 aa  351  8e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.337535 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  52.78 
 
 
338 aa  351  8e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1968  ketol-acid reductoisomerase  54.8 
 
 
335 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2227  ketol-acid reductoisomerase  54.83 
 
 
344 aa  348  5e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0602  ketol-acid reductoisomerase  54.71 
 
 
330 aa  348  8e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0492028 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1936  ketol-acid reductoisomerase  54.49 
 
 
335 aa  348  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1716  ketol-acid reductoisomerase  54.49 
 
 
335 aa  347  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1693  ketol-acid reductoisomerase  54.49 
 
 
335 aa  347  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1890  ketol-acid reductoisomerase  54.49 
 
 
335 aa  347  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1852  ketol-acid reductoisomerase  54.49 
 
 
335 aa  347  1e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  52.78 
 
 
338 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1680  ketol-acid reductoisomerase  53.87 
 
 
330 aa  347  2e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1907  ketol-acid reductoisomerase  52.31 
 
 
339 aa  347  2e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.022886  hitchhiker  0.0000179587 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0283  ketol-acid reductoisomerase  51.55 
 
 
330 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1853  ketol-acid reductoisomerase  53.87 
 
 
335 aa  346  3e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0481  ketol-acid reductoisomerase  56.04 
 
 
329 aa  346  3e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.495995  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0354  ketol-acid reductoisomerase  58.02 
 
 
341 aa  346  3e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0922  ketol-acid reductoisomerase  53.87 
 
 
330 aa  346  3e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1709  ketol-acid reductoisomerase  53.87 
 
 
337 aa  346  3e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2166  ketol-acid reductoisomerase  55.56 
 
 
329 aa  345  4e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.889331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3489  ketol-acid reductoisomerase  53.87 
 
 
335 aa  346  4e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3110  ketol-acid reductoisomerase  50.62 
 
 
338 aa  345  4e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090046  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0133  ketol-acid reductoisomerase  54.97 
 
 
331 aa  345  5e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1702  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1719  ketol-acid reductoisomerase  50.93 
 
 
330 aa  345  5e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.401294 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0881  ketol-acid reductoisomerase  53.11 
 
 
331 aa  345  6e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.785072  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1747  ketol-acid reductoisomerase  49.69 
 
 
347 aa  345  6e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.322981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1951  ketol-acid reductoisomerase  50.31 
 
 
338 aa  345  7e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1771  ketol-acid reductoisomerase  50.31 
 
 
338 aa  345  7e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.09387  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0225  ketol-acid reductoisomerase  56.17 
 
 
330 aa  344  1e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.677869  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15141  ketol-acid reductoisomerase  53.42 
 
 
329 aa  344  1e-93  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.296105  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  51.85 
 
 
338 aa  344  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  52.16 
 
 
338 aa  344  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17361  ketol-acid reductoisomerase  53.11 
 
 
331 aa  344  1e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1668  ketol-acid reductoisomerase  54.18 
 
 
335 aa  343  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2121  ketol-acid reductoisomerase  51.54 
 
 
338 aa  343  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2319  ketol-acid reductoisomerase  51.85 
 
 
338 aa  343  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0233  ketol-acid reductoisomerase  53.87 
 
 
330 aa  343  2e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15011  ketol-acid reductoisomerase  53.11 
 
 
329 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13631  ketol-acid reductoisomerase  52.8 
 
 
331 aa  343  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.095723  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2051  ketol-acid reductoisomerase  53.42 
 
 
331 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  51.54 
 
 
338 aa  342  4e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1343  ketol-acid reductoisomerase  54.66 
 
 
331 aa  342  5e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1412  ketol-acid reductoisomerase  53.11 
 
 
329 aa  342  5.999999999999999e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1175  ketol-acid reductoisomerase  52.94 
 
 
329 aa  342  7e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.273491  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0604  ketol-acid reductoisomerase  52.16 
 
 
330 aa  341  8e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0593  ketol-acid reductoisomerase  52.47 
 
