178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1561 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1561  integrase family protein  100 
 
 		 51 aa  104  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.744985  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1514  integrase family protein  91.49 
 
 		 423 aa  90.9  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1693  integrase family protein  93.62 
 
 		 423 aa  90.5  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0979  site-specific recombinase, phage integrase family protein  76.6 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000444866  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2104  phage integrase family site specific recombinase  78.72 
 
 		 420 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000885987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2185  integrase  61.7 
 
 		 100 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2095  integrase  59.57 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2118  IntB  59.57 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376506  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  64.44 
 
 		 398 aa  67  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3034  integrase family protein  57.78 
 
 		 419 aa  60.1  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  57.78 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0478  integrase family protein  51.06 
 
 		 427 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  53.19 
 
 		 418 aa  58.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3537  integrase family protein  55.56 
 
 		 419 aa  58.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  53.19 
 
 		 418 aa  58.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  53.19 
 
 		 419 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  54.55 
 
 		 420 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  53.19 
 
 		 419 aa  57.8  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0447  integrase family protein  53.19 
 
 		 419 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  54.55 
 
 		 421 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4272  site-specific recombinase, phage integrase family protein  54.55 
 
 		 421 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4662  site-specific recombinase, phage integrase family protein  54.55 
 
 		 334 aa  57.4  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0310  integrase  57.45 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0285947  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0676  phage integrase family site specific recombinase  48.94 
 
 		 303 aa  57  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.825642  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2305  integrase  51.06 
 
 		 424 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000673705  hitchhiker  1.06104e-16 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  52.27 
 
 		 420 aa  57  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3419  integrase family protein  55.56 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.837092  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1586  integrase family protein  53.19 
 
 		 425 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.97396  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  60.47 
 
 		 404 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1766  integrase family protein  53.19 
 
 		 425 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0264741  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0501  integrase family protein  55.56 
 
 		 419 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1727  integrase family protein  48.94 
 
 		 425 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2068  integrase  48.94 
 
 		 424 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306631  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  51.06 
 
 		 420 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0136  hypothetical protein  51.06 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  48.94 
 
 		 419 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4839  hypothetical protein  48.94 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115788  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0858  integrase family protein  53.33 
 
 		 419 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2459  integrase family protein  51.06 
 
 		 428 aa  53.9  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3676  integrase family protein  48.94 
 
 		 421 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329272  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  51.06 
 
 		 406 aa  53.9  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1811  hypothetical protein  52.94 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.47307 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  42.55 
 
 		 404 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  44.68 
 
 		 402 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  44.68 
 
 		 404 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  48.94 
 
 		 406 aa  52  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  44.68 
 
 		 404 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02760  hypothetical protein  50 
 
 		 319 aa  52  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000757589  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  46.67 
 
 		 421 aa  51.6  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  46.81 
 
 		 421 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3540  phage integrase family site specific recombinase  46.81 
 
 		 411 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000292707  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  51.06 
 
 		 397 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  52.27 
 
 		 440 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2887  phage integrase family protein  46.81 
 
 		 416 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.416458  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  51.06 
 
 		 401 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5244  hypothetical protein  48.94 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  53.49 
 
 		 395 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  44.68 
 
 		 404 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  53.19 
 
 		 414 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2106  integrase  44.19 
 
 		 272 aa  50.1  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  44.44 
 
 		 438 aa  50.1  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4097  phage integrase family site specific recombinase  45.83 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  45.83 
 
 		 402 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  46.81 
 
 		 403 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  51.16 
 
 		 413 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  47.92 
 
 		 401 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0809  phage integrase family site specific recombinase  48.84 
 
 		 419 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  48.94 
 
 		 404 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  44.68 
 
 		 421 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  48.94 
 
 		 404 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  48.94 
 
 		 404 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  45.83 
 
 		 397 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  48.94 
 
 		 404 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  42.55 
 
 		 422 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  48.84 
 
 		 367 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  44.19 
 
 		 404 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  46.81 
 
 		 394 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5797  prophage P4 integrase  42.55 
 
 		 275 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.264973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0444  phage integrase  40.43 
 
 		 417 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.159341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  42.55 
 
 		 404 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  44.19 
 
 		 404 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  42.55 
 
 		 404 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  42.55 
 
 		 407 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  45.1 
 
 		 389 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2310  hypothetical protein  48.89 
 
 		 268 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300752  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  46.81 
 
 		 402 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  40.43 
 
 		 417 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  42.55 
 
 		 394 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  46.81 
 
 		 405 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  48.84 
 
 		 410 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  42.55 
 
 		 394 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  51.06 
 
 		 445 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  44.19 
 
 		 462 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  46.51 
 
 		 411 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  42.55 
 
 		 419 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3701  phage integrase  46.51 
 
 		 276 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2014  phage integrase  48.89 
 
 		 416 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1764  hypothetical protein  42.22 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  43.48 
 
 		 429 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  50 
 
 		 408 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>