 
331 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000142163  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0343  ketol-acid reductoisomerase  54.04 
 
 
331 aa  340  2e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2594  ketol-acid reductoisomerase  53.89 
 
 
341 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2172  ketol-acid reductoisomerase  54.86 
 
 
329 aa  340  2e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  51.23 
 
 
338 aa  339  2.9999999999999998e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4865  ketol-acid reductoisomerase  50.93 
 
 
338 aa  339  4e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0082  ketol-acid reductoisomerase  53.85 
 
 
331 aa  339  4e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.562426  normal  0.207631 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0858  ketol-acid reductoisomerase  54.21 
 
 
341 aa  339  4e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  50.31 
 
 
338 aa  338  8e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0155  ketol-acid reductoisomerase  54.01 
 
 
330 aa  338  9e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166453 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3106  ketol-acid reductoisomerase  52.8 
 
 
345 aa  338  9e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1193  ketol-acid reductoisomerase  53.87 
 
 
334 aa  338  9e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0983  ketol-acid reductoisomerase  52.47 
 
 
338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.900438  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0848  ketol-acid reductoisomerase  52.78 
 
 
338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.385412  hitchhiker  0.00438995 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3073  ketol-acid reductoisomerase  50.62 
 
 
338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0071293 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0524  ketol-acid reductoisomerase  50.93 
 
 
338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.181387  normal  0.0101595 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1848  ketol-acid reductoisomerase  56.27 
 
 
340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2484  ketol-acid reductoisomerase  55.9 
 
 
333 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000401864  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0529  ketol-acid reductoisomerase  50.93 
 
 
338 aa  336  2.9999999999999997e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1902  ketol-acid reductoisomerase  51.23 
 
 
330 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  50.62 
 
 
338 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0741  ketol-acid reductoisomerase  51.23 
 
 
330 aa  336  2.9999999999999997e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0812  ketol-acid reductoisomerase  50.93 
 
 
338 aa  336  3.9999999999999995e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2775  ketol-acid reductoisomerase  50.62 
 
 
338 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.987552  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1061  ketol-acid reductoisomerase  50.93 
 
 
338 aa  335  3.9999999999999995e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1538  ketol-acid reductoisomerase  51.39 
 
 
330 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1330  ketol-acid reductoisomerase  52.16 
 
 
338 aa  335  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1009  ketol-acid reductoisomerase  52.47 
 
 
338 aa  335  5e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0031773  hitchhiker  0.000000327544 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2466  ketol-acid reductoisomerase  51.69 
 
 
339 aa  335  5.999999999999999e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498417  normal  0.4902 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2749  ketol-acid reductoisomerase  52 
 
 
339 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3341  ketol-acid reductoisomerase  51.69 
 
 
339 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.764687  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0504  ketol-acid reductoisomerase  50 
 
 
338 aa  335  7e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000262639  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14761  ketol-acid reductoisomerase  51.86 
 
 
329 aa  335  7e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4786  ketol-acid reductoisomerase  52.16 
 
 
338 aa  334  9e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  hitchhiker  0.00823723 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1780  ketol-acid reductoisomerase  51.23 
 
 
338 aa  334  1e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5590  ketol-acid reductoisomerase  51.85 
 
 
338 aa  334  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1350  ketol-acid reductoisomerase  54.66 
 
 
330 aa  334  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.276225  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0285  ketol-acid reductoisomerase  51.08 
 
 
339 aa  334  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.772607  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5408  ketol-acid reductoisomerase  50.93 
 
 
338 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0737176  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62130  ketol-acid reductoisomerase  50.93 
 
 
338 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0371578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0329  ketol-acid reductoisomerase  51.08 
 
 
339 aa  334  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1690  ketol-acid reductoisomerase  54.94 
 
 
331 aa  334  1e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300621  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  51.38 
 
 
339 aa  334  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3020  ketol-acid reductoisomerase  54.66 
 
 
336 aa  333  2e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000242382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>